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Rattus norvegicus: Ube3d

Ubiquitin protein ligase E3D

Albert et al, Genome Biol, 24: 48, 2023

Species Gene Aliases Location Status Expressed Allele
Rattus norvegicus Ube3d Ube2cbp, RGD1306773  8q31  Imprinted Paternal
1      cgcctggccgccgcgctgcctccgccaggaagccagcggcttgccacggccgcacgtgct     60
       ............................................................
61     cccacccagtcccagttctggtaactgcgggctcggtcccgcgtgggcccctgagtcggc    120
       ............................................................
121    cATGGCGGTGGTTGAGGCGGAAACACGCGTGTTCCTGGAAGTGCGGAGACGGCTCCAGAG    180
       .M--A--V--V--E--A--E--T--R--V--F--L--E--V--R--R--R--L--Q--S-
181    CGCGCTGCTAATCCTGGGGGAGCCAGATGAAGGAGGGATGAACCTGGACATATCCGTAAC    240
       -A--L--L--I--L--G--E--P--D--E--G--G--M--N--L--D--I--S--V--T-
241    GCCTACCTCTCTTTTGATGAGAAGCCCTGACGGCTGCACCGAGATCCGGCTTCCAGCAGG    300
       -P--T--S--L--L--M--R--S--P--D--G--C--T--E--I--R--L--P--A--G-
301    GGTCAGACTTGCACCTTCCTCGTGCGGCGGGCTGCAGTACATCAGTGGAGATGGTTTACA    360
       -V--R--L--A--P--S--S--C--G--G--L--Q--Y--I--S--G--D--G--L--H-
361    CCTGCGCCTGCGGGCCCAGGCTGAATCCAGCCCACAGCCGATTTCAGGGTTTAATCAAAG    420
       -L--R--L--R--A--Q--A--E--S--S--P--Q--P--I--S--G--F--N--Q--S-
421    CTTGCAAGCCCAAGAATGTTGCTCATTTTATTGCCAGTCCTGTGGTGAAGTCACGATAAA    480
       -L--Q--A--Q--E--C--C--S--F--Y--C--Q--S--C--G--E--V--T--I--K-
481    GGACAGGAAGCTCCTCAGGGTGCTCCCCCTGCCCAGTGAGAACTGGAGCGCTCTGGTTGG    540
       -D--R--K--L--L--R--V--L--P--L--P--S--E--N--W--S--A--L--V--G-
541    AGAGTGGTGCTGTCATCCCGACCCCTTCGCTAATAAGCCTCTCCATCCACGGGAGAATGA    600
       -E--W--C--C--H--P--D--P--F--A--N--K--P--L--H--P--R--E--N--D-
601    CTGTTTTGTTGGGGATTCTTTCTTTTTAGTGAATTCGAGAAGTGATTTGGAGCAGGAACC    660
       -C--F--V--G--D--S--F--F--L--V--N--S--R--S--D--L--E--Q--E--P-
661    AAAAGCAAATACCAAAGTCATTTGTAAGCGTTGCAAGGTAATGTTGGGAGAGACCGTATC    720
       -K--A--N--T--K--V--I--C--K--R--C--K--V--M--L--G--E--T--V--S-
721    ATCAGAAACAACCAAATTTTACATGACAGAGGTAATCGTCCAGCCATCTGAGGGAAGTTT    780
       -S--E--T--T--K--F--Y--M--T--E--V--I--V--Q--P--S--E--G--S--F-
781    CCCTAACATACCAAGGTCTCAGTTTGTTCAGAGCGTTATTGCCCGGTGCCTGGTGGAACT    840
       -P--N--I--P--R--S--Q--F--V--Q--S--V--I--A--R--C--L--V--E--L-
841    CTGCACTGCTAGAAGCACTTTCAGATTCACCATTCAAGGCCAGGACGGCAAGGTGTATAT    900
       -C--T--A--R--S--T--F--R--F--T--I--Q--G--Q--D--G--K--V--Y--I-
901    CTTGCTCTGGGTGTTGAACTCAGACAGTTTGGTGATGGAACCTCTGAGTAGTTCCGGTTG    960
       -L--L--W--V--L--N--S--D--S--L--V--M--E--P--L--S--S--S--G--C-
961    TATCAGGAAGTTCCCACTGTTGGAAGACTCATTGGAAGCTGACTCTGGCTCTGCCTGGAA   1020
       -I--R--K--F--P--L--L--E--D--S--L--E--A--D--S--G--S--A--W--N-
1021   CGCCATCAAAGTCCTCTACCAGCCCTGTATCAAAAGCAGGAATAAAGAGCTTGCCAGCTC   1080
       -A--I--K--V--L--Y--Q--P--C--I--K--S--R--N--K--E--L--A--S--S-
1081   CTGGGAAGGTGACATCAGTGTCCACCCTTTAACCCTGCCCTCCACAACCTGTTTGGAGCT   1140
       -W--E--G--D--I--S--V--H--P--L--T--L--P--S--T--T--C--L--E--L-
1141   GCTGTTGATACTATCGAGGAACAATGCCTCCCTACCTCTGTCCCTTCGCCAAATGAATTC   1200
       -L--L--I--L--S--R--N--N--A--S--L--P--L--S--L--R--Q--M--N--S-
1201   TTTTCAGCTTTGGTGCTCTCATTGCAAAACCTGAtgtaggagctcagcaggaagctgatg   1260
       -F--Q--L--W--C--S--H--C--K--T--***..........................
1261   tggaaactcagcaggtggcctttttgaagatgtaactgtggaagctgcagctttctggtc   1320
       ............................................................
1321   taccagcagacagctctccagcacagaatacagccaaggccagcaggtagctctgtgagc   1380
       ............................................................
1381   acagcctgctgacatgaacaagaactaagctgcagaacagggccttgtgctgaaatttcc   1440
       ............................................................
1441   agtttttcttgtttgcatttattctctaagagttgactttagatccctgcaaactcaagg   1500
       ............................................................
1501   ctacaaggaaagtcgtagtgttgtagtagcaggttgtcggcaggttaagtatagaagttg   1560
       ............................................................
1561   cacctctactcccacagagaggaatattcaaatcggcactgcgtcagcaccacctggaag   1620
       ............................................................
1621   catattagctaatggaaacccatctgtcctgtgtgaacacagcgagggaacttcactgga   1680
       ............................................................
1681   gagctgagtgtcaactgctctaaatcctgggaaataaacttttaaagagttccaggtttg   1740
       ............................................................
1741   tttaaagcatgtctttaaaaactaaaatatacaagttttcatatcttattcaaagaagat   1800
       ............................................................
1801   gcttgctggttggttgttgagtgattatccaattaaagttttcctgagggaataaaaaaa   1860
       ............................................................
1861   aaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaa                                        1920
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