Rattus norvegicus: Itga1

Integrin subunit alpha 1
Albert et al, Genome Biol, 24: 48, 2023
Species	Gene	Aliases	Location	Status	Expressed Allele
Rattus norvegicus	Itga1		2q14	Imprinted	Maternal
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1      aaggcagatgtccctttaaggtttgctttgctgctgcccgtggactttagcctaaacagg     60
       ............................................................
61     gtcccgcgaagttggctttatttgtccatgtctcggacacagcctgggtagctgccagtg    120
       ............................................................
121    agatttcagggacggagcgcgcaaaggggggggaaatgtggcaatccatctgggatgtga    180
       ............................................................
181    gacgcgtggagagggcttagcagcatttgaccaaaacacaggaaatcactcctccacagc    240
       ............................................................
241    tcctgggcgcagcagcggctggggccactgccggacaccctcggagaccacacgagtgac    300
       ............................................................
301    ccagagcgcaagtcgccagcgtcccggttctgcctgttcctgccagctcctgcccacgaa    360
       ............................................................
361    ccggcacgtagctggttccagcagccgctccagcaATGGTCCCCAGGCGTCCTGCCAGCC    420
       ...................................M--V--P--R--R--P--A--S--L
421    TAGAGGTCACTGTAGCCTGCATATGGCTTCTCACGGTCATCCTAGGCTTCTGCGTCTCCT    480
       --E--V--T--V--A--C--I--W--L--L--T--V--I--L--G--F--C--V--S--F
481    TCAATGTTGATGTGAAAAACTCAATGAGTTTCAGTGGCCCAGTAGAGGACATGTTTGGAT    540
       --N--V--D--V--K--N--S--M--S--F--S--G--P--V--E--D--M--F--G--Y
541    ACACTGTTCAACAATATGAAAACGAAGAAGGCAAATGGGTTCTTATTGGTTCTCCTTTAG    600
       --T--V--Q--Q--Y--E--N--E--E--G--K--W--V--L--I--G--S--P--L--V
601    TTGGCCAACCCAAAGCAAGAACTGGAGATGTCTATAAGTGTCCGGTTGGGAGAGAGAGAG    660
       --G--Q--P--K--A--R--T--G--D--V--Y--K--C--P--V--G--R--E--R--A
661    CAATGCCTTGCGTGAAGTTGGACTTGCCAGTTAACACATCGATCCCCAATGTCACAGAAA    720
       --M--P--C--V--K--L--D--L--P--V--N--T--S--I--P--N--V--T--E--I
721    TAAAGGAAAACATGACATTTGGATCAACTTTAGTCACCAACCCGAATGGAGGATTTCTGG    780
       --K--E--N--M--T--F--G--S--T--L--V--T--N--P--N--G--G--F--L--A
781    CATGTGGGCCCTTGTATGCCTATAGATGTGGACATTTGCATTATACAACTGGAATATGTT    840
       --C--G--P--L--Y--A--Y--R--C--G--H--L--H--Y--T--T--G--I--C--S
841    CTGATGTCAGTCCTACATTTCAAGTTGTGAACTCCTTTGCCCCTGTACAAGAATGCAGCA    900
       --D--V--S--P--T--F--Q--V--V--N--S--F--A--P--V--Q--E--C--S--T
901    CCCAGCTGGACATAGTCATCGTCCTGGATGGCTCCAACAGCATCTACCCCTGGGAAAGTG    960
