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Rattus norvegicus: Tbx3

T-box transcription factor 3

Albert et al, Genome Biol, 24: 48, 2023

Species Gene Aliases Location Status Expressed Allele
Rattus norvegicus Tbx3   12q16  Imprinted Maternal
1      agacgcccggggaattctagaggcggaggagggtggcgaggtgctcgctctctctttctc     60
       ............................................................
61     tctctccctccctttactcgcctactccagctcccaaccgctcctctctcttttccttct    120
       ............................................................
121    ttcctattttttttttttttgcacccgtcttcttgatcgtccctcgccctgcgtgccggg    180
       ............................................................
181    acgctgattttttttttaatttattatttttaggaaggcgatttcgctcacgttttttta    240
       ............................................................
241    gcacaaggaagacagccgggtccccgaggcagaagatcgcaggcacccttcgatcgccac    300
       ............................................................
301    ccagacactgcacgcagcccggagccagagaggaggatcacgaaccgaagccagagtcgc    360
       ............................................................
361    agttcgagttttgaaagctccgctggaaaggggcttaaatcgcttttttttttttaaagg    420
       ............................................................
421    agagacttttcctcccccttgatctcgctgcctgtgaaagcaagagtctagctcaactaa    480
       ............................................................
481    gacgcctcctgcgagaaagccagagaagagctagggggcgggggaaggagtcggaaaaaa    540
       ............................................................
541    aggttaaaaaaaaagtctccgagaaccttgcgctttggcaacaaagagcgtgggagccgg    600
       ............................................................
601    ggagccaccccgggaaagggctgctgtgtctatttccagctaagccacagggctcgggcg    660
       ............................................................
661    ccagtcgagcccctgcttgctgcttgccctgctgaaaccgacttccaggagcggcttttc    720
       ............................................................
721    caacacactccaggcaccaggacagcccctgcagcggctatgtctcttgatttgtcgcct    780
       ............................................................
781    cgtcctctttaaaagcggcgttctcttccccccaaagacactttcccccctccctttcga    840
       ............................................................
841    acgctttattggtaatttgccccccttttaattttaaacaaaactatgtgtcgctgttga    900
       ............................................................
901    attttttaatcattatttttgcaaagcaacaacaaaagcggagccaagccagcagctgag    960
       ............................................................
961    gactgcttccctgtctggagtggATGAGCCTCTCCATGAGAGATCCGGTTATCCCTGGGA   1020
       .......................M--S--L--S--M--R--D--P--V--I--P--G--T
