Imprinted Gene Databases

Sus scrofa: RB1

RB transcriptional corepressor 1

Ahn et al. J Anim Sci 101: skad367, 2023

Species Gene Aliases Location Status Expressed Allele
Homo sapiens RB1 RB, pRb, OSRC, pp110, p105-Rb, PPP1R130, p110-RB1  13q14.2  Imprinted Paternal
Mus musculus Rb1 Rb, pRb, Rb-1  14 41.0 cM  Not Imprinted Biallelic
Sus scrofa RB1   11  Not Imprinted Biallelic
1      gtccggtttttctcaggggacgttcaaattatttttgtaacgggagtcgggagaggacgg     60
       ............................................................
61     ggcgtgccctgacgtgcgcgtgtcctcctgccccggccctccttcagcgctcgccggcac    120
       ............................................................
121    cggccctgggagggcgtcATGCCGCCCAAAACCCCCCGGAGAGCAGCCGCCGCCGCCGCC    180
       ..................M--P--P--K--T--P--R--R--A--A--A--A--A--A--
181    GCCGCCGCCGCTGCTGCTGCGGAGCCCCCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGCCACCG    240
       A--A--A--A--A--A--A--E--P--P--P--P--P--P--P--P--P--P--P--P--
241    CCGCCACCGCAGCCTGAGGAGGACCCCGAGCAGGACAGCGGCCCCGAGGACCTGCCTCTG    300
       P--P--P--Q--P--E--E--D--P--E--Q--D--S--G--P--E--D--L--P--L--
301    GTCAGGCTTGCATTTGAAGAAACTGAAGAACCTGATTTTACTACATTATGTCAGAAATTA    360
       V--R--L--A--F--E--E--T--E--E--P--D--F--T--T--L--C--Q--K--L--
361    AAGATAGCAGATCATGTCAGAGAAAGAGCTTGGTTAACTTGGGAGAAAGTTTCATCTGTG    420
       K--I--A--D--H--V--R--E--R--A--W--L--T--W--E--K--V--S--S--V--
421    GATGGAGTATTGGAAGGTCATATTCAAAAGAAAAAGGAACTGTGGGGAATCTGTATCTTT    480
       D--G--V--L--E--G--H--I--Q--K--K--K--E--L--W--G--I--C--I--F--
481    ATTGCAGCAGTTGACCTAGATGAAATGCCATTCACCTTCACTGAGCTGCAGAAAAACATT    540
       I--A--A--V--D--L--D--E--M--P--F--T--F--T--E--L--Q--K--N--I--
541    GACATCAGTGTCTATAAATTCTTTGACTTATTGAAAGAAATTGATACCAGTACCAAAGTT    600
       D--I--S--V--Y--K--F--F--D--L--L--K--E--I--D--T--S--T--K--V--
601    GATAATGCTATGTCAAAACTGTTGAAGAAGTATAATGTATTGTGTGCACTCTACAGCAAA    660
       D--N--A--M--S--K--L--L--K--K--Y--N--V--L--C--A--L--Y--S--K--
661    TTAGAAAGGACATGTGAACTTATATATTTGTCACAACCCAGCAGTTCAATATCTACTGAA    720
       L--E--R--T--C--E--L--I--Y--L--S--Q--P--S--S--S--I--S--T--E--
721    ATAAATTCTATGTTGGTGCTAAAAGTTTCTTGGATCACATTTTTACTAGCTAAAGGGGAA    780
       I--N--S--M--L--V--L--K--V--S--W--I--T--F--L--L--A--K--G--E--
781    GTATTACAAATGGAAGATGATCTGGTGATCTCATTTCAGTTAATGCTATGTGTTCTTGAC    840
       V--L--Q--M--E--D--D--L--V--I--S--F--Q--L--M--L--C--V--L--D--
841    TATTTTATCAAACTCTCACCTCCTGCATTGCTCAAAGAACCATATAAAACAGCTGTAATA    900
       Y--F--I--K--L--S--P--P--A--L--L--K--E--P--Y--K--T--A--V--I--
