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Homo sapiens: TIGD1

Tigger transposable element derived 1

Luedi et al. Genome Res. 17: , 2007 PDF; Luedi et al. Genome Res. 17: , 2007 Supplement

Species Gene Aliases Location Status Expressed Allele
Homo sapiens TIGD1 EEYORE  2q37.1  Predicted Paternal
1      agttctgcctctgtccaggtccttgtgacccgcccgctctcctaagggagcgtgtcctgg     60
       ............................................................
61     ccccctcccgcagcggctcggaaaaaaggcagcaccgcgtcgttgacggcgcgggctctg    120
       ............................................................
121    gactcgctgcttggtaaaaaccttcctcttcctccagtgcgggacgcactctctggtatc    180
       ............................................................
181    tcttttgacctcccggaggctttcctttgtcggtcgcggcgccactgtactatggcatac    240
       ............................................................
241    ctcgttttattacgcttcgcagatagggcattctgaaaacaaatggagggtttgtggcag    300
       ............................................................
301    ccctgagtccagcaattgtatcagcgccatttttccaacagcatgtgctcacttggtgtc    360
       ............................................................
361    tctgtgttacattttggtaattctcaaaatatttaaaactttttcatgatttctgtgtct    420
       ............................................................
421    gttatggtgatctatgatcagtgatctttgatgttgctattgtcattgttttggggtgcc    480
       ............................................................
481    acatacagcgtcttttataagacgtggaacttaatgttgtgtgtgttctgaccgctccac    540
       ............................................................
541    ccacagaccgttccccatctctctccctcttcttgggcctccctattccctgagacacaa    600
       ............................................................
601    caatattgagattaggcgaattaatgactctgcaATGGCCTCTAAGTGCTCAAGTGAAAG    660
       ..................................M--A--S--K--C--S--S--E--R-
661    GAAGAGTCGCACATCTCTCACTTTAAATCAAAAACTAGAAATGATTAAACTGAGTGAGGA    720
       -K--S--R--T--S--L--T--L--N--Q--K--L--E--M--I--K--L--S--E--E-
721    AGGTATGTCAAAAGCCGAGATAGGCCGAAGGCTAGGCCTCCTGCGGCAAACAGTTAGCCA    780
       -G--M--S--K--A--E--I--G--R--R--L--G--L--L--R--Q--T--V--S--Q-
781    AGTTGTAAATGCAAAGGAAAAGTTCTTGAAGGAAGTTAAAAGTGCTACTCCAATGAACAC    840
       -V--V--N--A--K--E--K--F--L--K--E--V--K--S--A--T--P--M--N--T-
841    ACGAATGATAAGAAAGCGAAACAGCCTTATTGCTGATATGGAGAAAGTTTTAGTGGTCTG    900
       -R--M--I--R--K--R--N--S--L--I--A--D--M--E--K--V--L--V--V--W-
901    GATAGAAGATCAGACCAGCCGCAACATTCCCTTAAGCCAAAGCCTAATCCAGAACAAAGC    960
       -I--E--D--Q--T--S--R--N--I--P--L--S--Q--S--L--I--Q--N--K--A-
961    CCTAACTCTCTTCAACTCTATGAAAGCTGAGAGAGGTGTGGAAGCTGCAGAAGAAAAGTT   1020
       -L--T--L--F--N--S--M--K--A--E--R--G--V--E--A--A--E--E--K--F-
1021   TGAAGCTAGCAGAGGTTGGTTCATGAGGTTTAAGGAAAGAAGCCATTTCCATAACATAAA   1080
       -E--A--S--R--G--W--F--M--R--F--K--E--R--S--H--F--H--N--I--K-
1081   AGCACAAGGTGAAGCAGCAAGTGCTGATGTAGAAGCTGCAGCAAGTTATCCAGAAGCTTT   1140
       -A--Q--G--E--A--A--S--A--D--V--E--A--A--A--S--Y--P--E--A--L-
1141   AGCTAAGATCATTGACGAAGGTGGCTACACTAAACAACAGATTTTCAATGTAGATGAAAC   1200
