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Rattus norvegicus: Cdc42ep1

CDC42 effector protein 1

Albert et al, Genome Biol, 24: 48, 2023

Species Gene Aliases Location Status Expressed Allele
Rattus norvegicus Cdc42ep1   7q34  Imprinted Maternal
1      tcttcatcgagaggaaggggctaaaaggatccctgaacccaggctgccatcttccctggc     60
       ............................................................
61     cccaaggtggcatggactagcagttgtaagcaaccaaagctgATGCCCGGCCCCCAAGGG    120
       ..........................................M--P--G--P--Q--G--
121    GGCACAGGAGCCCCCAGCATGAGCCTGGGTAAGCTGTCTCCTGTGGGCTGGGTGCCCAGT    180
       G--T--G--A--P--S--M--S--L--G--K--L--S--P--V--G--W--V--P--S--
181    TCTCATGGAAAGAGGCGCCTGACAGCAGACATGATCAGTCCCCCGCTCGGGGACTTCCGC    240
       S--H--G--K--R--R--L--T--A--D--M--I--S--P--P--L--G--D--F--R--
241    CACACCATGCACGTGGGCCGTGGCGGGGACGTCTTCGGTGATACCTCCTTCCTCAGCAAC    300
       H--T--M--H--V--G--R--G--G--D--V--F--G--D--T--S--F--L--S--N--
301    CACGGAGGCCGCTCTGGAAACACCCACCGCTCGCCCCGAAGTTTTCTGGCCAGGAAGCTC    360
       H--G--G--R--S--G--N--T--H--R--S--P--R--S--F--L--A--R--K--L--
361    CAGCAGGTACGCAGAGTCGGCGTGCCCCCTCGAAGGATGGCTTCCCCGGCTGCAACGTCA    420
       Q--Q--V--R--R--V--G--V--P--P--R--R--M--A--S--P--A--A--T--S--
421    CCCGCCCCGCCTCCCATCTCTCCCATCATCAAGAATGCCATCTCCCTGCCCCAGCTCAAC    480
       P--A--P--P--P--I--S--P--I--I--K--N--A--I--S--L--P--Q--L--N--
481    CAGGCCACCTATGACAGCCTGGTGGTGAGCAAGCTGAGCTTTGATAGCACTCCGGCTAGC    540
       Q--A--T--Y--D--S--L--V--V--S--K--L--S--F--D--S--T--P--A--S--
541    TCCACGGATGGCCGCTCCGGTTACGGCCTGGAGTCTGGGTTCTGCACCATCTCACGCCTT    600
       S--T--D--G--R--S--G--Y--G--L--E--S--G--F--C--T--I--S--R--L--
601    CCACGAGTGGAAAAACACAGCAGCCGTGACCGTGACCATGACCGTGACCCGGACCATTCT    660
       P--R--V--E--K--H--S--S--R--D--R--D--H--D--R--D--P--D--H--S--
661    CAAGACCGAGAGCAAAGTTCTTCCCCCTCTGAGCCTAACCCTAACCCTGAGCTTCGACGC    720
       Q--D--R--E--Q--S--S--S--P--S--E--P--N--P--N--P--E--L--R--R--
721    TCTGACTCTCTCTTGTCCTTCCGTTTTGACCTTGACCTTGGGCCCTCACTCCTCAGTGAG    780
       S--D--S--L--L--S--F--R--F--D--L--D--L--G--P--S--L--L--S--E--
781    CTGCTAGGAGTCATGAGCCTTTCAGAAGCCCCTGCTGCCAACCCCCCTGCTCCTGCTGCC    840
       L--L--G--V--M--S--L--S--E--A--P--A--A--N--P--P--A--P--A--A--
841    AACCCTGCCCCTACTGCAAAACCCCCAGCCGATGCAGTAACCACTCTAGACACTGTGACA    900
       N--P--A--P--T--A--K--P--P--A--D--A--V--T--T--L--D--T--V--T--
901    AGCCTTCCAGCCCCCACGGCAAGCTCCCCATCCAGTGGACGTTTCCCCAATGGGGTAACT    960
       S--L--P--A--P--T--A--S--S--P--S--S--G--R--F--P--N--G--V--T--
961    GCCGTGTTGGGCCCCGTGGCTGAGGTAAAGGCCAGTCCTGTGGGAGAGGGTCCCCAGGTA   1020
       A--V--L--G--P--V--A--E--V--K--A--S--P--V--G--E--G--P--Q--V--
1021   CCCTCCAAAATGGCCTTTGACAGGCGTGGAGCCAGCTGGGGGGCCATCCGGGCCAGCCGT   1080
       P--S--K--M--A--F--D--R--R--G--A--S--W--G--A--I--R--A--S--R--
1081   CACTACACGGAGATGGATGCGCGGCGGGAGCTGGCAGGGGTCCTACCCCAAGTCCATGGC   1140
       H--Y--T--E--M--D--A--R--R--E--L--A--G--V--L--P--Q--V--H--G--
1141   TCCTGGGAGAGTCTGAATGAAGAATGGAGTGCACCTCCGGCCAGCAGCAGGGCTCCTGTG   1200
       S--W--E--S--L--N--E--E--W--S--A--P--P--A--S--S--R--A--P--V--
1201   CCCAGCACGGTGCAGGCCAATGCCTTTGAGTTTGCTGACGCTGATGAGGATGACGAGGTC   1260
       P--S--T--V--Q--A--N--A--F--E--F--A--D--A--D--E--D--D--E--V--
1261   AAGGTGTGAgagactggccgtgggcccaggtcctgccagcctaggggctcacacagaagg   1320
       K--V--***...................................................
1321   gctgagttaatttccttaacgactgcgtctgtcctcaagacatggtcacctgcccaacgg   1380
       ............................................................
1381   gagttgccccaaatccttcctgctctatgcaaggcaggcttggatgtggggagggtccct   1440
       ............................................................
1441   gctgacctgacccagctccctccatgcccctaggcccactagccctttagtcataacata   1500
       ............................................................
1501   tgccacccccctgtggcctgacagtatggcctttgtgccccaagatgtttccctggtggg   1560
       ............................................................
1561   tgggggtggggcaaggaccacacagggccattgtctgagtgggactgcctgcccctgctc   1620
       ............................................................
1621   atggagagctgccgcagaaggccaccactgtgttttcaatagctggttccaggcttctcc   1680
       ............................................................
1681   tcagttccctgagaaaggtcaggtgtgacctctaagtagattctatcttatgtgtacccc   1740
       ............................................................
1741   agagctgcctcccatgcctgattgtaaaagcctttctggtaagatctgtctgcccaagga   1800
       ............................................................
1801   ggcaggccttggcccctgccgaggtgtactttatcctcctgggagtttggaaagttgagg   1860
       ............................................................
1861   acccccttccagcaacccccctccagctaggagaggggggccagacgaggtaatgagtaa   1920
       ............................................................
1921   ccagcctggaatgttggaagataagaggcccaggtgggacccttatctccagttcctgga   1980
       ............................................................
1981   acacccctgccccaggtgccaggaaccagtatctgccccataatcccatggggcagcttg   2040
       ............................................................
2041   gcaggtgctcagatcacccggagagagacaggttcccatgcacagggtggctcaggatca   2100
       ............................................................
2101   cctcccgtcctcttctcttggcaatgctataccctgtgcctcagtttcctcccctgcacc   2160
       ............................................................
2161   aaagacggggagcattaacacttatggaaagtgctaacagttcttgctgtggaaataata   2220
       ............................................................
2221   aaaatggattcttttaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaa                    2280
       ...........................................