       --Q--L--D--I--V--I--V--L--D--G--S--N--S--I--Y--P--W--E--S--V
961    TCATCGCCTTTTTAAACGACCTTCTTAAGAGGATGGATATTGGCCCTAAGCAGACACAGG   1020
       --I--A--F--L--N--D--L--L--K--R--M--D--I--G--P--K--Q--T--Q--V
1021   TCGGGATTGTACAGTATGGAGAGAATGTAACCCATGAGTTCAACCTCAATAAGTATTCAT   1080
       --G--I--V--Q--Y--G--E--N--V--T--H--E--F--N--L--N--K--Y--S--S
1081   CCACAGAAGAGGTCCTTGTCGCAGCAAACAAAATAGGCCGACAGGGAGGCCTCCAAACGA   1140
       --T--E--E--V--L--V--A--A--N--K--I--G--R--Q--G--G--L--Q--T--M
1141   TGACAGCCCTTGGAATAGACACAGCCAGGAAAGAGGCATTCACTGAAGCTCGGGGTGCCA   1200
       --T--A--L--G--I--D--T--A--R--K--E--A--F--T--E--A--R--G--A--R
1201   GGAGGGGAGTTAAAAAAGTCATGGTTATTGTGACCGACGGAGAATCGCATGACAACTATC   1260
       --R--G--V--K--K--V--M--V--I--V--T--D--G--E--S--H--D--N--Y--R
1261   GCCTGAAACAGGTCATCCAAGACTGCGAGGACGAAAACATTCAGCGATTTTCCATAGCTA   1320
       --L--K--Q--V--I--Q--D--C--E--D--E--N--I--Q--R--F--S--I--A--I
1321   TCCTTGGCCACTATAACAGGGGGAACTTAAGCACTGAAAAATTTGTGGAGGAAATAAAAT   1380
       --L--G--H--Y--N--R--G--N--L--S--T--E--K--F--V--E--E--I--K--S
1381   CGATCGCAAGCGAGCCCACGGAAAAGCACTTCTTCAATGTCTCGGATGAGTTGGCCCTGG   1440
       --I--A--S--E--P--T--E--K--H--F--F--N--V--S--D--E--L--A--L--V
1441   TCACTATTGTTAAAGCTCTGGGAGAAAGGATATTCGCTTTGGAAGCGACAGCTGACCAGT   1500
       --T--I--V--K--A--L--G--E--R--I--F--A--L--E--A--T--A--D--Q--S
1501   CAGCAGCTTCATTTGAGATGGAAATGTCTCAGACTGGCTTCAGTGCTCACTACTCCCAGG   1560
       --A--A--S--F--E--M--E--M--S--Q--T--G--F--S--A--H--Y--S--Q--D
1561   ACTGGGTCATGCTTGGAGCGGTGGGAGCCTATGACTGGAACGGAACTGTGGTCATGCAGA   1620
       --W--V--M--L--G--A--V--G--A--Y--D--W--N--G--T--V--V--M--Q--K
1621   AGGCTAACCAGATGGTCATCCCTCATAACACCACCTTTCAAACTGAGCCCGCCAAGATGA   1680
       --A--N--Q--M--V--I--P--H--N--T--T--F--Q--T--E--P--A--K--M--N
1681   ACGAGCCTCTGGCTTCTTATTTAGGTTACACAGTGAACTCGGCCACCATCCCTGGAGATG   1740
       --E--P--L--A--S--Y--L--G--Y--T--V--N--S--A--T--I--P--G--D--V
1741   TGCTCTACATCGCTGGGCAGCCTCGGTACAATCATACGGGCCAGGTCGTCATCTACAAGA   1800
       --L--Y--I--A--G--Q--P--R--Y--N--H--T--G--Q--V--V--I--Y--K--M
1801   TGGAGGATGGGAACATCAACATTCTGCAGACACTCGGCGGAGAGCAGATTGGTTCCTACT   1860
       --E--D--G--N--I--N--I--L--Q--T--L--G--G--E--Q--I--G--S--Y--F
1861   TTGGTAGTGTCTTAACAACAATTGACATCGACAAAGATTCTTATACTGATCTGCTTCTCG   1920
       --G--S--V--L--T--T--I--D--I--D--K--D--S--Y--T--D--L--L--L--V
1921   TCGGGGCCCCCATGTACATGGGGACAGAGAAAGAGGAACAGGGCAAGGTGTACGTGTACG   1980
