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Homo sapiens: HOXA3

Homeobox A3

Luedi et al. Genome Res. 17: , 2007 PDF; Luedi et al. Genome Res. 17: , 2007 Supplement

Species Gene Aliases Location Status Expressed Allele
Homo sapiens HOXA3 HOX1, HOX1E, MGC10155  7p15-p14  Predicted Maternal
1      tctcactagcctcagagcactctcagaagttcagaaactaagaccagaaaagagaagatt     60
       ............................................................
61     tttagacagctcatgaaacggtctgcgcggggcggccattggcggcggagtgtcacgtga    120
       ............................................................
121    ccgcgggggcgtgccaatgtgcgccctcacgggtgtcaaacccctgtcagagtgtgcgat    180
       ............................................................
181    caagatcgtgaaacaacgcgATGCAAAAAGCGACCTACTACGACAGCTCGGCGATCTACG    240
       ....................M--Q--K--A--T--Y--Y--D--S--S--A--I--Y--G
241    GTGGCTACCCCTACCAGGCAGCCAACGGGTTCGCTTATAATGCCAATCAGCAGCCGTACC    300
       --G--Y--P--Y--Q--A--A--N--G--F--A--Y--N--A--N--Q--Q--P--Y--P
301    CGGCGTCCGCCGCTTTGGGCGCCGACGGCGAGTACCACCGACCCGCCTGCTCCCTCCAGT    360
       --A--S--A--A--L--G--A--D--G--E--Y--H--R--P--A--C--S--L--Q--S
361    CTCCCTCCAGCGCCGGGGGCCACCCCAAGGCACACGAACTGAGTGAGGCGTGCCTGCGCA    420
       --P--S--S--A--G--G--H--P--K--A--H--E--L--S--E--A--C--L--R--T
421    CCCTGAGCGCCCCACCTAGCCAGCCTCCAAGCCTGGGAGAGCCGCCCCTGCACCCGCCGC    480
       --L--S--A--P--P--S--Q--P--P--S--L--G--E--P--P--L--H--P--P--P
481    CGCCCCAGGCCGCGCCCCCTGCCCCACAGCCGCCTCAGCCCGCACCTCAGCCCCCTGCAC    540
       --P--Q--A--A--P--P--A--P--Q--P--P--Q--P--A--P--Q--P--P--A--P
541    CTACCCCTGCCGCGCCCCCGCCTCCCTCTTCTGCCTCCCCTCCTCAGAATGCCAGCAACA    600
       --T--P--A--A--P--P--P--P--S--S--A--S--P--P--Q--N--A--S--N--N
601    ACCCTACCCCTGCCAACGCGGCCAAGAGCCCCCTGCTCAACTCACCCACAGTGGCCAAAC    660
       --P--T--P--A--N--A--A--K--S--P--L--L--N--S--P--T--V--A--K--Q
661    AAATCTTCCCCTGGATGAAAGAGTCTCGACAAAACACAAAGCAGAAAACCAGCAGCTCCA    720
       --I--F--P--W--M--K--E--S--R--Q--N--T--K--Q--K--T--S--S--S--S
721    GCTCAGGCGAAAGCTGCGCTGGCGACAAGAGCCCGCCGGGGCAGGCTTCGTCCAAGCGCG    780
       --S--G--E--S--C--A--G--D--K--S--P--P--G--Q--A--S--S--K--R--A
781    CGCGCACGGCCTACACGAGCGCGCAGCTGGTGGAGCTGGAGAAAGAGTTCCACTTCAACC    840
       --R--T--A--Y--T--S--A--Q--L--V--E--L--E--K--E--F--H--F--N--R
841    GCTACCTGTGCCGGCCGCGCCGGGTGGAGATGGCCAATCTGCTGAACCTCACTGAGCGCC    900
       --Y--L--C--R--P--R--R--V--E--M--A--N--L--L--N--L--T--E--R--Q
901    AGATCAAGATCTGGTTCCAGAATCGCCGCATGAAGTACAAAAAGGATCAGAAGGGCAAGG    960
       --I--K--I--W--F--Q--N--R--R--M--K--Y--K--K--D--Q--K--G--K--G
961    GCATGCTAACGTCATCGGGGGGCCAGTCTCCAAGTCGCAGCCCCGTGCCCCCCGGAGCCG   1020
       --M--L--T--S--S--G--G--Q--S--P--S--R--S--P--V--P--P--G--A--G
1021   GTGGCTATCTGAACTCTATGCATTCGCTGGTCAACAGCGTCCCGTATGAGCCCCAGTCGC   1080
       --G--Y--L--N--S--M--H--S--L--V--N--S--V--P--Y--E--P--Q--S--P
1081   CCCCGCCCTTCTCCAAGCCCCCCCAGGGTACCTACGGGCTGCCCCCCGCCTCCTACCCTG   1140
       --P--P--F--S--K--P--P--Q--G--T--Y--G--L--P--P--A--S--Y--P--A
1141   CGTCCCTGCCCAGCTGCGCACCCCCGCCACCCCCACAGAAGCGCTACACGGCGGCAGGGG   1200
       --S--L--P--S--C--A--P--P--P--P--P--Q--K--R--Y--T--A--A--G--A
1201   CGGGCGCAGGGGGCACCCCCGACTATGACCCGCACGCTCATGGCCTGCAGGGCAACGGCA   1260
       --G--A--G--G--T--P--D--Y--D--P--H--A--H--G--L--Q--G--N--G--S
1261   GCTATGGGACCCCACACATACAGGGAAGCCCCGTCTTCGTGGGGGGCAGCTATGTGGAGC   1320
       --Y--G--T--P--H--I--Q--G--S--P--V--F--V--G--G--S--Y--V--E--P
1321   CCATGAGCAACTCCGGGCCAGCCCTCTTTGGTCTAACTCACCTCCCCCACGCTGCCTCGG   1380
       --M--S--N--S--G--P--A--L--F--G--L--T--H--L--P--H--A--A--S--G
1381   GCGCCATGGACTATGGGGGTGCCGGGCCGCTGGGCAGCGGCCACCACCACGGGCCGGGGC   1440
       --A--M--D--Y--G--G--A--G--P--L--G--S--G--H--H--H--G--P--G--P
1441   CTGGGGAGCCGCACCCCACCTACACGGACCTTACCGGCCACCATCCTTCTCAGGGAAGAA   1500
       --G--E--P--H--P--T--Y--T--D--L--T--G--H--H--P--S--Q--G--R--I
1501   TTCAGGAAGCACCCAAGCTCACCCACCTGTGAtagtgggcttggggctacgcgccaggag   1560
       --Q--E--A--P--K--L--T--H--L--***............................
1561   agtctccccccacccaccttttttctttggttgcttttttttttttttttttttaggttc   1620
