Imprinted Gene Databases

Homo sapiens: KCNQ1

Potassium voltage-gated channel, KQT-like subfamily, member 1

Lee et al. Nat Genet 15: 181-185, 1997; Imprint Control Region(s): ICR_720 & ICR_721; Jima et al. Epigenetics 17: 1920-1943, 2022

Species Gene Aliases Location Status Expressed Allele
Mus musculus Kcnq1 Kcna9, KVLQT1, AW559127  7 69.3 cM  Imprinted Maternal
Sus scrofa KCNQ1 KVLQT1  Imprinted Paternal
Homo sapiens KCNQ1 LQT, RWS, WRS, LQT1, SQT2, ATFB1, ATFB3, JLNS1, KCNA8, KCNA9, Kv1.9, Kv7.1, KVLQT1, FLJ26167  11p15.5  Imprinted Maternal
Ovis aries KCNQ1   21  Imprinted Maternal
Macaca fascicularis KCNQ1   14  Imprinted Maternal
1      gcggcggggctggcagcagtggctgcccgcactgcgcccgggcgctcgccttcgctgcag     60
       ............................................................
61     ctcccggtgccgccgctcgggccggccccccggcaggccctcctcgttATGGCCGCGGCC    120
       ................................................M--A--A--A--
121    TCCTCCCCGCCCAGGGCCGAGAGGAAGCGCTGGGGTTGGGGCCGCCTGCCAGGCGCCCGG    180
       S--S--P--P--R--A--E--R--K--R--W--G--W--G--R--L--P--G--A--R--
181    CGGGGCAGCGCGGGCCTGGCCAAGAAGTGCCCCTTCTCGCTGGAGCTGGCGGAGGGCGGC    240
       R--G--S--A--G--L--A--K--K--C--P--F--S--L--E--L--A--E--G--G--
241    CCGGCGGGCGGCGCGCTCTACGCGCCCATCGCGCCCGGCGCCCCAGGTCCCGCGCCCCCT    300
       P--A--G--G--A--L--Y--A--P--I--A--P--G--A--P--G--P--A--P--P--
301    GCGTCCCCGGCCGCGCCCGCCGCGCCCCCAGTTGCCTCCGACCTTGGCCCGCGGCCGCCG    360
       A--S--P--A--A--P--A--A--P--P--V--A--S--D--L--G--P--R--P--P--
361    GTGAGCCTAGACCCGCGCGTCTCCATCTACAGCACGCGCCGCCCGGTGTTGGCGCGCACC    420
       V--S--L--D--P--R--V--S--I--Y--S--T--R--R--P--V--L--A--R--T--
421    CACGTCCAGGGCCGCGTCTACAACTTCCTCGAGCGTCCCACCGGCTGGAAATGCTTCGTT    480
       H--V--Q--G--R--V--Y--N--F--L--E--R--P--T--G--W--K--C--F--V--
481    TACCACTTCGCCGTCTTCCTCATCGTCCTGGTCTGCCTCATCTTCAGCGTGCTGTCCACC    540
       Y--H--F--A--V--F--L--I--V--L--V--C--L--I--F--S--V--L--S--T--
541    ATCGAGCAGTATGCCGCCCTGGCCACGGGGACTCTCTTCTGGATGGAGATCGTGCTGGTG    600
       I--E--Q--Y--A--A--L--A--T--G--T--L--F--W--M--E--I--V--L--V--
601    GTGTTCTTCGGGACGGAGTACGTGGTCCGCCTCTGGTCCGCCGGCTGCCGCAGCAAGTAC    660
       V--F--F--G--T--E--Y--V--V--R--L--W--S--A--G--C--R--S--K--Y--
661    GTGGGCCTCTGGGGGCGGCTGCGCTTTGCCCGGAAGCCCATTTCCATCATCGACCTCATC    720
       V--G--L--W--G--R--L--R--F--A--R--K--P--I--S--I--I--D--L--I--
721    GTGGTCGTGGCCTCCATGGTGGTCCTCTGCGTGGGCTCCAAGGGGCAGGTGTTTGCCACG    780
       V--V--V--A--S--M--V--V--L--C--V--G--S--K--G--Q--V--F--A--T--
781    TCGGCCATCAGGGGCATCCGCTTCCTGCAGATCCTGAGGATGCTACACGTCGACCGCCAG    840
       S--A--I--R--G--I--R--F--L--Q--I--L--R--M--L--H--V--D--R--Q--
841    GGAGGCACCTGGAGGCTCCTGGGCTCCGTGGTCTTCATCCACCGCCAGGAGCTGATAACC    900
       G--G--T--W--R--L--L--G--S--V--V--F--I--H--R--Q--E--L--I--T--