1021   CAAGCATGGCCTATCATCCGTTCCTACCTCACCGGGCGCCGGACTTCGCCATGAGCGCGG   1080
       --S--M--A--Y--H--P--F--L--P--H--R--A--P--D--F--A--M--S--A--V
1081   TGCTGGGCCACCAGCCGCCTTTCTTCCCCGCGCTAACGCTGCCTCCCAACGGCGCCGCGG   1140
       --L--G--H--Q--P--P--F--F--P--A--L--T--L--P--P--N--G--A--A--A
1141   CGCTCTCGCTGCCCGGAGCCCTGGCCAAACCCATCATGGATCAGTTAGTGGGGGCTGCTG   1200
       --L--S--L--P--G--A--L--A--K--P--I--M--D--Q--L--V--G--A--A--E
1201   AGACCGGCATCCCTTTCTCATCCCTGGGACCCCAGGCACATCTGAGGCCTCTGAAGACCA   1260
       --T--G--I--P--F--S--S--L--G--P--Q--A--H--L--R--P--L--K--T--M
1261   TGGAACCCGAAGAAGACGTAGAAGACGACCCCAAGGTGCACCTGGAGGCCAAGGAACTTT   1320
       --E--P--E--E--D--V--E--D--D--P--K--V--H--L--E--A--K--E--L--W
1321   GGGACCAGTTTCACAAGCGGGGTACAGAGATGGTCATTACGAAGTCAGGAAGGCGAATGT   1380
       --D--Q--F--H--K--R--G--T--E--M--V--I--T--K--S--G--R--R--M--F
1381   TCCCTCCATTTAAAGTGAGGTGCTCTGGGCTGGATAAAAAGGCCAAGTATATTTTATTGA   1440
       --P--P--F--K--V--R--C--S--G--L--D--K--K--A--K--Y--I--L--L--M
1441   TGGACATTATAGCTGCTGATGACTGTCGATATAAGTTTCACAATTCTCGGTGGATGGTGG   1500
       --D--I--I--A--A--D--D--C--R--Y--K--F--H--N--S--R--W--M--V--A
1501   CCGGTAAGGCAGACCCCGAAATGCCAAAAAGAATGTACATCCACCCGGACAGCCCCGCTA   1560
       --G--K--A--D--P--E--M--P--K--R--M--Y--I--H--P--D--S--P--A--T
1561   CGGGGGAGCAATGGATGTCCAAAGTCGTCACTTTCCACAAACTGAAACTCACCAACAACA   1620
       --G--E--Q--W--M--S--K--V--V--T--F--H--K--L--K--L--T--N--N--I
1621   TTTCGGATAAACACGGATTTACTTTGGCCTTCCCAAGCGATCACGCAACGTGGCAGGGGA   1680
       --S--D--K--H--G--F--T--L--A--F--P--S--D--H--A--T--W--Q--G--N
1681   ATTATAGTTTTGGGACCCAGACTATACTAAACTCCATGCACAAGTACCAGCCGCGGTTCC   1740
       --Y--S--F--G--T--Q--T--I--L--N--S--M--H--K--Y--Q--P--R--F--H
1741   ACATCGTCAGAGCCAACGACATTCTGAAACTGCCTTACAGTACCTTCCGCACATACCTGT   1800
       --I--V--R--A--N--D--I--L--K--L--P--Y--S--T--F--R--T--Y--L--F
1801   TCCCGGAAACAGAATTCATCGCCGTGACTGCCTATCAGAATGACAAGATAACCCAGTTAA   1860
       --P--E--T--E--F--I--A--V--T--A--Y--Q--N--D--K--I--T--Q--L--K
1861   AAATAGACAACAATCCTTTTGCGAAAGGTTTTCGAGATACTGGCAATGGCAGGAGAGAGA   1920
       --I--D--N--N--P--F--A--K--G--F--R--D--T--G--N--G--R--R--E--K
1921   AAAGAAAGCAGCTCACTCTGCAGTCCATGAGGGTGTTTGATGAGAGGCACAAGAAGGAGA   1980
       --R--K--Q--L--T--L--Q--S--M--R--V--F--D--E--R--H--K--K--E--T
1981   CCGGAACTTCTGATGAGTCCTCCAGTGAGCAGGCGGCCTTCAACTGCTTTGCCCAGGCCT   2040
       --G--T--S--D--E--S--S--S--E--Q--A--A--F--N--C--F--A--Q--A--S
2041   CCTCTCCCGCTGTGTCCACCGTGGGGACCTCCAACCTCAAAGATCTGTGTCCCAGCGAAG   2100
       --S--P--A--V--S--T--V--G--T--S--N--L--K--D--L--C--P--S--E--A
2101   CCGAGAGTGACGCCGAGGCTGAAAGCAAGGAGGAGCATGGCCCCGAGGCCTGCGACACGG   2160