901    CCTATTAATGGTTCACCTCGAACACCAAGGCGAGGTCAGAACAGGAGTGCACGGATAGCA    960
       P--I--N--G--S--P--R--T--P--R--R--G--Q--N--R--S--A--R--I--A--
961    AAACAACTAGAAAATGATACAAGAATTATTGAAGTTCTCTGTAAAGAACATGAATGTAAT   1020
       K--Q--L--E--N--D--T--R--I--I--E--V--L--C--K--E--H--E--C--N--
1021   ATAGATGAGGTGAAAAATGTTTATTTCAAAAATTTTATACCTTTTATGAATTCTCTTGGA   1080
       I--D--E--V--K--N--V--Y--F--K--N--F--I--P--F--M--N--S--L--G--
1081   ATTGTAGCCTCTAATGGACTTCCAGAGGTGGAAAGTCTTTCTAAACAATATGAAGAAATT   1140
       I--V--A--S--N--G--L--P--E--V--E--S--L--S--K--Q--Y--E--E--I--
1141   TACCTTAAAAACAAAGATCTAGATGCCAGGTTATTTTTGAATCATGATAAAACTCTTCAG   1200
       Y--L--K--N--K--D--L--D--A--R--L--F--L--N--H--D--K--T--L--Q--
1201   GCTGATCCTACAGACAGTTTGGAAATGCAGAGAACACCACGAAAAAGTAACCCTGATGAA   1260
       A--D--P--T--D--S--L--E--M--Q--R--T--P--R--K--S--N--P--D--E--
1261   GAGGTGAATGTGATTCTGCCACAGACTCCAGTTAGGACTGTTATGAATACTATCCAACAA   1320
       E--V--N--V--I--L--P--Q--T--P--V--R--T--V--M--N--T--I--Q--Q--
1321   TTAATGATGATCTTAAATTCAGCAAGTGATCAACCATCAGAAAATCTGATTTCCTATTTT   1380
       L--M--M--I--L--N--S--A--S--D--Q--P--S--E--N--L--I--S--Y--F--
1381   AATAATTGCACCGTGAATCCAAAGGAAAGTATCTTGAAAAGAGTAAAGGATATTGGATAC   1440
       N--N--C--T--V--N--P--K--E--S--I--L--K--R--V--K--D--I--G--Y--
1441   ATCTTTAAAGAACAGTTTGCTAAAGCTGTGGGACAGGGATGCATGGAAATTGGATCACAG   1500
       I--F--K--E--Q--F--A--K--A--V--G--Q--G--C--M--E--I--G--S--Q--
1501   CGATACAAACTTGGAGTCCGATTGTATTACCGAGTAATGGAATCCATGCTCAAATCCGAA   1560
       R--Y--K--L--G--V--R--L--Y--Y--R--V--M--E--S--M--L--K--S--E--
1561   GAAGAACGATTATCCATTCAAAATTTTAGCAAACTCCTGAATGACAACATCTTTCATATG   1620
       E--E--R--L--S--I--Q--N--F--S--K--L--L--N--D--N--I--F--H--M--
1621   TCTTTGTTGGCATGCGCTCTTGAGGTTGTAATGGCTACATATAGCAGAAGTACGTCTCAG   1680
       S--L--L--A--C--A--L--E--V--V--M--A--T--Y--S--R--S--T--S--Q--
1681   AATCTTGATACTGGAACAGATTTGTCCTTCCCGTGGATTCTGAATGTACTTAATTTAAAA   1740
       N--L--D--T--G--T--D--L--S--F--P--W--I--L--N--V--L--N--L--K--
1741   GCTTTTGATTTTTACAAAGTGATTGAAAGTTTTATCAAAGCAGAAGCCAACTTGACCAGA   1800
       A--F--D--F--Y--K--V--I--E--S--F--I--K--A--E--A--N--L--T--R--
1801   GAAATGATTAAACATTTAGAACGATGTGAACATCGAATCATGGAATCCCTTGCTTGGCGC   1860
       E--M--I--K--H--L--E--R--C--E--H--R--I--M--E--S--L--A--W--R--
1861   TCAGATTCACCTTTATTTGATCTTATTAAACAAACAAAGGACAGAGAAGGACCAGCTGAT   1920
       S--D--S--P--L--F--D--L--I--K--Q--T--K--D--R--E--G--P--A--D--
1921   CACCTTGAATCTGCTTGTACTCTTATTAACCTTCCTCTCCAGAGTAATCACACTGCAGCA   1980
       H--L--E--S--A--C--T--L--I--N--L--P--L--Q--S--N--H--T--A--A--
