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Rattus norvegicus: Slc38a1

Solute carrier family 38, member 1

Albert et al, Genome Biol, 24: 48, 2023

Species Gene Aliases Location Status Expressed Allele
Rattus norvegicus Slc38a1 Ata1, GlnT, Sat1  7q35  Imprinted Paternal 
1      gcggatcctccccgcccagtcttacagaccaggggccacctttccctaggcagaccttga     60
       ............................................................
61     caccaagaggacatctaactgccggggacggcctggaagggcggacactttggcggcgcc    120
       ............................................................
121    tttccctttatttctcgaggggtctcgggcatctctattcactgctgtctgctactcaag    180
       ............................................................
181    gtcctcagaacagaagacattcggattgatttcttgactacagacacccaaatATGATGC    240
       .....................................................M--M--H
241    ATTTCAAAAGTGGCCTCGAGTTAACGGAGCTGCAGAACATGACGGTGCCCGAGGATGACA    300
       --F--K--S--G--L--E--L--T--E--L--Q--N--M--T--V--P--E--D--D--N
301    ATGTCAGCAACGACTCTAATGACTTCACGGAAGTGGAGAACGGCCAGATAAATAGCAAGT    360
       --V--S--N--D--S--N--D--F--T--E--V--E--N--G--Q--I--N--S--K--F
361    TCATCTCTGATCGGGAGAGTAGGAGGAGTCTCACGAACAGCCATCTGGAGAAAAGGAAAT    420
       --I--S--D--R--E--S--R--R--S--L--T--N--S--H--L--E--K--R--K--C
421    GCGACGAGTATATTCCAGGAACAACCTCTCTGGGAATGTCTGTCTTTAACCTGAGCAACG    480
       --D--E--Y--I--P--G--T--T--S--L--G--M--S--V--F--N--L--S--N--A
481    CCATCATGGGCAGTGGGATCTTGGGCCTCGCCTTCGCCTTGGCCAACACGGGGATCCTCC    540
       --I--M--G--S--G--I--L--G--L--A--F--A--L--A--N--T--G--I--L--L
541    TGTTTCTGATACTTCTGACTTCGGTGACGTTACTGTCTATATACTCAATAAACCTACTAC    600
       --F--L--I--L--L--T--S--V--T--L--L--S--I--Y--S--I--N--L--L--L
601    TGATCTGCTCCAAGGAAACCGGCTGCATGGTCTACGAAAAGCTGGGAGAGCAAGTCTTCG    660
       --I--C--S--K--E--T--G--C--M--V--Y--E--K--L--G--E--Q--V--F--G
661    GCACCACGGGGAAGCTGGTGATCTTCGGAGCCACCTCTCTGCAGAACACTGGCGCGATGC    720
       --T--T--G--K--L--V--I--F--G--A--T--S--L--Q--N--T--G--A--M--L
721    TGAGCTACCTCTTCATAGTGAAAAATGAACTTCCTTCAGCCATAAAATCCCTCATGGGAG    780
       --S--Y--L--F--I--V--K--N--E--L--P--S--A--I--K--S--L--M--G--E
781    AGGAGGAGACATTTTCAGCCTGGTACGTCGATGGCCGAGTGTTGGTGGTGATGGTAACCT    840
       --E--E--T--F--S--A--W--Y--V--D--G--R--V--L--V--V--M--V--T--F
841    TTGGCATAATTCTCCCGCTGTGTCTCTTGAAGAACCTGGGGTATCTTGGCTACACTAGTG    900
       --G--I--I--L--P--L--C--L--L--K--N--L--G--Y--L--G--Y--T--S--G
901    GATTTTCCTTGAGCTGCATGGTTTTTTTCCTGATAGTGGTCATCTACAAGAAATTTCAGA    960
       --F--S--L--S--C--M--V--F--F--L--I--V--V--I--Y--K--K--F--Q--I
961    TTCCTTGCATGAATGGGGAACAGAACTCAACAGTAAGTGCTAACGTGACTGACGCGTGCA   1020
       --P--C--M--N--G--E--Q--N--S--T--V--S--A--N--V--T--D--A--C--T