       --E--S--D--A--E--A--E--S--K--E--E--H--G--P--E--A--C--D--T--A
2161   CCAAGATTTCCACCACCACAGCGGAGGAGCCGGGCCGCGACAAGGGCAGTCCAGCCACCA   2220
       --K--I--S--T--T--T--A--E--E--P--G--R--D--K--G--S--P--A--T--R
2221   GGGCGCAGCTGTTCCCCGCGGAGCCCAGCCGGGCCCGAGACACTGCGCGTCTGGACAAGG   2280
       --A--Q--L--F--P--A--E--P--S--R--A--R--D--T--A--R--L--D--K--A
2281   CATCGCCAGACTCGCGCCACAGCCCGGCCACCATCTCGTCTAGCACCCGAGTTCCGGGAG   2340
       --S--P--D--S--R--H--S--P--A--T--I--S--S--S--T--R--V--P--G--A
2341   CGGATGAGCACAGGAGCCCCGGACGCGAGGGTCCGGTGTCGGCCAAGGTGGATGAGGCTC   2400
       --D--E--H--R--S--P--G--R--E--G--P--V--S--A--K--V--D--E--A--R
2401   GAGCGCTGCCGGCCAAGGACGCCTTTGCTCCGCTGTCGGTGCAGACAGACGCCACCGCGC   2460
       --A--L--P--A--K--D--A--F--A--P--L--S--V--Q--T--D--A--T--A--H
2461   ATCTGACGCAGGGGCCCCTCCCGGGCTTGGGTTTCGCCCCGGGCCTTGCTGGCCAGCAGT   2520
       --L--T--Q--G--P--L--P--G--L--G--F--A--P--G--L--A--G--Q--Q--F
2521   TCTTCAACGGGCACCCTCTCTTCCTGCACCCGGGCCAGTTTGCCATGGGCGGCGCCTTCT   2580
       --F--N--G--H--P--L--F--L--H--P--G--Q--F--A--M--G--G--A--F--S
2581   CCAGCATGGCTGCAGGCATGGGGCCCCTGCTGGCCACAGTATCCGGGGCATCCACCGGCG   2640
       --S--M--A--A--G--M--G--P--L--L--A--T--V--S--G--A--S--T--G--V
2641   TCTCAGGCCTCGATTCCACAGCCATGGCCTCGGCTGCTGCAGCTCAGGGACTGTCCGGGG   2700
       --S--G--L--D--S--T--A--M--A--S--A--A--A--A--Q--G--L--S--G--A
2701   CGTCAGCTGCCACCCTGCCCTTCCACCTCCAACAACACGTTCTGGCCTCCCAGGGTTTGG   2760
       --S--A--A--T--L--P--F--H--L--Q--Q--H--V--L--A--S--Q--G--L--A
2761   CCATGTCGCCTTTTGGGAGCCTGTTTCCTTACCCCTACACATACATGGCTGCAGCTGCTG   2820
       --M--S--P--F--G--S--L--F--P--Y--P--Y--T--Y--M--A--A--A--A--A
2821   CGGCCTCCTCCGCGGCCGCCTCCAGCTCCGTGCACCGCCACCCGTTCCTCAATTTGAACA   2880
       --A--S--S--A--A--A--S--S--S--V--H--R--H--P--F--L--N--L--N--S
2881   GCATGCGCCCCAGGCTGCGTTACAGCCCGTATTCCATCCCAGTCCCGGTGCCTGATAGCA   2940
       --M--R--P--R--L--R--Y--S--P--Y--S--I--P--V--P--V--P--D--S--S
2941   GCAGCTTGCTGGCCACTGCGTTACCGTCCATGGCTTCCGCTGCGGGGCCCCTAGACGGCA   3000
       --S--L--L--A--T--A--L--P--S--M--A--S--A--A--G--P--L--D--G--K
3001   AATCGGCGGTCCTGGCAGCCAGCCCAGCCTCGGTGGCTGTGGACTCCGGGTCGGAACTGA   3060
       --S--A--V--L--A--A--S--P--A--S--V--A--V--D--S--G--S--E--L--N
3061   ATAGCCGCTCATCCACGCTGTCCTCCGGCTCAGTGTCCTTGTCACCCAAACTCTGCTCCG   3120
       --S--R--S--S--T--L--S--S--G--S--V--S--L--S--P--K--L--C--S--E
3121   AGAAGGAGGCGGCTACCAGCGAACTGCAGAGCATCCAGCGACTGGTCAGTGGCTTGGAAG   3180
       --K--E--A--A--T--S--E--L--Q--S--I--Q--R--L--V--S--G--L--E--A
3181   CCAAGCCAGACAGGTCCTGCAGCGGGTCCCCTTAAaaaaagaaaacaaaaagcaaaaccc   3240
       --K--P--D--R--S--C--S--G--S--P--***.........................