1981   GATATGTATCTTTCTCCTTTAAGATCCCCCAAGAAAAAAGGGTCAACTACACGTGTAAAT   2040
       D--M--Y--L--S--P--L--R--S--P--K--K--K--G--S--T--T--R--V--N--
2041   TCTACTGCAAATTCAGAGGCACAAGCAACCTCAACCTTCCAGACTCAGAAGCCACTGAAA   2100
       S--T--A--N--S--E--A--Q--A--T--S--T--F--Q--T--Q--K--P--L--K--
2101   TCTACCTCCCTTTCACTCTTTTACAAAAAAGTGTACCGACTAGCATATCTTCGACTCAAT   2160
       S--T--S--L--S--L--F--Y--K--K--V--Y--R--L--A--Y--L--R--L--N--
2161   ACCCTGTGTGCACGCCTTCTGTCTGACCACCCAGAACTAGAGCATATCATCTGGACCCTT   2220
       T--L--C--A--R--L--L--S--D--H--P--E--L--E--H--I--I--W--T--L--
2221   TTCCAGCACACACTGCAAAATGAGTATGAACTCATGAGAGACAGGCATTTGGACCAGATT   2280
       F--Q--H--T--L--Q--N--E--Y--E--L--M--R--D--R--H--L--D--Q--I--
2281   ATGATGTGTTCCATGTATGGCATATGCAAAGTGAAGAACATAGACCTTAAATTCAAAATC   2340
       M--M--C--S--M--Y--G--I--C--K--V--K--N--I--D--L--K--F--K--I--
2341   ATTGTAACAGCATACAAAGATCTTCCTCATGCTGTTCAGGAGACATTCAAACGTGTTTTG   2400
       I--V--T--A--Y--K--D--L--P--H--A--V--Q--E--T--F--K--R--V--L--
2401   ATCAGAGAAGAGGAGTATGATTCTATTATCGTATTCTATAATTCAGTCTTCATGCAGAGA   2460
       I--R--E--E--E--Y--D--S--I--I--V--F--Y--N--S--V--F--M--Q--R--
2461   CTGAAAACAAATATTTTGCAGTATGCTTCCACCAGGCCCCCCACTTTGTCACCAATTCCT   2520
       L--K--T--N--I--L--Q--Y--A--S--T--R--P--P--T--L--S--P--I--P--
2521   CACATTCCTCGGAGCCCTTACAAGTTTTCCAGTTCACCTGTACGGATTCCTGGGGGGAAC   2580
       H--I--P--R--S--P--Y--K--F--S--S--S--P--V--R--I--P--G--G--N--
2581   ATCTATATATCACCCCTAAAGAATCCATATAAAATTTCAGAAGGCCTGCCAACGCCAACA   2640
       I--Y--I--S--P--L--K--N--P--Y--K--I--S--E--G--L--P--T--P--T--
2641   AAAATGACTCCAAGATCGAGAATCTTAGTATCAATTGGTGAATCATTTGGGACTTCGGAG   2700
       K--M--T--P--R--S--R--I--L--V--S--I--G--E--S--F--G--T--S--E--
2701   AAGTTCCAGAAAATAAATCAGATGGTGTGTAATAGCGACCGTGTGCTCAAAAGAAGTGCT   2760
       K--F--Q--K--I--N--Q--M--V--C--N--S--D--R--V--L--K--R--S--A--
2761   GAAGGAGGCAACCCTCCTAAACCTCTGAAAAAGCTGCGCTTTGACATCGAAGGAGCAGAT   2820
       E--G--G--N--P--P--K--P--L--K--K--L--R--F--D--I--E--G--A--D--
2821   GAAGCAGATGGAAGTAAACATCTCCCGGGAGAGTCTAAATTTCAACAGAAACTGGCAGAA   2880
       E--A--D--G--S--K--H--L--P--G--E--S--K--F--Q--Q--K--L--A--E--
2881   ATGACATCTACTCGAACACGAATGCAAAAGCAGAAAATGAATGACAGCATGGATACCTCG   2940
       M--T--S--T--R--T--R--M--Q--K--Q--K--M--N--D--S--M--D--T--S--
2941   AACAGGGAAGAAAAGTGAgggccccgcgatcttggggggtgcccgtacacctccggcttc   3000
       N--R--E--E--K--***..........................................
3001   gccctcagccacagatctgactccagaactctc                              3060
       .................................