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Rattus norvegicus: Trpm5

Transient receptor potential cation channel, subfamily M, member 5

Albert et al, Genome Biol, 24: 48, 2023

Species Gene Aliases Location Status Expressed Allele
Homo sapiens TRPM5 MTR1, LTRPC5  11p15.5  Provisional Data Paternal
Rattus norvegicus Trpm5   1q42  Imprinted Maternal
Mus musculus Trpm5 Mtr1, Ltrpc5, 9430099A16Rik  7 F5  Not Imprinted Biallelic
1      gcaagggaggaacacagcctgaagtaggtgagtggctcccacattcagtaccagcagcta     60
       ............................................................
61     catgccaggagtctggaaggaacagacaggtttccaggagaccctctgcaaaagcctctg    120
       ............................................................
121    gagagctgtgtcgagggtgttggaatccagATGCCCGGAGTTCGAAAAGTCACAATGCCG    180
       ..............................M--P--G--V--R--K--V--T--M--P--
181    ATGGCCCAGAGCTCTTGTCCTGGAAGCCCCCCAGATACTGGGGATGGATGGGAGCCAGTC    240
       M--A--Q--S--S--C--P--G--S--P--P--D--T--G--D--G--W--E--P--V--
241    CTATGCAAGGGAGAGGTCAACTTCGGAGGGTCTGGGAAAAAGCGAAGCAAGTTTGTGAAG    300
       L--C--K--G--E--V--N--F--G--G--S--G--K--K--R--S--K--F--V--K--
301    GTGCCAAGCAATGTGGCCCCCTCCATGCTCTTTGAACTCCTGCTCACCGAGTGGCACCTG    360
       V--P--S--N--V--A--P--S--M--L--F--E--L--L--L--T--E--W--H--L--
361    CCAGCCCCCAACCTGGTGGTGTCCCTGGTGGGCGAGGAACGGCTTTTTGCTATGAAGTCC    420
       P--A--P--N--L--V--V--S--L--V--G--E--E--R--L--F--A--M--K--S--
421    TGGCTTCGGGATGTCTTGCGCAAGGGGCTGGTGAAAGCAGCTCAGAGCACAGGTGCCTGG    480
       W--L--R--D--V--L--R--K--G--L--V--K--A--A--Q--S--T--G--A--W--
481    ATCCTGACCAGTGCCCTCCATGTGGGCCTGGCACGCCATGTTGGACAGGCTGTACGTGAT    540
       I--L--T--S--A--L--H--V--G--L--A--R--H--V--G--Q--A--V--R--D--
541    CACTCTCTGGCTAGCACGTCCACCAAGGTCCGTGTGGTGGCCATCGGAATGGCCTCTCTG    600
       H--S--L--A--S--T--S--T--K--V--R--V--V--A--I--G--M--A--S--L--
601    GACCGAATCCTTCACCGCCAACTTCTAGATGGTGTCCAGGAGGATACTCCCATCCACTAC    660
       D--R--I--L--H--R--Q--L--L--D--G--V--Q--E--D--T--P--I--H--Y--
661    CCAGCAGATGAGGGCAGCACTCAGGGACCCCTCTGCCCTCTGGACAGCAATCTCTCCCAC    720
       P--A--D--E--G--S--T--Q--G--P--L--C--P--L--D--S--N--L--S--H--
721    TTCATCCTCGTGGAGCCAGGCACCCTTGGGAGTGGGAACGACGGACTGGCAGAGCTGCAG    780
       F--I--L--V--E--P--G--T--L--G--S--G--N--D--G--L--A--E--L--Q--
781    CTGAGCCTGGAGAAGCACATCTCTCAGCAGAGGACAGGTTATGGGGGTACCAGCAGCATC    840
       L--S--L--E--K--H--I--S--Q--Q--R--T--G--Y--G--G--T--S--S--I--
