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Rattus norvegicus: Syt16

Synaptotagmin 16

Albert et al, Genome Biol, 24: 48, 2023

Species Gene Aliases Location Status Expressed Allele
Rattus norvegicus Syt16 RGD1564654  6q24  Imprinted Paternal
1      aatagagatctgatagcctatactcacagggctcttttttcaccttggagacaaaacaag     60
       ............................................................
61     agaatgagaggagcgcctggcgagagtctctgtcctcacacactggaggcacctgtgtga    120
       ............................................................
121    tccttgcttctctctcctccccctgctccctacttttctcctttcagctgaggctcaggg    180
       ............................................................
181    tcgacattgctggaaagaagcaccaggcctggatgaaatgaaaaagcaaggacagaccaa    240
       ............................................................
241    gtatttgttcagcgggcgaatagagctgtcactcctgaagctattggcttcctgtctgct    300
       ............................................................
301    attggggtctttgttgtccttctggctgtccttgtcctcttcatcaacaagaagctgtgc    360
       ............................................................
361    actgaaaacgtaagaggacatccacatccagagcgacgagggaagagaaagcactcaaga    420
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421    gacaagaccggggcccacacaggagcggctaacagctttggggatgatgaagagccatcc    480
       ............................................................
481    acatcttctgagagcgatgaagatgtgactaagcagttcgagatctcggtgtcccgatcc    540
       ............................................................
541    cagagttttcgtacaggagtacctgagaagggaaagacaacagagttggagcagaaaaca    600
       ............................................................
601    aaatgcaaacatttcctgtgtacccaccaagaagacagcgctgaagggtctgcatgtgaa    660
       ............................................................
661    gatttggatggacccagccaactcagttattctgagattcggtcttacgaagaccgcccc    720
       ............................................................
721    atttccattctctcacaatctccctgtgagagcagggacaccaggcaccatggcccttgt    780
       ............................................................
781    catctgggcgctggcgtggtccgaaacctcagtcgtccttgtgcagatggcatcctggag    840
       ............................................................
841    acagagacagcgtttatcagtcggggctttgaagatccctatgccacccacaactcctct    900
       ............................................................
901    ATGTGGAGTCCAGAGGAGCAGGATGGGACCAGTCTGCAGGTACCACCAAGGCTTCCGGAG    960
       M--W--S--P--E--E--Q--D--G--T--S--L--Q--V--P--P--R--L--P--E--
961    CCTATCTCAAAATGTGGGGACCTCGATGTCATCTTTGAATATAGAGCTGTAACCCAGAAG   1020
       P--I--S--K--C--G--D--L--D--V--I--F--E--Y--R--A--V--T--Q--K--
1021   CTTACCGTGACCATTGTGAGAGCACAGGGTCTCCCAGATAAGGACCGAAGTGGTGTCAAC   1080
       L--T--V--T--I--V--R--A--Q--G--L--P--D--K--D--R--S--G--V--N--
1081   TCCTGGCAAGTTCACATAGTGCTACTGCCCAGTAAGAAACAGAGGGGTAAGACGAATATA   1140
       S--W--Q--V--H--I--V--L--L--P--S--K--K--Q--R--G--K--T--N--I--
1141   CAGAGAGGGCCCAACCCTGTCTTCAAGGAAAAGGTCACCTTCACCAAGCTGGAGCCCAGA   1200
       Q--R--G--P--N--P--V--F--K--E--K--V--T--F--T--K--L--E--P--R--
1201   GATGTGGCTGCCTGTGCTGTCCGCTTCCGCCTGTATGCTGCCCGGAAGATGACCCGAGAG   1260
       D--V--A--A--C--A--V--R--F--R--L--Y--A--A--R--K--M--T--R--E--
1261   AGAATGATGGGAGAGAAGCTGTTCTGTCTTAGCCACTTGCACCCAGAAGGGGAAATGAAA   1320
       R--M--M--G--E--K--L--F--C--L--S--H--L--H--P--E--G--E--M--K--
