Imprinted Gene Databases

Rattus norvegicus: Slc38a4

Solute carrier family 38, member 4

Albert et al, Genome Biol, 24: 48, 2023

Species Gene Aliases Location Status Expressed Allele
Homo sapiens SLC38A4 ATA3, NAT3, PAAT, FLJ10191, MGC126876  12q13  Unknown Unknown
Mus musculus Slc38a4 At, SN, Ata3, SNAT4, mATA3, mNAT3, 1110012E16Rik, 1700012A18Rik  15  Imprinted Paternal
Rattus norvegicus Slc38a4 Ata3  7q35  Imprinted Paternal
Sus scrofa SLC38A4   Imprinted Isoform Dependent
Bos taurus SLC38A4 Ata3  Not Imprinted Biallelic
1      aggatggaaatttccactctttaggaagcgtaaagaaaagaaggaagggtctctcactct     60
       ............................................................
61     cacccttgccgccacatccattggattccaacccgaagaaggtagaggcgggaaagggct    120
       ............................................................
121    gtgaggtcaaATGGACCCCATAGAACTGAGAAGTGTCAACATCGAACCATACGAGGACAG    180
       ..........M--D--P--I--E--L--R--S--V--N--I--E--P--Y--E--D--S-
181    CTGCAGCGTGGATAGCATTCAAAGCTGCTACACCGGGATGGGGAACTCCGAGAAGGGAGC    240
       -C--S--V--D--S--I--Q--S--C--Y--T--G--M--G--N--S--E--K--G--A-
241    CATGGACAGTCAATTTGCTAATGAAGATGCCGAAAGTCAGAAGTTCCTGACGAATGGCTT    300
       -M--D--S--Q--F--A--N--E--D--A--E--S--Q--K--F--L--T--N--G--F-
301    TTTGGGGAAGAAGACGCTAACCGATTACGCGGATGAGCACCACCCTGGAACGACCTCTTT    360
       -L--G--K--K--T--L--T--D--Y--A--D--E--H--H--P--G--T--T--S--F-
361    TGGAATGTCCTCCTTTAACCTGAGTAACGCCATCATGGGCAGTGGTATCTTGGGCTTGTC    420
       -G--M--S--S--F--N--L--S--N--A--I--M--G--S--G--I--L--G--L--S-
421    CTACGCCATGGCCAACACGGGGATCGTCCTTTTTGTAATCATGCTTCTTACTGTGGCAAT    480
       -Y--A--M--A--N--T--G--I--V--L--F--V--I--M--L--L--T--V--A--I-
481    TCTATCGCTCTACTCGGTTCACCTTTTACTGAAGACAGCCAAGGAAGGAGGGTCTTTGAT    540
       -L--S--L--Y--S--V--H--L--L--L--K--T--A--K--E--G--G--S--L--I-
541    CTATGAAAAGTTGGGAGAGAAGGCGTTTGGATGGCCTGGGAAAATTGGAGCCTTTATCTC    600
       -Y--E--K--L--G--E--K--A--F--G--W--P--G--K--I--G--A--F--I--S-
601    TATTACAATGCAGAACATTGGAGCCATGTCAAGCTACCTCTTCATCATTAAGTACGAGCT    660
       -I--T--M--Q--N--I--G--A--M--S--S--Y--L--F--I--I--K--Y--E--L-
661    GCCTGAAGTGATCAGAGTGTTCATGGGACTTGAAGAAAACACTGGGGAGTGGTACCTCAA    720
       -P--E--V--I--R--V--F--M--G--L--E--E--N--T--G--E--W--Y--L--N-
721    TGGCAACTACCTCGTCTTATTTGTGTCCGTGGGGATCATCCTACCACTCTCTCTCCTTAA    780
       -G--N--Y--L--V--L--F--V--S--V--G--I--I--L--P--L--S--L--L--K-
781    AAATTTAGGCTACCTTGGCTACACCAGTGGATTTTCCCTCACCTGCATGGTGTTTTTCGT    840
       -N--L--G--Y--L--G--Y--T--S--G--F--S--L--T--C--M--V--F--F--V-
841    CAGTGTGGTGATTTACAAAAAGTTCCAAATACCCTGCCCTCTGCCTGTTCTGGATCACAA    900