841    CAGATACCTGTCCTTTGCTTGCTAGTCAATGGTGACCCCAGCACCCTAGAGAGGATGTCC    900
       Q--I--P--V--L--C--L--L--V--N--G--D--P--S--T--L--E--R--M--S--
901    AGGGCAGTGGAGCAGGCTGCCCCATGGCTGATCCTGGCAGGTTCTGGGGGCATTGCTGAT    960
       R--A--V--E--Q--A--A--P--W--L--I--L--A--G--S--G--G--I--A--D--
961    GTACTCGCTGCCCTGGTGGGCCAGCCTCATCTCCTGGTGCCCCAGGTGACCGAGAAGCAG   1020
       V--L--A--A--L--V--G--Q--P--H--L--L--V--P--Q--V--T--E--K--Q--
1021   TTCAGAGAGAAATTCCCAAGCGAGTGTTTCTCTTGGGAAGCCATTGTACACTGGACAGAG   1080
       F--R--E--K--F--P--S--E--C--F--S--W--E--A--I--V--H--W--T--E--
1081   CTGCTACAGAACATTGCTGCACACCCCCACCTGCTCACAGTGTACGACTTTGAGCAGGAG   1140
       L--L--Q--N--I--A--A--H--P--H--L--L--T--V--Y--D--F--E--Q--E--
1141   GGTTCCGAGGACCTGGACACCGTCATCCTCAAGGCACTTGTGAAAGCCTGCAAGAGTCAC   1200
       G--S--E--D--L--D--T--V--I--L--K--A--L--V--K--A--C--K--S--H--
1201   AGCCGAGACGCACAAGACTACCTAGATGAGCTCAAGTTAGCAGTGGCCTGGGATCGCGTG   1260
       S--R--D--A--Q--D--Y--L--D--E--L--K--L--A--V--A--W--D--R--V--
1261   GACATTGCCAAGAGTGAAATCTTCAATGGGGACGTGGAGTGGAAGTCCTGTGACTTGGAA   1320
       D--I--A--K--S--E--I--F--N--G--D--V--E--W--K--S--C--D--L--E--
1321   GAGGTGATGACAGATGCCCTAGTGAGCAACAAGCCTGACTTCGTGCGCCTCTTTGTGGAC   1380
       E--V--M--T--D--A--L--V--S--N--K--P--D--F--V--R--L--F--V--D--
1381   AGTGGTGCTGACATGGCCGAGTTCTTGACCTATGGGCGGCTGCAGCAGCTTTACCACTCT   1440
       S--G--A--D--M--A--E--F--L--T--Y--G--R--L--Q--Q--L--Y--H--S--
1441   GTGTCCCCCAAGAGCCTCCTCTTTGAACTGCTGGAGCGTAAGCATGAGGAGGGTCGGCTG   1500
       V--S--P--K--S--L--L--F--E--L--L--E--R--K--H--E--E--G--R--L--
1501   ACACTGGCTGGCCTGGGTGCCCAGCAGACCCGGGAGCTGCCCGTTGGTCTGCCTGCCTTT   1560
       T--L--A--G--L--G--A--Q--Q--T--R--E--L--P--V--G--L--P--A--F--
1561   TCACTCCATGAGGTCTCCCGAGTTCTCAAAGATTTCCTGCATGACGCCTGCCGTGGCTTC   1620
       S--L--H--E--V--S--R--V--L--K--D--F--L--H--D--A--C--R--G--F--
1621   TACCAGGATGGGCGCAGGATGGAGGAGAGAGGGCCACCCAAGCGGCCTGCAGGCCAGAAA   1680
       Y--Q--D--G--R--R--M--E--E--R--G--P--P--K--R--P--A--G--Q--K--
1681   TGGCTGCCGGACCTCAGTCGGAAGAGTGAAGACCCATGGAGGGACCTGTTCCTTTGGGCT   1740
       W--L--P--D--L--S--R--K--S--E--D--P--W--R--D--L--F--L--W--A--
1741   GTGCTGCAGAACCGTTATGAGATGGCCACATACTTCTGGGCCATGGGCCGGGAGGGTGTG   1800
       V--L--Q--N--R--Y--E--M--A--T--Y--F--W--A--M--G--R--E--G--V--
1801   GCTGCTGCTCTGGCGGCCTGCAAGATCATCAAGGAAATGTCCCACCTGGAGAAAGAGGCA   1860
       A--A--A--L--A--A--C--K--I--I--K--E--M--S--H--L--E--K--E--A--
1861   GAGGTGGCCCGCACTATGCGTGAGGCCAAGTATGAGCAGCTGGCCCTCGATCTTTTCTCA   1920