       -A--K--I--I--D--E--G--G--Y--T--K--Q--Q--I--F--N--V--D--E--T-
1201   AGCCTTCTATTGGAAGAAGATGCCATCTAGAACTTTCATAGCTAGAGAGGAGAAGTCAGT   1260
       -A--F--Y--W--K--K--M--P--S--R--T--F--I--A--R--E--E--K--S--V-
1261   GCCTGGCTTCAAAGCTTCAAAGGACAGGCTGACTCTCTTGTTAGGGGCTAATGCAGCTGG   1320
       -P--G--F--K--A--S--K--D--R--L--T--L--L--L--G--A--N--A--A--G-
1321   TGACTTTAAGTTGAAGCCAATGCTTATTTACCATTCTGAAAATCCTAGGGCCCTTAAGAA   1380
       -D--F--K--L--K--P--M--L--I--Y--H--S--E--N--P--R--A--L--K--N-
1381   TTATACTAAATCTACTCTACCCGTGCTATATAAATGGAACAGCAAAGCCCGGATGACAGC   1440
       -Y--T--K--S--T--L--P--V--L--Y--K--W--N--S--K--A--R--M--T--A-
1441   ACATCTGTTTACAGCATGGTTTACTGAATATTTTAAACCCACTGTTGAGACCTACTGCTC   1500
       -H--L--F--T--A--W--F--T--E--Y--F--K--P--T--V--E--T--Y--C--S-
1501   AGAAAAGAAGATTCCTTTCAAAATATTACTGCTCATTGACAATGCCCCTAGTCATCCAAG   1560
       -E--K--K--I--P--F--K--I--L--L--L--I--D--N--A--P--S--H--P--R-
1561   AGCTCTGATGGAGATATACGAGGAGATTAATGTTATTTTCATGCCTGCTAACACAACATC   1620
       -A--L--M--E--I--Y--E--E--I--N--V--I--F--M--P--A--N--T--T--S-
1621   CATTCTGCAGCCCATGGATCAAGGGGTAATTTCGACCTTCAAGTCTTATTATTTGAGAAA   1680
       -I--L--Q--P--M--D--Q--G--V--I--S--T--F--K--S--Y--Y--L--R--N-
1681   TACATTTCATAAGGCTCTAGCTGCCATGGATAGTGATGTCTCTGATGGATCTGGGCAAAG   1740
       -T--F--H--K--A--L--A--A--M--D--S--D--V--S--D--G--S--G--Q--S-
1741   CAAATTGAAAACCTTCTGGAAAGGATTCACCATTTTAGATGCCATTAAAAACATTCGTGA   1800
       -K--L--K--T--F--W--K--G--F--T--I--L--D--A--I--K--N--I--R--D-
1801   TTCATGGGAGGAGGTCAAATTGTCAACATTAACAGGAGTTTGGAAGAAGTTGATTCCCAC   1860
       -S--W--E--E--V--K--L--S--T--L--T--G--V--W--K--K--L--I--P--T-
1861   CCTCATTGATGACTATGAGGGGTTCAAGACTTCAGTGGAGGAAGTAAGTGCAGATGTGGT   1920
       -L--I--D--D--Y--E--G--F--K--T--S--V--E--E--V--S--A--D--V--V-
1921   GGAAATAGCAAAAGAACTAGAATTAGAAGTAGAGCCTGAAGATGTAACTGAATTGCTGCA   1980
       -E--I--A--K--E--L--E--L--E--V--E--P--E--D--V--T--E--L--L--Q-
1981   ATCTCATGATAAAACTTTAACAGATGAGGAGTTGTTTCTTATGGATGCGCAAAGAAAGTG   2040
       -S--H--D--K--T--L--T--D--E--E--L--F--L--M--D--A--Q--R--K--W-
2041   GTTTCTTGAGATGGAATCTACACCTGGTGAAGATGCTGTGAACATTGTTGAAATGACAAC   2100
       -F--L--E--M--E--S--T--P--G--E--D--A--V--N--I--V--E--M--T--T-
2101   AAAGGATTTAGAATATTACATAAACTTAGTTGATAAAGCAGCAGCAGGGTTTGAGAGGAT   2160
       -K--D--L--E--Y--Y--I--N--L--V--D--K--A--A--A--G--F--E--R--I-
2161   TGACTCCAATTTTGAAAGAAGCTCTACTGTGGGCAAAATGCTATCAAACAGCATCGCATG   2220
       -D--S--N--F--E--R--S--S--T--V--G--K--M--L--S--N--S--I--A--C-
2221   CTACAGAGAAATCTTTCATGAAAGGAAGAGTCAACTCATGCGAAAAGCTTCACCGATGTC   2280
       -Y--R--E--I--F--H--E--R--K--S--Q--L--M--R--K--A--S--P--M--S-
2281   TTATTTTAGGAAATTGCCACAGCCACCCCAACCTTCAGCAGCCACCACCCTGACCAGTCA   2340
       -Y--F--R--K--L--P--Q--P--P--Q--P--S--A--A--T--T--L--T--S--Q-
2341   GCAACCATCAACCTCGAGGCAAGACCCTCCACCAGCAAAAAGAGTACGACTCACCGAAGG   2400
       -Q--P--S--T--S--R--Q--D--P--P--P--A--K--R--V--R--L--T--E--G-
2401   CTCAGATTGAtaatcagcattttttagcaataaagtatttttaaattt               2460
       -S--D--***......................................