Imprinted Gene Databases

Homo sapiens: SMOC1

SPARC related modular calcium binding 1

Santoni et al. Hum Genet, 100: 444-453, 2017

Species Gene Aliases Location Status Expressed Allele
Homo sapiens SMOC1 OAS  14q24.2  Imprinted Maternal
Mus musculus Smoc1 S, SRG, AI848508, 2600002F22Rik  12  Imprinted Paternal
1      aggcgtccaacctgctgccgcctgggccccgccgagcggagctagcgccgcgcgcagagc     60
       ............................................................
61     acacgctcgcgctccagctcccctcctgcgcggttcatgactgtgtcccctgaccgcagc    120
       ............................................................
121    ctctgcgagcccccgccgcaggaccacggcccgctccccgccgccgcgagggccccgagc    180
       ............................................................
181    gaaggaaggaagggaggcgcgctgtgcgccccgcggagcccgcgaaccccgctcgctgcc    240
       ............................................................
241    ggctgcccagcctggctggcaccATGCTGCCCGCGCGCTGCGCCCGCCTGCTCACGCCCC    300
       .......................M--L--P--A--R--C--A--R--L--L--T--P--H
301    ACTTGCTGCTGGTGTTGGTGCAGCTGTCCCCTGCTCGCGGCCACCGCACCACAGGCCCCA    360
       --L--L--L--V--L--V--Q--L--S--P--A--R--G--H--R--T--T--G--P--R
361    GGTTTCTAATAAGTGACCGTGACCCACAGTGCAACCTCCACTGCTCCAGGACTCAACCCA    420
       --F--L--I--S--D--R--D--P--Q--C--N--L--H--C--S--R--T--Q--P--K
421    AACCCATCTGTGCCTCTGATGGCAGGTCCTACGAGTCCATGTGTGAGTACCAGCGAGCCA    480
       --P--I--C--A--S--D--G--R--S--Y--E--S--M--C--E--Y--Q--R--A--K
481    AGTGCCGAGACCCGACCCTGGGCGTGGTGCATCGAGGTAGATGCAAAGATGCTGGCCAGA    540
       --C--R--D--P--T--L--G--V--V--H--R--G--R--C--K--D--A--G--Q--S
541    GCAAGTGTCGCCTGGAGCGGGCTCAAGCCCTGGAGCAAGCCAAGAAGCCTCAGGAAGCTG    600
       --K--C--R--L--E--R--A--Q--A--L--E--Q--A--K--K--P--Q--E--A--V
601    TGTTTGTCCCAGAGTGTGGCGAGGATGGCTCCTTTACCCAGGTGCAGTGCCATACTTACA    660
       --F--V--P--E--C--G--E--D--G--S--F--T--Q--V--Q--C--H--T--Y--T
661    CTGGGTACTGCTGGTGTGTCACCCCGGATGGGAAGCCCATCAGTGGCTCTTCTGTGCAGA    720
       --G--Y--C--W--C--V--T--P--D--G--K--P--I--S--G--S--S--V--Q--N
721    ATAAAACTCCTGTATGTTCAGGTTCAGTCACCGACAAGCCCTTGAGCCAGGGTAACTCAG    780
       --K--T--P--V--C--S--G--S--V--T--D--K--P--L--S--Q--G--N--S--G
781    GAAGGAAAGATGACGGGTCTAAGCCGACACCCACGATGGAGACCCAGCCGGTGTTCGATG    840
       --R--K--D--D--G--S--K--P--T--P--T--M--E--T--Q--P--V--F--D--G
841    GAGATGAAATCACAGCCCCAACTCTATGGATTAAACACTTGGTGATCAAGGACTCCAAAC    900
       --D--E--I--T--A--P--T--L--W--I--K--H--L--V--I--K--D--S--K--L
901    TGAACAACACCAACATAAGAAATTCAGAGAAAGTCTATTCGTGTGACCAGGAGAGGCAGA    960
       --N--N--T--N--I--R--N--S--E--K--V--Y--S--C--D--Q--E--R--Q--S
961    GTGCCCTGGAAGAGGCCCAGCAGAATCCCCGTGAGGGTATTGTCATCCCTGAATGTGCCC   1020
       --A--L--E--E--A--Q--Q--N--P--R--E--G--I--V--I--P--E--C--A--P
1021   CTGGGGGACTCTATAAGCCAGTGCAATGCCACCAGTCCACTGGCTACTGCTGGTGTGTGC   1080
       --G--G--L--Y--K--P--V--Q--C--H--Q--S--T--G--Y--C--W--C--V--L
1081   TGGTGGACACAGGGCGCCCGCTGCCTGGGACCTCCACACGCTACGTGATGCCCAGTTGTG   1140
       --V--D--T--G--R--P--L--P--G--T--S--T--R--Y--V--M--P--S--C--E
1141   AGAGCGACGCCAGGGCCAAGACTACAGAGGCGGATGACCCCTTCAAGGACAGGGAGCTAC   1200
       --S--D--A--R--A--K--T--T--E--A--D--D--P--F--K--D--R--E--L--P
1201   CAGGCTGTCCAGAAGGGAAGAAAATGGAGTTTATCACCAGCCTACTGGATGCTCTCACCA   1260
       --G--C--P--E--G--K--K--M--E--F--I--T--S--L--L--D--A--L--T--T
1261   CTGACATGGTTCAGGCCATTAACTCAGCAGCGCCCACTGGAGGTGGGAGGTTCTCAGAGC   1320
       --D--M--V--Q--A--I--N--S--A--A--P--T--G--G--G--R--F--S--E--P
1321   CAGACCCCAGCCACACCCTGGAGGAGCGGGTAGTGCACTGGTATTTCAGCCAGCTGGACA   1380
       --D--P--S--H--T--L--E--E--R--V--V--H--W--Y--F--S--Q--L--D--S
