Imprinted Gene Databases

Sus scrofa: MTRF1

Mitochondrial translation release factor 1

Ahn et al. J Anim Sci 101: skad367, 2023

Species Gene Aliases Location Status Expressed Allele
Sus scrofa MTRF1   11  Not Imprinted Biallelic 
1      gtgatcaggtgtctatagggctgaaatcctagtggatcccagaaggttccctcgcttttt     60
       ............................................................
61     ttctctatgggatcactccatatgccgcgttacacggtgtggcttacacgtgctgctctc    120
       ............................................................
121    gtgtgggcttagtatcactacccacttgccgaggctgagcgttccttccagagtatcagc    180
       ............................................................
181    ttactcttgttactgtggagggtgatggagaagacttgctatgctcaggaaacttggaaa    240
       ............................................................
241    acactgagaagtaagaaaaaaagaaagcaagcaaaaagtatccttaatcccacaactaga    300
       ............................................................
301    gatcgtcataacattttgatgctgagATGAATCGTCACCTGTATGTTTGGCTTTGTAGAC    360
       ..........................M--N--R--H--L--Y--V--W--L--C--R--H
361    ATCCATCTCTTCACCGTCACCGCCAGTGCCATGTCCATCTCCGTTCTCATCGGCTTACAC    420
       --P--S--L--H--R--H--R--Q--C--H--V--H--L--R--S--H--R--L--T--Q
421    AGACGCATCTGGACACAAGGCCAGGGGCTTTTAGACAGGACAGGAATCACCTTCTCTGTC    480
       --T--H--L--D--T--R--P--G--A--F--R--Q--D--R--N--H--L--L--C--R
481    GTCTGTTAAATAAGAGCTGGTCCAGGAGATACTGTCATCAAGATACCAGGATGCAGTGGA    540
       --L--L--N--K--S--W--S--R--R--Y--C--H--Q--D--T--R--M--Q--W--R
541    GACATAAAGCACTACAGAAATATATGGAGGACCTGAGTAAGGAGTACCAGACACTTGATC    600
       --H--K--A--L--Q--K--Y--M--E--D--L--S--K--E--Y--Q--T--L--D--R
601    GTTGTTTGCAGCACATCTCTGCGCCTGAAGGGGACCGAAGGTCCTTGAATCGACGGCATG    660
       --C--L--Q--H--I--S--A--P--E--G--D--R--R--S--L--N--R--R--H--A
661    CGGAGCTGGCACCACTTGCCGTCATTTACAAGGAAATTCAGGAGGCTGAACAAGCCATTG    720
       --E--L--A--P--L--A--V--I--Y--K--E--I--Q--E--A--E--Q--A--I--E
721    AAGAATTAGAATCAATGTGTAAAAGTCTAAATAAACAGGATGAAAAGCAGTTACAAGAAC    780
       --E--L--E--S--M--C--K--S--L--N--K--Q--D--E--K--Q--L--Q--E--L
781    TTGCATTGGAAGAAAAGCGAACTATTGCTCAAAAAATCAACATGTTATACCATGAGCTTT    840
       --A--L--E--E--K--R--T--I--A--Q--K--I--N--M--L--Y--H--E--L--F
841    TCCAGAGTCTAGTGCCAAAGGAGAAATATGACAAAAATGATGTTATTTTAGAGGTGACAT    900
       --Q--S--L--V--P--K--E--K--Y--D--K--N--D--V--I--L--E--V--T--S
901    CTGGAAGAACTACTGGAGGTGATATCTGTCAACAGTTTACCCGGGAAATATTTGATATGT    960
       --G--R--T--T--G--G--D--I--C--Q--Q--F--T--R--E--I--F--D--M--Y
961    ACCAGAATTATTCAAGCTACAAACACTGGACTTTTGAACTTCTGAATTATACACCTGCTG   1020
       --Q--N--Y--S--S--Y--K--H--W--T--F--E--L--L--N--Y--T--P--A--D
1021   ATTATGGTGGGCTACACCATGCAGCCGCCCGAATTTCCGGTGCCAATGTCTATAAGCATT   1080
       --Y--G--G--L--H--H--A--A--A--R--I--S--G--A--N--V--Y--K--H--L
1081   TGAAGTATGAAGGTGGGATTCACCGAGTTCAGCGGATCCCTGAGGTGGGCCTGTCGTCAA   1140
       --K--Y--E--G--G--I--H--R--V--Q--R--I--P--E--V--G--L--S--S--R
1141   GGATGCAGCGCATTCACACAGGCACGATGTCAGTTATCGTGCTGCCTCAACCAGATGAGG   1200
       --M--Q--R--I--H--T--G--T--M--S--V--I--V--L--P--Q--P--D--E--V
1201   TAGATGTGAAAGTGGATCCCAAGGATTTGCGAATAGATACTTTTCGAGCCAAAGGAGCAG   1260
       --D--V--K--V--D--P--K--D--L--R--I--D--T--F--R--A--K--G--A--G
1261   GAGGACAGCATGTTAATACAACCGATAGTGCCGTCAGACTCGTCCACGTCCCCACAGGAC   1320
       --G--Q--H--V--N--T--T--D--S--A--V--R--L--V--H--V--P--T--G--L
1321   TTGTAGTAGAATGCCAACAAGAACGATCACAGATAAAAAATAAAGAAATAGCTTTGCGTG   1380
       --V--V--E--C--Q--Q--E--R--S--Q--I--K--N--K--E--I--A--L--R--V
1381   TGTTGAGAGCTAGACTCTACCAGCAGATTATTGAGAAAGAGAAGTGTCAACAACAAAGTG   1440
       --L--R--A--R--L--Y--Q--Q--I--I--E--K--E--K--C--Q--Q--Q--S--A
1441   CTAGGAAACTGCAGGTGGGAACAAGAGCCCAGTCAGAGAGAATCCGGACCTATAACTTCA   1500
       --R--K--L--Q--V--G--T--R--A--Q--S--E--R--I--R--T--Y--N--F--T
1501   CCCAGGATAGAGTCACTGACCACAGGATAGCATATGAAGTTCGTAATATCAAGGAATTTT   1560
       --Q--D--R--V--T--D--H--R--I--A--Y--E--V--R--N--I--K--E--F--L
1561   TATGTGGGGAGAAGTGCCTGGATCTGCTAATTCAGAGACTGCTTCAAACAGCGGATGAAG   1620
       --C--G--E--K--C--L--D--L--L--I--Q--R--L--L--Q--T--A--D--E--E
1621   AAGCCATTACTGAATTTTTGGATGAAAACCTTAAATCAGCAAAATAAatgctgatttgtt   1680
       --A--I--T--E--F--L--D--E--N--L--K--S--A--K--***.............
1681   atttattattatataaatgaaatggacctaggtcaagaagcggactgaggcatggacatc   1740
       ............................................................
1741   tttatgaacgctcataaagtacagctaaaaaacccactactcacaaaatattttttaatg   1800
       ............................................................
1801   catcaagtcccatttctattttcctgtacaggactgtccagctcttcaagtagaaatgaa   1860
       ............................................................
1861   gcatgcatcattgaaaaaaagacataaagtattaagaattgatcttgtctgagttcctgt   1920
       ............................................................
1921   tgtggcacagcggaaactaatcaactaggaaccatgaggttgtgggttcaatccctggcc   1980
       ............................................................
1981   ttgctcagtgg                                                    2040
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