901    ACCCTGTACATCGGCTTCCTGGGCCTCATCTTCTCCTCGTACTTTGTGTACCTGGCTGAG    960
       T--L--Y--I--G--F--L--G--L--I--F--S--S--Y--F--V--Y--L--A--E--
961    AAGGACGCGGTGAACGAGTCAGGCCGCGTGGAGTTCGGCAGCTACGCAGATGCGCTGTGG   1020
       K--D--A--V--N--E--S--G--R--V--E--F--G--S--Y--A--D--A--L--W--
1021   TGGGGGGTGGTCACAGTCACCACCATCGGCTATGGGGACAAGGTGCCCCAGACGTGGGTC   1080
       W--G--V--V--T--V--T--T--I--G--Y--G--D--K--V--P--Q--T--W--V--
1081   GGGAAGACCATCGCCTCCTGCTTCTCTGTCTTTGCCATCTCCTTCTTTGCGCTCCCAGCG   1140
       G--K--T--I--A--S--C--F--S--V--F--A--I--S--F--F--A--L--P--A--
1141   GGGATTCTTGGCTCGGGGTTTGCCCTGAAGGTGCAGCAGAAGCAGAGGCAGAAGCACTTC   1200
       G--I--L--G--S--G--F--A--L--K--V--Q--Q--K--Q--R--Q--K--H--F--
1201   AACCGGCAGATCCCGGCGGCAGCCTCACTCATTCAGACCGCATGGAGGTGCTATGCTGCC   1260
       N--R--Q--I--P--A--A--A--S--L--I--Q--T--A--W--R--C--Y--A--A--
1261   GAGAACCCCGACTCCTCCACCTGGAAGATCTACATCCGGAAGGCCCCCCGGAGCCACACT   1320
       E--N--P--D--S--S--T--W--K--I--Y--I--R--K--A--P--R--S--H--T--
1321   CTGCTGTCACCCAGCCCCAAACCCAAGAAGTCTGTGGTGGTAAAGAAAAAAAAGTTCAAG   1380
       L--L--S--P--S--P--K--P--K--K--S--V--V--V--K--K--K--K--F--K--
1381   CTGGACAAAGACAATGGGGTGACTCCTGGAGAGAAGATGCTCACAGTCCCCCATATCACG   1440
       L--D--K--D--N--G--V--T--P--G--E--K--M--L--T--V--P--H--I--T--
1441   TGCGACCCCCCAGAAGAGCGGCGGCTGGACCACTTCTCTGTCGACGGCTATGACAGTTCT   1500
       C--D--P--P--E--E--R--R--L--D--H--F--S--V--D--G--Y--D--S--S--
1501   GTAAGGAAGAGCCCAACACTGCTGGAAGTGAGCATGCCCCATTTCATGAGAACCAACAGC   1560
       V--R--K--S--P--T--L--L--E--V--S--M--P--H--F--M--R--T--N--S--
1561   TTCGCCGAGGACCTGGACCTGGAAGGGGAGACTCTGCTGACACCCATCACCCACATCTCA   1620
       F--A--E--D--L--D--L--E--G--E--T--L--L--T--P--I--T--H--I--S--
1621   CAGCTGCGGGAACACCATCGGGCCACCATTAAGGTCATTCGACGCATGCAGTACTTTGTG   1680
       Q--L--R--E--H--H--R--A--T--I--K--V--I--R--R--M--Q--Y--F--V--
1681   GCCAAGAAGAAATTCCAGCAAGCGCGGAAGCCTTACGATGTGCGGGACGTCATTGAGCAG   1740
       A--K--K--K--F--Q--Q--A--R--K--P--Y--D--V--R--D--V--I--E--Q--
1741   TACTCGCAGGGCCACCTCAACCTCATGGTGCGCATCAAGGAGCTGCAGAGGAGGCTGGAC   1800
       Y--S--Q--G--H--L--N--L--M--V--R--I--K--E--L--Q--R--R--L--D--
1801   CAGTCCATTGGGAAGCCCTCACTGTTCATCTCCGTCTCAGAAAAGAGCAAGGATCGCGGC   1860
       Q--S--I--G--K--P--S--L--F--I--S--V--S--E--K--S--K--D--R--G--
1861   AGCAACACGATCGGCGCCCGCCTGAACCGAGTAGAAGACAAGGTGACGCAGCTGGACCAG   1920
       S--N--T--I--G--A--R--L--N--R--V--E--D--K--V--T--Q--L--D--Q--
1921   AGGCTGGCACTCATCACCGACATGCTTCACCAGCTGCTCTCCTTGCACGGTGGCAGCACC   1980
       R--L--A--L--I--T--D--M--L--H--Q--L--L--S--L--H--G--G--S--T--
1981   CCCGGCAGCGGCGGCCCCCCCAGAGAGGGCGGGGCCCACATCACCCAGCCCTGCGGCAGT   2040
       P--G--S--G--G--P--P--R--E--G--G--A--H--I--T--Q--P--C--G--S--
2041   GGCGGCTCCGTCGACCCTGAGCTCTTCCTGCCCAGCAACACCCTGCCCACCTACGAGCAG   2100
       G--G--S--V--D--P--E--L--F--L--P--S--N--T--L--P--T--Y--E--Q--
