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Rattus norvegicus: Sall1

Spalt-like transcription factor 1

Albert et al, Genome Biol, 24: 48, 2023

Species Gene Aliases Location Status Expressed Allele
Homo sapiens SALL1 TBS, HSAL1, ZNF794  16q12.1  Predicted Maternal
Rattus norvegicus Sall1   19p11  Imprinted Paternal
Mus musculus Sall1 Msal-3  8 43.51 cM  Imprinted Paternal
1      tgccccagctgatgtttgagccagcATGTCGCGGAGGAAGCAAGCGAAGCCTCAACATTT     60
       .........................M--S--R--R--K--Q--A--K--P--Q--H--F-
61     CCAATCCGACCCCGAAGTGGCCTCGCTCCCCCGGCGAGATGGGGACACAGAGAAGGGTCA    120
       -Q--S--D--P--E--V--A--S--L--P--R--R--D--G--D--T--E--K--G--Q-
121    ACCAAGTCGCCCCACTAAGAGCAAAGATGCCCACGTCTGTGGCCGGTGCTGCGCTGAATT    180
       -P--S--R--P--T--K--S--K--D--A--H--V--C--G--R--C--C--A--E--F-
181    CTTTGAATTATCAGACCTTCTGCTCCACAAAAAGAGCTGCACTAAGAATCAATTAGTTTT    240
       -F--E--L--S--D--L--L--L--H--K--K--S--C--T--K--N--Q--L--V--L-
241    GATCGTCAATGAAAGTCCAGCCTCCCCACCAAAAACCTTCCCTCCCGGCCCGCCGTCTCT    300
       -I--V--N--E--S--P--A--S--P--P--K--T--F--P--P--G--P--P--S--L-
301    CAACAATCCTGATGAGCAAATGAAATTCGTGGCGAGTAAAGCAGACCAAGAAGACTGCGG    360
       -N--N--P--D--E--Q--M--K--F--V--A--S--K--A--D--Q--E--D--C--G-
361    CGACCTTTCAGAACACAAGGGACTCGACAGGGAAGAGTCCATGGAGACGGAGGTCCCAGT    420
       -D--L--S--E--H--K--G--L--D--R--E--E--S--M--E--T--E--V--P--V-
421    TGCCACCAGCAGCAGCAGCAGCAACGGTGGCACTCTGAGCAGTGTCACCAACATCGCCAC    480
       -A--T--S--S--S--S--S--N--G--G--T--L--S--S--V--T--N--I--A--T-
481    CCCAAGCTGCCACAGCGGCTCTTCCACGGGTACCTCAGCGATCACAACCTCTCTACCTCA    540
       -P--S--C--H--S--G--S--S--T--G--T--S--A--I--T--T--S--L--P--Q-
541    ACTTGGGGACCTGACGACACTGGGCAACTTCTCGGTGATCAACAGCAACGTCATCATTGA    600
       -L--G--D--L--T--T--L--G--N--F--S--V--I--N--S--N--V--I--I--E-
601    AAATCTCCAGAGCACCAAGGTGGCGGTGGCCCAGTTCTCCCAGGAAGCGAGGTGTGGGGG    660
       -N--L--Q--S--T--K--V--A--V--A--Q--F--S--Q--E--A--R--C--G--G-
661    GGCCTCTGGAGGCAAGCTGCTCATCTCGGCCCTCATGGAGCAGCTCCTAGCTCTGCAGCA    720
       -A--S--G--G--K--L--L--I--S--A--L--M--E--Q--L--L--A--L--Q--Q-
721    GCAGCAGATCCACCAGCTGCAGCTCATAGAACAGATTCGTCACCAAATACTGCTGCTGGC    780
       -Q--Q--I--H--Q--L--Q--L--I--E--Q--I--R--H--Q--I--L--L--L--A-
781    TTCTCAGAACGCAGATCTGTCAGCCTCTTCTGTTCCTTCTCAAGGTACTTTACGAACGTC    840
       -S--Q--N--A--D--L--S--A--S--S--V--P--S--Q--G--T--L--R--T--S-
841    TGCCAACCCCTTGACCACACTAAGTTCCCATTTGTCTCAGCAGCTGGCGGTGGCAGCTGG    900
       -A--N--P--L--T--T--L--S--S--H--L--S--Q--Q--L--A--V--A--A--G-