1321   GTGACTCTAGTTCTGGAGCCCAGAAGTAATCTGAGCAGTGGAGAGTCTCCCCTCAGCCCA   1380
       V--T--L--V--L--E--P--R--S--N--L--S--S--G--E--S--P--L--S--P--
1381   TCTGTGGTGTCTCACAGTGACAGTGCTTCATCCACACAGTCACTGTCTCATGGAGGAGTG   1440
       S--V--V--S--H--S--D--S--A--S--S--T--Q--S--L--S--H--G--G--V--
1441   CCAGAGCTACTGGTGGGACTGTCCTACAATGCCACAACAGGGCGATTATCTGTGGAAATG   1500
       P--E--L--L--V--G--L--S--Y--N--A--T--T--G--R--L--S--V--E--M--
1501   ATCAAAGGCAGCCATTTCCGCAACCTCGCTGCTAACCGAGCTCCCGATACATATGGAAAA   1560
       I--K--G--S--H--F--R--N--L--A--A--N--R--A--P--D--T--Y--G--K--
1561   CTCTTCCTCCTCAACTGTGTGGGTCAAGAGATGTCCCGCTGCAAGACGTCCATTCGGCGT   1620
       L--F--L--L--N--C--V--G--Q--E--M--S--R--C--K--T--S--I--R--R--
1621   GGCCAGCCCAACCCCGTCTATAAAGAGACCTTCGTCTTCCAGGTGGCCCTCTTCCAGCTC   1680
       G--Q--P--N--P--V--Y--K--E--T--F--V--F--Q--V--A--L--F--Q--L--
1681   TCGGATGTTACCTTGATGATTTCCATTTATAGCAGACGCACAATGAAGCGTAAAGAGATG   1740
       S--D--V--T--L--M--I--S--I--Y--S--R--R--T--M--K--R--K--E--M--
1741   ATTGGCTGGATTGCTCTGGGCCAGAACAGCAGTGGGGAGGAGGAGCAGGAGCACTGGGAC   1800
       I--G--W--I--A--L--G--Q--N--S--S--G--E--E--E--Q--E--H--W--D--
1801   GAAATGAAGGACAGCAAAAGCCAGCAGATCTGCAGGTGGCATACGCTGTTGGAATCCTAG   1860
       E--M--K--D--S--K--S--Q--Q--I--C--R--W--H--T--L--L--E--S--***
1861   gtttatcaacagcgttcccgtgctacgtcagccttgcttacctaacaccaagtcagatca   1920
       ............................................................
1921   tggcaggtggaggagctttcaaatggagaattttactaatcttgggtcattccgtggtgt   1980
       ............................................................
1981   ggaaccatctcaaaggttcgatctgagtttaaatgttgtcgtgaaaggaaacctacatac   2040
       ............................................................
2041   acagtatgggcaatggtatctagttgagaccactggctatatcacaacttgtgctaatgg   2100
       ............................................................
2101   atgattgtgttttggttcgtactatgtggttcagcttcctcctgctgtctctttttgctg   2160
       ............................................................
2161   ggagaatagcctgagatttcaaaggagctgtaaacattactgttttccatcactgaggtg   2220
       ............................................................
2221   tatgaatcagactcttctcagtgttcaaaattccaaaacagaaatgaatcagatgctgag   2280
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2281   cgttacggaaggacgtaacccaccacagtcctctgccacccctattctctttatggaaaa   2340
       ............................................................
2341   aaaaagccctgtttatttaaaaggtaattgctataaatttgtggtgtaaaataaatttgt   2400
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2401   attcatgaaatgtctctttttatctcaattagatatcacgatttctaaaagaattggggt   2460
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2461   agacaaatcatcttaaagctctaaagcagttaaaaaaaatgactgttatctgacctgtct   2520
       ............................................................
2521   ctttttgaatatttaagatttccaaagtcaaggatttttgtgctttcttatcaaattggt   2580
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2581   acccagagaagaagaggaaaacctaggagataatttaagccttggctttcttgatgtttc   2640
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2641   agaacctgtcattcatttggattagaccttttctatagataattgtactaactctcacat   2700
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2701   gtatttttttaatgtacttctgcatgccaaccacatttgtctttatgctatgtaccttac   2760
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2761   taatagaacatagaaagatgcatacagtggatctcaataaatactaatttgattgac      2820
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