3241   gccctcctccctaaggtctctccattccagtttggtcaaatctgccagtgcactttgtta   3300
       ............................................................
3301   gatgtaaaataaaccacgggccttccacatggggtgacccccgcccccaatctctttcag   3360
       ............................................................
3361   ttttgtctgggaaggagaattacagcccttccagagagcgtgctagagaccacaggccct   3420
       ............................................................
3421   gtcgtcttgggctgtgtaaccaggctgctgtcgctttgagccgagggactgaagggggca   3480
       ............................................................
3481   aacaggcttttgtgtctagagcgacttctgcgcaggctgttgtggaagctggggctgaag   3540
       ............................................................
3541   aacaaggtagccagcccggccaggagcacgagtctttgagagacttcacccgaatctttc   3600
       ............................................................
3601   cccttttccccttcgtgtgttcagtggaaacagtctccccctaaacaaaccaacaaacaa   3660
       ............................................................
3661   aaccaatatgggggtgggggggagaagttccgtggaactgtctatgaagactgaaactca   3720
       ............................................................
3721   aacgaattgctgagtacttcgttggggcagggagaggagggccttacccttgcccggtct   3780
       ............................................................
3781   atattaaaggaatcctgtgtctttttttttttttttttaaacattgtgatggtttaagag   3840
       ............................................................
3841   ccgatgctggcttctttttttgcatgttacagttttctgggttttattttggatttcttt   3900
       ............................................................
3901   tttttttccttttacggaaaaagaacggaagtcccatcctcaacattgctcacgttggca   3960
       ............................................................
3961   accgggaggaagtggggtgaaagggggagccacgggcgtgaaaccaacggagtttatttt   4020
       ............................................................
4021   atctgaagcgctgtagagggctttcgtgtgcctgttggaccattagttccttttaactgt   4080
       ............................................................
4081   atatgcaataacaaggttttaaaagaaataataaagaggaaacaacgactattggacaaa   4140
       ............................................................
4141   gtatttatgtaattatttgatatctcttgtaaatacgtggaatatgactgctcagaaagt   4200
       ............................................................
4201   taaactttaatttattgaattgtacatagctggatgtaaataggaacgtgtctgtcaggt   4260
       ............................................................
4261   tttattcttgttttgccttttgggttttatttccaggtcaggagatggcaaatccacact   4320
       ............................................................
4321   aacaagcatagacttctatatccacatctccgtgctttcaagtaaatctggctgcaaagt   4380
       ............................................................
4381   tttggttttttttttttttttttcttactggaggggtggggtcggagtactctttcctat   4440
       ............................................................
4441   tttcaccaaaattggggaggaattccacttgaaattccctaaacccttgacacccccaga   4500
       ............................................................
4501   ggggttgagattgttggggggggggcagcccaccctaaaaactttcctgatttttttcat   4560
       ............................................................
4561   agactctgacatcttctaactcaagtaaggttttcattgttcaacttgatggcggttttt   4620
       ............................................................
4621   tttttttttttgattggtgtatggaaagggactgggttcaaacaaccgtgaaaggcaaaa   4680
       ............................................................
4681   caaaacaaaaaactaaaaaaaaacaaaaacaaaaaaacaaaaaaataacaaaaaaaacaa   4740
       ............................................................
4741   aaaaaaaaccaagaaggcgtattttgtgtttagtcctcgatgagttttctgtaattctcc   4800
       ............................................................
4801   tcctctttaagaacatcactgaaatttcaataaatttttattgaaatga              4860
       .................................................