1021   CACCAAAGTATGTCACCTTCAACTCAAAGACGGTGTACGCTTTACCAACCATCGCGTTTG   1080
       --P--K--Y--V--T--F--N--S--K--T--V--Y--A--L--P--T--I--A--F--A
1081   CGTTTGTCTGCCACCCGTCTGTCCTGCCAATCTACAGCGAGCTCAAAGATCGGTCACAGA   1140
       --F--V--C--H--P--S--V--L--P--I--Y--S--E--L--K--D--R--S--Q--K
1141   AAAAAATGCAGATGGTTTCCAACATCTCCTTCTTTGCTATGTTTGTCATGTACTTCCTGA   1200
       --K--M--Q--M--V--S--N--I--S--F--F--A--M--F--V--M--Y--F--L--T
1201   CCGCCATCTTTGGGTACCTGACCTTTTATGAAAAGGTGCAGTCAGACCTCCTTCACAAGT   1260
       --A--I--F--G--Y--L--T--F--Y--E--K--V--Q--S--D--L--L--H--K--Y
1261   ACCAGAGCACAGGCGACATTCTCATCCTGACTGTGCGACTGGCCGTCATTGTGGCCGTCA   1320
       --Q--S--T--G--D--I--L--I--L--T--V--R--L--A--V--I--V--A--V--I
1321   TCCTCACGGTGCCCGTACTGTTCTTCACAGTCCGGTCCTCGTTGTTTGAGCTGGCCAAGA   1380
       --L--T--V--P--V--L--F--F--T--V--R--S--S--L--F--E--L--A--K--K
1381   AGACGAAGTTCCACCTGTGTCGCCATGTCCTGGTGACCATCATACTCCTTGTGATTATCA   1440
       --T--K--F--H--L--C--R--H--V--L--V--T--I--I--L--L--V--I--I--N
1441   ACCTGTTGGTGATCTTCATCCCATCCATGAAGGATATATTTGGAGTCGTAGGGGTGACGT   1500
       --L--L--V--I--F--I--P--S--M--K--D--I--F--G--V--V--G--V--T--S
1501   CTGCTAACATGCTCATTTTCATCCTTCCTTCGTCCCTTTATTTAAAAATCACGAACCAGG   1560
       --A--N--M--L--I--F--I--L--P--S--S--L--Y--L--K--I--T--N--Q--D
1561   ATGGAGACAAGAATACTCAAAGGATTTGGGCGGCCCTTTTCTTGGCCCTGGGGGTGTTGT   1620
       --G--D--K--N--T--Q--R--I--W--A--A--L--F--L--A--L--G--V--L--F
1621   TCTCCTTGATCAGCATCCCCCTAGTCATCTACGACTGGGCTTGCTCCTCCAGCAATGGTG   1680
       --S--L--I--S--I--P--L--V--I--Y--D--W--A--C--S--S--S--N--G--E
1681   AAGGCCACTGAaaccagcagcgaccaacccagcacctgctcacacccatccagtccccat   1740
       --G--H--***.................................................
1741   cagcagtcctcctactcttcttttgcaagtttacagagacagaaacgcacagagctcctc   1800
       ............................................................
1801   ttgggttgcgacacagagactcactcctagaagactcatgccctctcgggaccgccgctt   1860
       ............................................................
1861   aggaaccttggattcccacctctctggatttcgtgcagccgtcttgtccagcccttccca   1920
       ............................................................
1921   cagttctccttccctctcctcactgatgtggcttctctctctcagaacttcggaaacatg   1980
       ............................................................
1981   atcaacagtcgtcttcacctgttagatacccagctcctgaagtcgttttcctactgacgc   2040
       ............................................................
2041   tccgcccacgctatctggatctttttagaagagaaaataatcttgaattgtatatattta   2100
       ............................................................
2101   ttttgctttatggaaaaaaaa                                          2160
       .....................