901    ATTAGCACAGAGCCTTGCTAGCCAATCTGCCAACATCAGCGGTGTGAAGCAGCTCCCCCC    960
       -L--A--Q--S--L--A--S--Q--S--A--N--I--S--G--V--K--Q--L--P--P-
961    AGTCCAGCTACCTCAGAGCAGCTCCGGCACCATCATCCCGCCCAGTAGTGGCCCATCTCC   1020
       -V--Q--L--P--Q--S--S--S--G--T--I--I--P--P--S--S--G--P--S--P-
1021   CAACGTGAGCATGGTGACAGCAACAGTTCCCACCCCGTCCTCGGAAAAAGTGGCTTCCAA   1080
       -N--V--S--M--V--T--A--T--V--P--T--P--S--S--E--K--V--A--S--N-
1081   TGCTGGTGCCTCCCATGTCAGCCCCCCGGCCGTCTCAGCATCATCCTCACCAGCAGCATT   1140
       -A--G--A--S--H--V--S--P--P--A--V--S--A--S--S--S--P--A--A--F-
1141   CGCAATAAGCAGTCTGTTGAGTCCTGCATCTAACCCACTTCTACCTCAGCCGACCCCAGC   1200
       -A--I--S--S--L--L--S--P--A--S--N--P--L--L--P--Q--P--T--P--A-
1201   TAATGCTGTTTTCCCTACCCCTTTGCCTAACATTGCGACAACTGCAGAAGATTTAAACGC   1260
       -N--A--V--F--P--T--P--L--P--N--I--A--T--T--A--E--D--L--N--A-
1261   CCTGTCTGCCTTGGCCCAGCAAAGAAAAAGCAAGCCACCAAATGTCACTGCCTTCGAAGC   1320
       -L--S--A--L--A--Q--Q--R--K--S--K--P--P--N--V--T--A--F--E--A-
1321   AAAGAGTACTTCAGACGAGGCATTCTTTAAACACAAGTGTAGGTTCTGTGCAAAGGTCTT   1380
       -K--S--T--S--D--E--A--F--F--K--H--K--C--R--F--C--A--K--V--F-
1381   TGGGAGTGACAGTGCCTTGCAGATCCACTTGCGCTCCCATACTGGAGAGAGGCCGTTCAA   1440
       -G--S--D--S--A--L--Q--I--H--L--R--S--H--T--G--E--R--P--F--K-
1441   GTGCAACATCTGTGGGAACAGGTTCTCCACCAAGGGCAACCTGAAAGTCCACTTTCAGCG   1500
       -C--N--I--C--G--N--R--F--S--T--K--G--N--L--K--V--H--F--Q--R-
1501   CCACAAAGAGAAGTACCCCCACATCCAGATGAACCCCTACCCCGTACCGGAGCACTTGGA   1560
       -H--K--E--K--Y--P--H--I--Q--M--N--P--Y--P--V--P--E--H--L--D-
1561   CAACGTCCCTACGAGCACCGGCATCCCCTACGGCATGTCCATCCCTCCAGAGAAGCCGGT   1620
       -N--V--P--T--S--T--G--I--P--Y--G--M--S--I--P--P--E--K--P--V-
1621   CACCAGCTGGCTAGACACCAAGCCGGTCCTGCCCACTCTGACCACTTCCGTCGGCCTGCC   1680
       -T--S--W--L--D--T--K--P--V--L--P--T--L--T--T--S--V--G--L--P-
1681   ATTGCCTCCTACCCTCCCAAGCCTCACGCCCTTCATCAAGACGGAAGAACCAGCTCCCAT   1740
       -L--P--P--T--L--P--S--L--T--P--F--I--K--T--E--E--P--A--P--I-
1741   CCCAATTAGCCATTCTGCTGCCAGCCCCCAAGGCTCAGTCAAAAGTGACTCGGGGGCCCC   1800
       -P--I--S--H--S--A--A--S--P--Q--G--S--V--K--S--D--S--G--A--P-
1801   CGATTTGGCCACAAGAAACCCAAGTGGGGTCCCAGAGGAAGCCGAAGGGTCTGCTGTGCC   1860
       -D--L--A--T--R--N--P--S--G--V--P--E--E--A--E--G--S--A--V--P-
1861   CCCCTTCGGTGGCAAGGGTGAAGACAGTAGCGTGGTAAGCTCCATCCCGACAGCGGGCAG   1920
       -P--F--G--G--K--G--E--D--S--S--V--V--S--S--I--P--T--A--G--S-
1921   CAGTGCCCTGAACTCCCCAGTGGCTGATGGTGGTGCAGGAGGGACCACCTTCACCAACCC   1980
