Imprinted Gene Databases

Mus musculus: Fam50b

Family with sequence similarity 50, member B

Nakabayashi et al, Hum Mol Genet, 20: 3188–3197, 2011

Species Gene Aliases Location Status Expressed Allele
Homo sapiens FAM50B X5L, D6S2654E  6p25.2  Imprinted Paternal
Mus musculus Fam50b X5L, D0H6S2654E, XAP-5-like  13 14.18 cM  Not Imprinted Biallelic 
1      gcttggaaaggacatgagggcaatgggagcatgaggcagaagaaagctattcccttcatg     60
       ............................................................
61     gtcagtcaggaagcagagcaacacaggagggggtggatacaacatacccactaaggaacc    120
       ............................................................
121    aagcccagttacccaacttcctccagctgcagaatctgtgaactgacatcagacccagaa    180
       ............................................................
181    ggctaccagaaacagggactgggcaggccaaaaagccttgcgctgaactgcaggcATGGC    240
       .......................................................M--A-
241    GCAGTACAAAGGCACCATGCGGGAAGCTGGCCGGGCCATGCACCTGATCAAGAAGCGTGA    300
       -Q--Y--K--G--T--M--R--E--A--G--R--A--M--H--L--I--K--K--R--E-
301    GAAGCAGAAGGAGCAGATGGAGGTGCTGAAGCAGCGCATCGCAGAGGAGACCATCATGAA    360
       -K--Q--K--E--Q--M--E--V--L--K--Q--R--I--A--E--E--T--I--M--K-
361    GTCAAAAGTGGACAAGAAGTTCTCGGCACACTACGACGCCGTGGAGGCCGAGCTGAAGTC    420
       -S--K--V--D--K--K--F--S--A--H--Y--D--A--V--E--A--E--L--K--S-
421    CAGTACGGTGGGCCTGGTGACCCTGAATGACATGAAGGCCAAGCAGGAGGCCCTGCTGAG    480
       -S--T--V--G--L--V--T--L--N--D--M--K--A--K--Q--E--A--L--L--R-
481    GGAGCGGGAGATGCAGCTGGCCAAGAGGGAGCAGCTGGAGCAACGCCGGATACAGCTGGA    540
       -E--R--E--M--Q--L--A--K--R--E--Q--L--E--Q--R--R--I--Q--L--E-
541    GATGCTGCGCGAGAAGGAGCGAAGGCGAGAGCGCAAGCGCAAGATCTCCAACCTGTCTTT    600
       -M--L--R--E--K--E--R--R--R--E--R--K--R--K--I--S--N--L--S--F-
601    CACGTTGGACGAGGAAGAAGGTGACCAAGAGGACAGCCGCCAAGCCGAGAGTGCCGAGGC    660
       -T--L--D--E--E--E--G--D--Q--E--D--S--R--Q--A--E--S--A--E--A-
661    CCACAGTGCTGGAGCCAAGAAGAACTTGGGCAAGAATCCCGATGTGGACACGAGCTTCCT    720
       -H--S--A--G--A--K--K--N--L--G--K--N--P--D--V--D--T--S--F--L-
721    GCCCGACCGCGAGCGCGAGGAGGAGGAGAACCGGTTGCGCGAGGAACTGCGGCAGGAGTG    780
       -P--D--R--E--R--E--E--E--E--N--R--L--R--E--E--L--R--Q--E--W-
781    GGAGGCGAAGCGCGAGAAGGTGAAGGGCGAGGAGGTGGAGATCACCTTCAGCTACTGGGA    840
       -E--A--K--R--E--K--V--K--G--E--E--V--E--I--T--F--S--Y--W--D-
841    TGGCTCCGGCCACCGGCGCACGGTGCGCATGAGCAAGGGCAGCACGGTGCAGCAGTTCCT    900
       -G--S--G--H--R--R--T--V--R--M--S--K--G--S--T--V--Q--Q--F--L-
901    GAAGCGGGCGCTGCAGGGGCTGCGCAGGGACTTCCGGGAGCTGCGGGCAGCGGGCGTGGA    960
       -K--R--A--L--Q--G--L--R--R--D--F--R--E--L--R--A--A--G--V--E-
961    GCAGCTCATGTACGTCAAGGAGGATCTCATCCTGCCGCACTATCACACCTTCTACGACTT   1020
       -Q--L--M--Y--V--K--E--D--L--I--L--P--H--Y--H--T--F--Y--D--F-
1021   CATCGTGGCCAAAGCCCGGGGCAAGAGCGGCCCGCTCTTCAGCTTCGACGTGCACGACGA   1080
       -I--V--A--K--A--R--G--K--S--G--P--L--F--S--F--D--V--H--D--D-
1081   TGTGCGGCTGCTGAGCGATGCCACGATGGAGAAAGATGAGTCACACGCGGGCAAGGTGGT   1140
       -V--R--L--L--S--D--A--T--M--E--K--D--E--S--H--A--G--K--V--V-
1141   GCTTCGCAGCTGGTACGAGAAGAACAAGCACATCTTCCCTGCCAGCCGCTGGGAGCCCTA   1200
       -L--R--S--W--Y--E--K--N--K--H--I--F--P--A--S--R--W--E--P--Y-
1201   CGACCCCGAGAAGAAGTGGGACAGGTACACCATCCGGTGAtgccaagtcccagtttgggg   1260
       -D--P--E--K--K--W--D--R--Y--T--I--R--***....................
1261   accttactccctaactatcgaaaattaataaatacagagggtccccgtaaatcgg        1320
       .......................................................