2101   CTGACCGTGCCCAGGAGGGGCCCCGATGAGGGGTCCTGAggaggggatggggctggggga   2160
       L--T--V--P--R--R--G--P--D--E--G--S--***.....................
2161   tgggcctgagtgagaggggaggccaagagtggccccacctggccctctctgaaggaggcc   2220
       ............................................................
2221   acctcctaaaaggcccagagagaagagccccactctcagaggccccaataccccatggac   2280
       ............................................................
2281   catgctgtctggcacagcctgcacttgggggctcagcaaggccacctcttcctggccggt   2340
       ............................................................
2341   gtgggggccccgtctcaggtctgagttgttaccccaagcgccctggcccccacatggtga   2400
       ............................................................
2401   tgttgacatcactggcatggtggttgggacccagtggcagggcacagggcctggcccatg   2460
       ............................................................
2461   tatggccaggaagtagcacaggctgagtgcaggcccaccctgcttggcccagggggcttc   2520
       ............................................................
2521   ctgaggggagacagagcaacccctggaccccagcctcaaatccaggaccctgccaggcac   2580
       ............................................................
2581   aggcagggcaggaccagcccacgctgactacagggccgccggcaataaaagcccaggagc   2640
       ............................................................
2641   ccatttggagggcctgggcctggctccctcactctcaggaaatgctgacccatgggcagg   2700
       ............................................................
2701   agactgtggagactgctcctgagcccccagcttccagcaggagggacagtctcaccattt   2760
       ............................................................
2761   ccccagggcacgtggttgagtggggggaacgcccacttccctgggttagactgccagctc   2820
       ............................................................
2821   ttcctagctggagaggagccctgcctctccgcccctgagcccactgtgcgtggggctccc   2880
       ............................................................
2881   gcctccaacccctcgcccagtcccagcagccagccaaacacacagaaggggactgccacc   2940
       ............................................................
2941   tccccttgccagctgctgagccgcagagaagtgacggttcctacacaggacaggggttcc   3000
       ............................................................
3001   ttctgggcattacatcgcatagaaatcaataatttgtggtgatttggatctgtgttttaa   3060
       ............................................................
3061   tgagtttcacagtgtgattttgattattaattgtgcaagcttttcctaataaacgtggag   3120
       ............................................................
3121   aatcacaggctgggctgggcactgctctcaccttggttcctggggcatccatggggtctc   3180
       ............................................................
3181   tcacagacaggacccctgcagttcccctggaagcagtgcccaggtggctgtggaatagga   3240
       ............................................................
3241   acgctaaaaaaaaaaaaaaaaa                                         3300
       ......................