       --G--A--P--M--Y--M--G--T--E--K--E--E--Q--G--K--V--Y--V--Y--A
1981   CTGTGAATCAGACAAGGTTTGAATATCAAATGAGCCTGGAACCAATTAGGCAGACCTGCT   2040
       --V--N--Q--T--R--F--E--Y--Q--M--S--L--E--P--I--R--Q--T--C--C
2041   GCTCATCCCTGAAGGATAATTCATGCACGAAAGAAAACAAGAATGAGCCCTGCGGGGCCC   2100
       --S--S--L--K--D--N--S--C--T--K--E--N--K--N--E--P--C--G--A--R
2101   GCTTCGGAACAGCAATTGCTGCTGTAAAAGACCTCAACGTGGATGGATTTAATGACGTCG   2160
       --F--G--T--A--I--A--A--V--K--D--L--N--V--D--G--F--N--D--V--V
2161   TGATTGGAGCTCCGCTGGAAGATGACCACGCAGGAGCTGTGTACATTTATCATGGCAGTG   2220
       --I--G--A--P--L--E--D--D--H--A--G--A--V--Y--I--Y--H--G--S--G
2221   GCAAGACCATAAGGGAGGCGTATGCACAACGCATTCCATCAGGTGGGGATGGCAAGACCC   2280
       --K--T--I--R--E--A--Y--A--Q--R--I--P--S--G--G--D--G--K--T--L
2281   TGAAATTTTTCGGCCAGTCTATCCACGGAGAGATGGATTTAAATGGTGACGGTCTGACTG   2340
       --K--F--F--G--Q--S--I--H--G--E--M--D--L--N--G--D--G--L--T--D
2341   ACGTGACCATTGGAGGCCTTGGTGGAGCAGCCCTCTTCTGGGCCAGAGATGTGGCTGTAG   2400
       --V--T--I--G--G--L--G--G--A--A--L--F--W--A--R--D--V--A--V--V
2401   TTAAAGTGACCATGAATTTTGAACCCAATAAAGTGAATATTCAAAAGAAAAACTGCCGTG   2460
       --K--V--T--M--N--F--E--P--N--K--V--N--I--Q--K--K--N--C--R--V
2461   TGGAGGGCAAAGAAACAGTGTGCATAAATGCTACAATGTGTTTTCATGTGAAATTAAAGT   2520
       --E--G--K--E--T--V--C--I--N--A--T--M--C--F--H--V--K--L--K--S
2521   CTAAAGAGGACTCAATTTACGAGGCTGATCTGCAGTACCGTGTCACCCTTGATTCACTGA   2580
       --K--E--D--S--I--Y--E--A--D--L--Q--Y--R--V--T--L--D--S--L--R
2581   GGCAGATATCACGGAGCTTTTTTTCTGGAACTCAGGAAAGGAAGATTCAAAGAAATATCA   2640
       --Q--I--S--R--S--F--F--S--G--T--Q--E--R--K--I--Q--R--N--I--T
2641   CCGTTCGAGAATCAGAATGCATCAGGCACTCCTTCTACATGTTGGACAAACATGACTTTC   2700
       --V--R--E--S--E--C--I--R--H--S--F--Y--M--L--D--K--H--D--F--Q
2701   AGGACTCTGTGAGAGTGACTCTGGATTTTAATCTCACTGATCCAGAAAATGGTCCTGTAC   2760
       --D--S--V--R--V--T--L--D--F--N--L--T--D--P--E--N--G--P--V--L
2761   TTGATGACGCTCTGCCAAACTCAGTCCACGAACACATTCCCTTTGCCAAAGACTGTGGAA   2820
       --D--D--A--L--P--N--S--V--H--E--H--I--P--F--A--K--D--C--G--N
2821   ACAAGGAAAGATGCATTTCAGACCTCACTCTGAATGTGTCCACCACAGAAAAGAGCCTGC   2880
       --K--E--R--C--I--S--D--L--T--L--N--V--S--T--T--E--K--S--L--L
2881   TGATCGTCAAGTCCCAGCATGACAAGTTCAACGTTAGCCTCACCGTCAAAAACAAAGGAG   2940
       --I--V--K--S--Q--H--D--K--F--N--V--S--L--T--V--K--N--K--G--D
2941   ACAGTGCGTACAACACCAGGACAGTGGTGCAGCATTCACCAAATCTGATTTTTTCGGGAA   3000