       -S--A--L--N--S--P--V--A--D--G--G--A--G--G--T--T--F--T--N--P-
1981   TCTGTTGCCCCTCATGTCTGAGCAGTTCAAGGCCAAGTTTCCTTTTGGGGGACTCTTAGA   2040
       -L--L--P--L--M--S--E--Q--F--K--A--K--F--P--F--G--G--L--L--D-
2041   TTCAGCCCAGGCCTCAGAGACATCCAAGCTGCAGCAACTGGTAGAAAACATTGACAAGAA   2100
       -S--A--Q--A--S--E--T--S--K--L--Q--Q--L--V--E--N--I--D--K--K-
2101   GGCCACCGACCCCAACGAGTGTGTCATCTGCCATCGGGTTCTGAGCTGTCAGAGCGCTTT   2160
       -A--T--D--P--N--E--C--V--I--C--H--R--V--L--S--C--Q--S--A--L-
2161   GAAAATGCACTACCGAACACACACCGGGGAGAGGCCCTTCAAGTGTAAGATCTGCGGCCG   2220
       -K--M--H--Y--R--T--H--T--G--E--R--P--F--K--C--K--I--C--G--R-
2221   GGCTTTTACCACGAAAGGGAACCTCAAGACCCACTACAGCGTCCATCGGGCTATGCCCCC   2280
       -A--F--T--T--K--G--N--L--K--T--H--Y--S--V--H--R--A--M--P--P-
2281   ACTCAGAGTCCAGCATTCCTGCCCCATCTGTCAGAAGAAGTTCACAAACGCAGTGGTCCT   2340
       -L--R--V--Q--H--S--C--P--I--C--Q--K--K--F--T--N--A--V--V--L-
2341   CCAGCAGCACATCCGTATGCACATGGGAGGCCAGATCCCGAACACCCCGGTCCCTGACAA   2400
       -Q--Q--H--I--R--M--H--M--G--G--Q--I--P--N--T--P--V--P--D--N-
2401   CTACCCCGAGTCCATGGAGTCTGACACAGGCTCCTTCGATGAGAAGAATTTCGATGACTT   2460
       -Y--P--E--S--M--E--S--D--T--G--S--F--D--E--K--N--F--D--D--L-
2461   AGACAACTTCTCAGATGAGAACATGGAAGAGTGTCCTGAGGGCAGCATCCCGGATACGCC   2520
       -D--N--F--S--D--E--N--M--E--E--C--P--E--G--S--I--P--D--T--P-
2521   CAAGTCAGCTGACGCTTCCCAAGACAGCCTGTCGTCTTCACCTCTGCCACTCGAGATGTC   2580
       -K--S--A--D--A--S--Q--D--S--L--S--S--S--P--L--P--L--E--M--S-
2581   CAGCATCGCCGCTTTGGAAAATCAGATGAAGATGATCAACGCTGGCCTGGCCGAGCAGCT   2640
       -S--I--A--A--L--E--N--Q--M--K--M--I--N--A--G--L--A--E--Q--L-
2641   GCAGGCCAGCCTGAAGTCGGTGGAGAACGGGTCAGTGGAAGGAGATGTACTGACCAATGA   2700
       -Q--A--S--L--K--S--V--E--N--G--S--V--E--G--D--V--L--T--N--D-
2701   CTCATCCTCAGTGGGTGGGGATGTGGAGAGCCAGAGTTCGGGCAGCCCAGCCATCTCAGA   2760
       -S--S--S--V--G--G--D--V--E--S--Q--S--S--G--S--P--A--I--S--E-
2761   GTCTACCTCTTCTATGCAGGCTCTGTCCCCATCCAACAGCACCCAAGAGTTCCACAAGTC   2820
       -S--T--S--S--M--Q--A--L--S--P--S--N--S--T--Q--E--F--H--K--S-
2821   ACCCAATGTTGAGGAAAAGCCACAGAGAGTGGGGCCAGGCGAGTTTGCCAATGGCCTGTC   2880
       -P--N--V--E--E--K--P--Q--R--V--G--P--G--E--F--A--N--G--L--S-
2881   TCCCACCCCAGTGAACGGAGGTGCTTTGGACTTGACCTCTAGTCATGCAGAGAAAATCAT   2940
       -P--T--P--V--N--G--G--A--L--D--L--T--S--S--H--A--E--K--I--I-
2941   CAAAGAAGATTCCCTGGGAATCCTCTTCCCTTTCAGAGACCGGGGTAAATTTAAAAACAC   3000
       -K--E--D--S--L--G--I--L--F--P--F--R--D--R--G--K--F--K--N--T-
3001   TGCTTGTGACATTTGTGGCAAAACCTTTGCTTGTCAGAGTGCCTTGGACATTCATTACAG   3060
