Imprinted Gene Databases

Rattus norvegicus: Tssc4

Tumor suppressing subtransferable candidate 4

Albert et al, Genome Biol, 24: 48, 2023

Species Gene Aliases Location Status Expressed Allele
Homo sapiens TSSC4   11p15.5  Not Imprinted Biallelic
Bos taurus TSSC4   29  Imprinted Maternal
Rattus norvegicus Tssc4   1q42  Imprinted Maternal
Mus musculus Tssc4 AA241958, ESTM671070  7 69.3 cM  Imprinted Maternal 
1      cccgagactcggtttcccaggaatccaagcgagattgaacaggccggaatcccgtggaac     60
       ............................................................
61     tggcgggacgctgcgggaaaggtggcaggttattgaagcgtgtacggatgctggaacgct    120
       ............................................................
121    ccacatctgtgcacgctaggataccctttagccacccagcttcgcgaggcctccggtccg    180
       ............................................................
181    gttgtgagtagaggcgcctggcacacagtggaggtgaaagagcccgggagggcggggagg    240
       ............................................................
241    ggtgcggcattaggtacacccctcacggcagaactgggactgccttgctacaggtgggac    300
       ............................................................
301    ggATGTCAGGTCTTATGGCGGAGACAGAGGCCGGCTTGGAGGTTGAGGAACCCACCGAGG    360
       ..M--S--G--L--M--A--E--T--E--A--G--L--E--V--E--E--P--T--E--D
361    ATGACACCCTGCCTTCTGACACCGTCTCCCTCAGCGACTCGGACTCTGACCTCAGCTTAC    420
       --D--T--L--P--S--D--T--V--S--L--S--D--S--D--S--D--L--S--L--P
421    CTAGTGGTGTGGAGGTCCAAGCGTTGTCCCCAGAGAGGCTTTCTGGGGAGAGCCAGGAGG    480
       --S--G--V--E--V--Q--A--L--S--P--E--R--L--S--G--E--S--Q--E--D
481    ACTCGGGCCCTGATGACCCTCCCTCGCACCCCACGGGCATTCCCACCACTGCAGTGCAGC    540
       --S--G--P--D--D--P--P--S--H--P--T--G--I--P--T--T--A--V--Q--P
541    CGTTCCACCTCCGAGGCATGAGCTCCACTTTCTCCCAGCGGAGCCACAGCATCTTTGATT    600
       --F--H--L--R--G--M--S--S--T--F--S--Q--R--S--H--S--I--F--D--C
601    GTCTGGAGAGTGCAGCCCGGCAGGAACCGTGCTCTGCTCCCCAAACCAGTGTGGTTGACA    660
       --L--E--S--A--A--R--Q--E--P--C--S--A--P--Q--T--S--V--V--D--N
661    ATTGCAGCTTCAAGCGGCCTGTGGCTCCCCCAAGTCAGACTCCAGCAAGAAGCTTGAGCA    720
       --C--S--F--K--R--P--V--A--P--P--S--Q--T--P--A--R--S--L--S--R
721    GAGTGCATGGGAACACTGACCCGACCAGGGTACACCCTGTCCCTGACTATGTGTCACACC    780
       --V--H--G--N--T--D--P--T--R--V--H--P--V--P--D--Y--V--S--H--P
781    CTGAGCGTTGGACCAAATACAGTCTGGAAGATGTGTCTGAAACCAGTGAGCAGAGCAATC    840
       --E--R--W--T--K--Y--S--L--E--D--V--S--E--T--S--E--Q--S--N--R
841    GTGATGCTGCCCTGGCCTTCCTGAGCTCTCGAAGCCAGGCATCCCCCACAGACTATGTGC    900
       --D--A--A--L--A--F--L--S--S--R--S--Q--A--S--P--T--D--Y--V--P
901    CCTTTTTCAACCAGGACCCCTCTAGCTGTGGGGAGGGAAGAGTGGTCTTCACCAAACCAG    960
       --F--F--N--Q--D--P--S--S--C--G--E--G--R--V--V--F--T--K--P--V
961    TGCGGGGCAGCGAGGCTAGGGCTGAGAGGAAGAGGGTCCTAAAGAAGGGGGTTGTGTCAG   1020
       --R--G--S--E--A--R--A--E--R--K--R--V--L--K--K--G--V--V--S--G
1021   GTGCAGGGGGTGAGGCCTCAGTGGAGCTAGCCCATCTCGCCGGGCCTGAGGCTGAGGAAT   1080
       --A--G--G--E--A--S--V--E--L--A--H--L--A--G--P--E--A--E--E--W
1081   GGAGTGGCCACCAGGGACAGCCAGAGGTGGTAGTGCCTTCAGAAGCTGCCCGTCCTGAGT   1140
       --S--G--H--Q--G--Q--P--E--V--V--V--P--S--E--A--A--R--P--E--S
1141   CCTCATCAGGCCCCATAGGTATGAAAACTGTTGGTTTCCATGGCAGCAAGAAGCGGAGCA   1200
       --S--S--G--P--I--G--M--K--T--V--G--F--H--G--S--K--K--R--S--R
1201   GAGACCACTTCCGGAACAGGGATAGTAACCCGGAGGGGCCAGGGTCTGAGAGAGGACCCT   1260
       --D--H--F--R--N--R--D--S--N--P--E--G--P--G--S--E--R--G--P--S
1261   CAGTTTGActgcagtgccatcgctctacctcctcacctgcccagtccaggtgggacagtg   1320
       --V--***....................................................
1321   tgggctctctgtagtagggatgtgtgggcctcaactctggcagagactgggaattgtggg   1380
       ............................................................
1381   tcaggggaccttgaaggcctttgtgccccattgtttggggtgaataataaaggttttgag   1440
       ............................................................
1441   tatttactgaa                                                    1500
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