       E--V--A--R--T--M--R--E--A--K--Y--E--Q--L--A--L--D--L--F--S--
1921   GAGTGCTACAGCAACAGTGAGGACCGTGCCTTTGCCCTGTTGGTGCGCAGGAACCACAGC   1980
       E--C--Y--S--N--S--E--D--R--A--F--A--L--L--V--R--R--N--H--S--
1981   TGGAGCAGGACCACCTGCCTGCACCTGGCCACTGAGGCCGATGCCAAGGCCTTCTTTGCC   2040
       W--S--R--T--T--C--L--H--L--A--T--E--A--D--A--K--A--F--F--A--
2041   CATGATGGTGTGCAAGCATTCCTGACGAAGATCTGGTGGGGAGACATGGCCACAGGCACA   2100
       H--D--G--V--Q--A--F--L--T--K--I--W--W--G--D--M--A--T--G--T--
2101   CCCATCTTACGACTTCTGGGTGCCTTCACCTGCCCAGCCCTCATCTACACAAATCTCATC   2160
       P--I--L--R--L--L--G--A--F--T--C--P--A--L--I--Y--T--N--L--I--
2161   TCCTTCAGTGAGGATGCCCCGCAGAGGATGGACCTGGAAGATCTGCAGGAGCCAGACAGT   2220
       S--F--S--E--D--A--P--Q--R--M--D--L--E--D--L--Q--E--P--D--S--
2221   TTGGATATGGAAAAGAGCTTCCTGTGCAGCCATGGTGGCCAATTGGAGAAGTTAACAGAG   2280
       L--D--M--E--K--S--F--L--C--S--H--G--G--Q--L--E--K--L--T--E--
2281   GCGCCAAGGGCTCCTGGCGATCTAGGCCCACAAGCTGCCTTCCTGCTCACACGGTGGAGG   2340
       A--P--R--A--P--G--D--L--G--P--Q--A--A--F--L--L--T--R--W--R--
2341   AAGTTCTGGGGCGCTCCTGTGACTGTGTTCTTGGGGAATGTGGTCATGTACTTTGCATTC   2400
       K--F--W--G--A--P--V--T--V--F--L--G--N--V--V--M--Y--F--A--F--
2401   CTCTTCCTATTCTCCTACGTCCTGCTGGTGGATTTCAGGCCACCACCCCAGGGGCCATCT   2460
       L--F--L--F--S--Y--V--L--L--V--D--F--R--P--P--P--Q--G--P--S--
2461   GGGTCGGAAGTTACCCTGTATTTCTGGGTCTTCACACTGGTGCTGGAGGAAATCCGACAG   2520
       G--S--E--V--T--L--Y--F--W--V--F--T--L--V--L--E--E--I--R--Q--
2521   GGATTCTTCACAAACGAGGACACCCGTCTGGTGAAGAAGTTCACTCTGTACGTAGAAGAC   2580
       G--F--F--T--N--E--D--T--R--L--V--K--K--F--T--L--Y--V--E--D--
2581   AACTGGAACAAATGTGACATGGTGGCCATCTTCCTGTTCATTGTTGGTGTCACCTGTAGA   2640
       N--W--N--K--C--D--M--V--A--I--F--L--F--I--V--G--V--T--C--R--
2641   ATGGTGCCCTCCGTGTTTGAGGCTGGCCGGACTGTTCTGGCCATTGACTTCATGGTGTTC   2700
       M--V--P--S--V--F--E--A--G--R--T--V--L--A--I--D--F--M--V--F--
2701   ACACTTCGGCTCATCCACATCTTTGCTATTCACAAGCAGCTGGGTCCTAAGATCATCATT   2760
       T--L--R--L--I--H--I--F--A--I--H--K--Q--L--G--P--K--I--I--I--
2761   GTAGAGCGGATGATGAAAGATGTCTTCTTCTTCCTCTTCTTCCTGAGCGTGTGGCTCGTG   2820
       V--E--R--M--M--K--D--V--F--F--F--L--F--F--L--S--V--W--L--V--
2821   GCCTATGGCGTGACCACTCAGGCCCTGCTGCACCCCCACGATGGCCGTCTGGAGTGGATT   2880
       A--Y--G--V--T--T--Q--A--L--L--H--P--H--D--G--R--L--E--W--I--
2881   TTCCGCCGTGTGCTCTACAGGCCTTACCTGCAGATCTTTGGGCAAATCCCTCTGGATGAA   2940