       -A--C--D--I--C--G--K--T--F--A--C--Q--S--A--L--D--I--H--Y--R-
3061   AAGTCATACCAAAGAGAGACCGTTCATTTGCACAGTTTGCAGTCGTGGCTTTTCCACAAA   3120
       -S--H--T--K--E--R--P--F--I--C--T--V--C--S--R--G--F--S--T--K-
3121   GGGGAATTTGAAGCAGCACATGTTGACACATCAGATGCGAGATCTGCCATCGCAGCTCTT   3180
       -G--N--L--K--Q--H--M--L--T--H--Q--M--R--D--L--P--S--Q--L--F-
3181   TGAGCCCAGTTCCAACCTCGGCCCCAATCAGAACTCTGCGATGATTCCCGCCAGCTCGTT   3240
       -E--P--S--S--N--L--G--P--N--Q--N--S--A--M--I--P--A--S--S--L-
3241   GTCATCTCTCATCAAAACAGAGGTCAACGGCTTTGTGCACGTTTCTCCTCAGGACAGTAA   3300
       -S--S--L--I--K--T--E--V--N--G--F--V--H--V--S--P--Q--D--S--K-
3301   GGATGCCCCCACTAGTCATGTCCCTTCGGGGCCTCTGTCATCCTCTGCGACATCCCCGGT   3360
       -D--A--P--T--S--H--V--P--S--G--P--L--S--S--S--A--T--S--P--V-
3361   TCTGCTCCCAGCTCTGCCCCGGAGAACCCCCAAACAGCACTATTGTAACACATGTGGTAA   3420
       -L--L--P--A--L--P--R--R--T--P--K--Q--H--Y--C--N--T--C--G--K-
3421   AACCTTCTCTTCCTCGAGTGCCCTGCAGATCCACGAGAGAACTCACACTGGAGAGAAGCC   3480
       -T--F--S--S--S--S--A--L--Q--I--H--E--R--T--H--T--G--E--K--P-
3481   CTTTGCTTGCACTATCTGTGGAAGAGCATTCACAACGAAAGGCAATCTGAAGGTCCACAT   3540
       -F--A--C--T--I--C--G--R--A--F--T--T--K--G--N--L--K--V--H--M-
3541   GGGCACTCATATGTGGAACAGTACCCCTGCACGCCGGGGCCGCCGGCTCTCAGTGGATGG   3600
       -G--T--H--M--W--N--S--T--P--A--R--R--G--R--R--L--S--V--D--G-
3601   CCCCATGACATTTCTAGGAGGGAATCCTGTCAAGTTCCCAGAAATGTTCCAGAAGGATCT   3660
       -P--M--T--F--L--G--G--N--P--V--K--F--P--E--M--F--Q--K--D--L-
3661   GGCGGCGAGGTCAGGAAGCGGGGATCCGTCCAGCTTTTGGAACCAGTATACAGCAGCACT   3720
       -A--A--R--S--G--S--G--D--P--S--S--F--W--N--Q--Y--T--A--A--L-
3721   GTCCAACGGGCTGGCCATGAAGGCCAACGAGATCTCTGTCATTCAGAATGGTGGCATCCC   3780
       -S--N--G--L--A--M--K--A--N--E--I--S--V--I--Q--N--G--G--I--P-
3781   TCCAATTCCTGGAAGCCTGGGCAACGGGAGCAGCTCACCTATCAGCGGGCTGACAGGGAA   3840
       -P--I--P--G--S--L--G--N--G--S--S--S--P--I--S--G--L--T--G--N-
3841   CGTGGAAAAGCTGGGGAATTCGGAACCCAGTGCTCCCCTGGCTGGTCTGGAGAAAATGGC   3900
       -V--E--K--L--G--N--S--E--P--S--A--P--L--A--G--L--E--K--M--A-
3901   GAGCAGCGAGAACGGAACCAACTTCCGTTTCACCCGCTTCGTGGAGGACAGCAAAGAGAT   3960
       -S--S--E--N--G--T--N--F--R--F--T--R--F--V--E--D--S--K--E--I-
3961   CGTCACGAGCTAAagctgccagagcgtttctactcaaaatgccgcccgaggttgcctcct   4020
       -V--T--S--***...............................................
4021   gcccccgccccttaccttctggcccctgggactatgaactacattatgaagacattcttt   4080
       ............................................................