       -S--V--V--I--Y--K--K--F--Q--I--P--C--P--L--P--V--L--D--H--N-
901    TAACGGGAACCTGACGTTCAACAACACACTTCCCATGCACGTGATCATGCTACCCAATAA    960
       -N--G--N--L--T--F--N--N--T--L--P--M--H--V--I--M--L--P--N--N-
961    CTCGGAGAGCACGGGCATGAACTTCATGGTGGACTACACTCACCGAGACCCGGAAGGGCT   1020
       -S--E--S--T--G--M--N--F--M--V--D--Y--T--H--R--D--P--E--G--L-
1021   GGATGAGAAGCCAGCCGCAGGCCCTCTTCACGGCAGTGGTGTGGAGTACGAAGCCCACAG   1080
       -D--E--K--P--A--A--G--P--L--H--G--S--G--V--E--Y--E--A--H--S-
1081   TGGGGACAAATGTCAACCCAAGTACTTTGTATTCAATTCCCGCACGGCCTACGCGATTCC   1140
       -G--D--K--C--Q--P--K--Y--F--V--F--N--S--R--T--A--Y--A--I--P-
1141   AATCCTGGCGTTTGCTTTCGTCTGCCACCCTGAGGTCCTTCCCATCTACAGCGAGCTTAA   1200
       -I--L--A--F--A--F--V--C--H--P--E--V--L--P--I--Y--S--E--L--K-
1201   GGATCGGTCCCGGAGAAAGATGCAGACGGTGTCCAATATTTCCATTACCGGGATGCTCGT   1260
       -D--R--S--R--R--K--M--Q--T--V--S--N--I--S--I--T--G--M--L--V-
1261   CATGTACCTGCTTGCTGCGCTCTTTGGCTATCTAAGCTTCTACGGGGAAGTTGAGGACGA   1320
       -M--Y--L--L--A--A--L--F--G--Y--L--S--F--Y--G--E--V--E--D--E-
1321   GTTGCTCCATGCCTACAGTAAAGTCTACACATTTGATACAGCTCTTCTCATGGTACGCCT   1380
       -L--L--H--A--Y--S--K--V--Y--T--F--D--T--A--L--L--M--V--R--L-
1381   GGCAGTGCTGGTGGCGGTGACACTGACTGTGCCCATCGTCCTGTTCCCCATCCGTACTTC   1440
       -A--V--L--V--A--V--T--L--T--V--P--I--V--L--F--P--I--R--T--S-
1441   AGTGATCACACTGCTGTTTCCAAGAAGACCCTTCAGCTGGGTGAAGCATTTCGGGATCGC   1500
       -V--I--T--L--L--F--P--R--R--P--F--S--W--V--K--H--F--G--I--A-
1501   TGCAATCATCATCGCTCTCAACAACGTCCTGGTCATCCTCGTGCCTACCATCAAATACAT   1560
       -A--I--I--I--A--L--N--N--V--L--V--I--L--V--P--T--I--K--Y--I-
1561   CTTTGGATTCATAGGGGCTTCTTCTGCCACCATGCTGATTTTCATTCTTCCGGCAGCTTT   1620
       -F--G--F--I--G--A--S--S--A--T--M--L--I--F--I--L--P--A--A--F-
1621   TTATCTCAAGCTTGTCAAGAAAGAACCCCTTCGATCACCCCAAAAGATTGGGGCTTTGGT   1680
       -Y--L--K--L--V--K--K--E--P--L--R--S--P--Q--K--I--G--A--L--V-
1681   CTTCCTCGTGACTGGAATTATCTTCATGATGGGAAGCATGGCGCTCATTATAATCGACTG   1740
       -F--L--V--T--G--I--I--F--M--M--G--S--M--A--L--I--I--I--D--W-
1741   GATTTACAACCCTCCAAATCCCGACCACCACTAAtccttgggggggatgctcttctattg   1800
       -I--Y--N--P--P--N--P--D--H--H--***..........................
1801   gaaacggccgacattatggtctgaaggacactttagttgtcttggttgggatgttagtct   1860
       ............................................................
1861   gaggaattaacgagattccgaagacattttctagctctatcatctgacgcatgtgaaaaa   1920
       ............................................................
1921   aaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaa                                     1980
       ..........................