       --S--A--Y--N--T--R--T--V--V--Q--H--S--P--N--L--I--F--S--G--I
3001   TTGAGGAGATCCAAAAAGATAGCTGTGAATCTAATCAAAATATCACTTGCAGAGTTGGAT   3060
       --E--E--I--Q--K--D--S--C--E--S--N--Q--N--I--T--C--R--V--G--Y
3061   ATCCTTTCCTAAGAGCAGGAGAAACGGTTACCTTCAAAATAATATTCCAGTTTAACACAT   3120
       --P--F--L--R--A--G--E--T--V--T--F--K--I--I--F--Q--F--N--T--S
3121   CCCATCTCTCGGAAAATGCAATCATTCACTTAAGTGCAACAAGTGACAGTGAGGAGCCCC   3180
       --H--L--S--E--N--A--I--I--H--L--S--A--T--S--D--S--E--E--P--L
3181   TGGAATCTCTTAATGATAATGAAGTAAATATTTCCATCCCAGTAAAATATGAAGTTGGAC   3240
       --E--S--L--N--D--N--E--V--N--I--S--I--P--V--K--Y--E--V--G--L
3241   TGCAGTTTTACAGTTCTGCGAGTGAACATCACATTTCAGTCGCTGCCAATGAGACGATCC   3300
       --Q--F--Y--S--S--A--S--E--H--H--I--S--V--A--A--N--E--T--I--P
3301   CTGAGTTTATTAACTCCACTGAGGACATTGGGAATGAAATTAATGTCTTCTATACGATTA   3360
       --E--F--I--N--S--T--E--D--I--G--N--E--I--N--V--F--Y--T--I--R
3361   GAAAGAGGGGGCATTTCCCAATGCCAGAACTTCAGCTGTCAATTTCATTCCCCAATTTGA   3420
       --K--R--G--H--F--P--M--P--E--L--Q--L--S--I--S--F--P--N--L--T
3421   CGGCAGATGGTTATCCTGTACTGTACCCAATTGGATGGTCATCTTCAGATAATGTGAACT   3480
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3481   GTAGACCCCGGAGCCTTGAGGACCCCTTTGGCATCAACTCTGGGAAGAAAATGACAATAT   3540
       --R--P--R--S--L--E--D--P--F--G--I--N--S--G--K--K--M--T--I--S
3541   CGAAGTCTGAGGTTCTCAAAAGAGGCACAATCCAGGACTGCAGTAGTACGTGTGGAGTTG   3600
       --K--S--E--V--L--K--R--G--T--I--Q--D--C--S--S--T--C--G--V--A
3601   CCACCATCACGTGTAGCCTCCTTCCTTCCGACCTGAGTCAAGTGAATGTCTCGCTCCTCC   3660
       --T--I--T--C--S--L--L--P--S--D--L--S--Q--V--N--V--S--L--L--L
3661   TGTGGAAACCGACTTTCATAAGAGCACATTTTTCCAGCTTAAACCTTACTCTAAGAGGAG   3720
       --W--K--P--T--F--I--R--A--H--F--S--S--L--N--L--T--L--R--G--E
3721   AACTTAAGAGTGAAAATTCATCGCTGACTTTAAGTAGCAGCAACCGGAAGCGAGAGCTGG   3780
       --L--K--S--E--N--S--S--L--T--L--S--S--S--N--R--K--R--E--L--A
3781   CTATTCAGATATCCAAAGACGGGCTCCCAGGCAGAGTGCCGCTGTGGGTTATCCTCCTGA   3840
       --I--Q--I--S--K--D--G--L--P--G--R--V--P--L--W--V--I--L--L--S
3841   GCGCCTTCGCGGGGCTACTGCTGCTAATGCTCCTTATATTGGCTCTGTGGAAGATTGGAT   3900
       --A--F--A--G--L--L--L--L--M--L--L--I--L--A--L--W--K--I--G--F
3901   TCTTCAAAAGGCCACTGAAGAAGAAAATGGAGAAATGAaaggtttcatagaaaaaaaaaa   3960
       --F--K--R--P--L--K--K--K--M--E--K--***......................
3961   aaa                                                            4020
       ...
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