4081   tgtacgttgttcaacctctagagttctaagaaagcttatttattagtgctataaccttgc   4140
       ............................................................
4141   tttgcaaacagagtgcaagcattaactttggtcttctgtattttggactaaatactaatg   4200
       ............................................................
4201   gactagagtgctctaagcttgctgtaacatttatggcaatcgcaagttgccctgctaggc   4260
       ............................................................
4261   ggtcttaatctggcattaacttattttctatatccagtttaatatgaatctggtgttgat   4320
       ............................................................
4321   gcaatgcctccgtgatacgttagatctctaataaagtctgtatataaatgtacactttga   4380
       ............................................................
4381   tcctgctggaaaattttatcagcaaacacattgtctaatctttccaaacagatttaaggg   4440
       ............................................................
4441   aaggacttttaagtacaaggctgaacatttgaaaggcttagggtttttgttgttgttgtt   4500
       ............................................................
4501   tgtttgtttgtttgttttgggttttgttttcattttgattctgaacttcaacctgctttt   4560
       ............................................................
4561   ttttgtttgtttgtttttgttggttttgttttgaagagttaaccatttccgttttgaacc   4620
       ............................................................
4621   attcgtattgtgctttttacttgagtcgtcttcgatgttaaccagtttctgtacagtaat   4680
       ............................................................
4681   aagcacgcagaattctttagagggaaaaaaaaccccacaagtgttgttttggtagttgaa   4740
       ............................................................
4741   actgagatgtagcatttttgccttgtagggtatcttcacagtagaaaaagacgtgtgctg   4800
       ............................................................
4801   ggatttcacaatgctgctaacgatagcatcttgaacgaccttcagtggagaaatgtagat   4860
       ............................................................
4861   gctcttgtatatacaataagaaatatccctttcattaaaatgtacatatgtcccttacaa   4920
       ............................................................
4921   gagcaaatgctccttgataagagcaggtataatgttggtttattttgtattagatatggg   4980
       ............................................................
4981   aggaaagaaatggactgttacatgcactttcttggaaagttgaaagggggggttccaatt   5040
       ............................................................
5041   tctttaacatttaatacttactaacaacagagatactgtaattttactcaagtaatcaaa   5100
       ............................................................
5101   tacattttttttgcaacagataaa                                       5160
       ........................