       F--R--R--V--L--Y--R--P--Y--L--Q--I--F--G--Q--I--P--L--D--E--
2941   ATTGATGAGGCCCGTGTGAACTGCTCTCTTCACCCGTTGCTGCTGGACAGCTCAGCTTCC   3000
       I--D--E--A--R--V--N--C--S--L--H--P--L--L--L--D--S--S--A--S--
3001   TGCCCTAATCTCTATGCCAACTGGCTGGTCATTCTCCTGCTGGTTACCTTCCTCCTCGTC   3060
       C--P--N--L--Y--A--N--W--L--V--I--L--L--L--V--T--F--L--L--V--
3061   ACTAATGTGCTACTTATGAACCTTCTGATCGCCATGTTCAGCTACACATTCCAGGTGGTG   3120
       T--N--V--L--L--M--N--L--L--I--A--M--F--S--Y--T--F--Q--V--V--
3121   CAGGGCAATGCAGACATGTTCTGGAAGTTTCAACGCTACCACCTCATCGTTGAATACCAC   3180
       Q--G--N--A--D--M--F--W--K--F--Q--R--Y--H--L--I--V--E--Y--H--
3181   GGAAGGCCGGCTCTGGCCCCGCCCTTCATCCTGCTCAGCCACCTGAGCCTGGTGCTCAAG   3240
       G--R--P--A--L--A--P--P--F--I--L--L--S--H--L--S--L--V--L--K--
3241   CAGGTCTTCAGGAAGGAAGCCCAGCACAAACAGCAACACCTGGAGAGAGACTTGCCTGAC   3300
       Q--V--F--R--K--E--A--Q--H--K--Q--Q--H--L--E--R--D--L--P--D--
3301   CCCGTGGACCAGAAGATCATTACCTGGGAAACAGTTCAAAAGGAGAACTTCCTGAGTACC   3360
       P--V--D--Q--K--I--I--T--W--E--T--V--Q--K--E--N--F--L--S--T--
3361   ATGGAGAAACGGAGGAGGGACAGTGAGGAGGAGGTGCTGAGGAAAACGGCACACAGAGTG   3420
       M--E--K--R--R--R--D--S--E--E--E--V--L--R--K--T--A--H--R--V--
3421   GACTTGATTGCCAAATACATCGGGGGTCTGAGAGAGCAAGAAAAGAGGATCAAGTGTCTG   3480
       D--L--I--A--K--Y--I--G--G--L--R--E--Q--E--K--R--I--K--C--L--
3481   GAGTCACAGGCCAACTACTGTATGCTCCTCTTGTCCTCCATGACTGACACACTGGCTCCT   3540
       E--S--Q--A--N--Y--C--M--L--L--L--S--S--M--T--D--T--L--A--P--
3541   GGAGGCACCTACTCAAGTTCTCAAAACTGTGGTCGCAGGAGTCAGCCAGCCTCTGCTAGA   3600
       G--G--T--Y--S--S--S--Q--N--C--G--R--R--S--Q--P--A--S--A--R--
3601   GACAGGGAGTACCTAGAGGCTGGCTTGCCACACTCAGACACCTGAaatggagaaaccact   3660
       D--R--E--Y--L--E--A--G--L--P--H--S--D--T--***...............
3661   tgccctagagctccagacctggccagattgaggttttgggtcacatcaaccttcccctgc   3720
       ............................................................
3721   cccagcagccccgagaccttgccgcagaccatgtcttggacacctcttcctatgaaaatg   3780
       ............................................................
3781   agactcatgtctttggcatctatctgggagccccaggcgtcctctccagcaggggaagtt   3840
       ............................................................
3841   ttctcatgtcctacctaaaactttcaccagctaagactggacagctggaactggccaagt   3900
       ............................................................
3901   cccacatgggataccatctgcctggatggggctacttacgtc                     3960
       ..........................................