       ............................................................
1621   ttcctgccctttccttccttccttttctctcttctccgccccgcactccgtttcccggtt   1680
       ............................................................
1681   tcccccctcgttggtaaggcgtttttatagtttatgtgacgtagcaatcttggttgctgg   1740
       ............................................................
1741   aatggctgtatcatagcgatatttatctcttcctgctcctcgataggccactggccctgc   1800
       ............................................................
1801   accctttaccttctccactctttgatcagaaacagggtatatgaacaaattttctagtcg   1860
       ............................................................
1861   agttttcaatgtgaatttgttcttacattatggctcccgaggggaagcgattactttttt   1920
       ............................................................
1921   taattttaaattttttttttaattgcacttcttgtaaagagtgagaaaaaaaatcaaagg   1980
       ............................................................
1981   cgctttgaaacaggggctctctgtgcaaggatgactaagtgtacgtctttccgtgtgtgt   2040
       ............................................................
2041   atgctggtgaacagtcagatttatttatatttttttgcaagcattgaataatctaagttt   2100
       ............................................................
2101   taaatattatttatccccatccgttcgtatttatattaaagaattctgtaccctgatggt   2160
       ............................................................
2161   tcagaagggttcttgggccttttgttcaattgtgtattggcgtacttagaatttttttta   2220
       ............................................................
2221   tttgaaagagaaatataattcctttaaacggtaacgatacaataaaaccagagaagatcc   2280
       ............................................................
2281   agcttttgaaaacagtgatttaggtttgtaacatccggcaaaactgaaaaaaaaaatctg   2340
       ............................................................
2341   taaacgcgaaaaatactagatttgttttgagagttcttcattccttgctgctcacattct   2400
       ............................................................
2401   gagaaacaaaaagaaataaagtttttattctgaataatatccgtgttaagaaggggttct   2460
       ............................................................
2461   ttggccgaagacgtgggtctgcgtggaattcaggccgaggcgagccggcagagcaggccg   2520
       ............................................................
2521   gacgcagcagccctctggctccagcatggggcctggccaggctattcgcctggaagctcg   2580
       ............................................................
2581   gcgaattctcaggatggcggctggggctccaggcggctgcggcagctctggtaacgccgt   2640
       ............................................................
2641   gcggcgggccagctgggctgcccggttcccagctgctgcggaggcaggctgagggcgcag   2700
       ............................................................
2701   gggctgccgagtgctgtgcacggaagaaacaaagacatcccggcccaaggcgcagcggga   2760
       ............................................................
2761   gcgcacaggtgccccgcggcccagccgggggataacgcagggcggtcttctgctccatgc   2820
       ............................................................
2821   tcttcctcgggtcaaagcggaccaactaacgcctaaacctcggtattagccagccgcgca   2880
       ............................................................
2881   gaggatgccgagcactttccgggagcaatcggactcctggtctcctccggggatgcttcg   2940
       ............................................................
2941   cggtctgttatcgcgtcaggaggaaagaattgctccaaaaatctgcacgcggagcgaaac   3000
       ............................................................
3001   agtttgaaagggactgaggctcacccaggtctccagcaaacggaggactgaactggggag   3060
       ............................................................
3061   agtcaccctgagccagcccttccctggactgccggaatcccagcattagcttcctgctga   3120
       ............................................................
3121   atgtagtatttggcattctctgaatttatttcctctccttcccccacccagctttctttt   3180
       ............................................................
3181   tatggccccagggggagggggagagagcaaggagatcggtatctttgtaataaaactgca   3240
       ............................................................
3241   attttataaatttttca                                              3300
       .................