1381   GCAATAGCAGCAACGACATTAACAAGCGGGAGATGAAGCCCTTCAAGCGCTACGTGAAGA   1440
       --N--S--S--N--D--I--N--K--R--E--M--K--P--F--K--R--Y--V--K--K
1441   AGAAAGCCAAGCCCAAGAAATGTGCCCGGCGTTTCACCGACTACTGTGACCTGAACAAAG   1500
       --K--A--K--P--K--K--C--A--R--R--F--T--D--Y--C--D--L--N--K--D
1501   ACAAGGTCATTTCACTGCCTGAGCTGAAGGGCTGCCTGGGTGTTAGCAAAGAAGGACGCC   1560
       --K--V--I--S--L--P--E--L--K--G--C--L--G--V--S--K--E--G--R--L
1561   TCGTCTAAggagcagaaaacccaagggcaggtggagagtccagggaggcaggatggatca   1620
       --V--***....................................................
1621   ccagacacctaaccttcagcgttgcccatggccctgccacatcccgtgtaacataagtgg   1680
       ............................................................
1681   tgcccaccatgtttgcacttttaataactcttacttgcgtgttttgtttttggtttcatt   1740
       ............................................................
1741   ttaaaacaccaatatctaataccacagtgggaaaaggaaagggaagaaagactttattct   1800
       ............................................................
1801   ctctcttattgtaagtttttggatctgctactgacaacttttagagggttttgggggggt   1860
       ............................................................
1861   gggggagggtgttgttggggctgagaagaaagagatttatatgctgtatataaatatata   1920
       ............................................................
1921   tgtaaattgtatagttcttttgtacaggcattggcattgctgtttgtttatttctctccc   1980
       ............................................................
1981   tctgcctgctgtgggtggtgggcactctggacacatagtccagctttctaaaatccagga   2040
       ............................................................
2041   ctctatcctgggcctactaaacttctgtttggagactgacccttgtgtataaagacggga   2100
       ............................................................
2101   gtcctgcaattgtactgcggactccacgagttcttttctggtgggaggactatattgccc   2160
       ............................................................
2161   catgccattagttgtcaaaattgataagtcacttggctctcggccttgtccagggaggtt   2220
       ............................................................
2221   gggctaaggagagatggaaactgccctgggagaggaagggagtccagatcccatgaatag   2280
       ............................................................
2281   cccacacaggtaccggctctcagagggtccgtgcattcctgctctccggacccccaaagg   2340
       ............................................................
2341   gcccagcattggtgggtgcaccagtatcttagtgaccctcggagcaaattatccacaaag   2400
       ............................................................
2401   gatttgcattacgtcactcgaaacgttttcatccatgcttagcatctactctgtataacg   2460
       ............................................................
2461   catgagaggggaggcaaagaagaaaaagacacacagaagggcctttaaaaaagtagatat   2520
       ............................................................
2521   ttaatatctaagcaggggaggggacaggacagaaagcctgcactgaggggtgcggtgcca   2580
       ............................................................
2581   acagggaaactcttcacctccctgcaaacctaccagtgaggctcccagagacgcagctgt   2640
       ............................................................
2641   ctcagtgccaggggcagattgggtgtgacctctccactcctccatctcctgctgttgtcc   2700
       ............................................................
2701   tagtggctatcacaggcctgggtgggtgggttgggggaggtgtcagtcaccttgttggta   2760
       ............................................................
2761   acactaaagttgttttgttggttttttaaaaacccaatactgaggttcttcctgttccct   2820
       ............................................................
2821   caagttttcttatgggcttccaggctttaagctaattccagaagtaaaactgatcttggg   2880
       ............................................................
2881   tttcctattctgcctcccctagaagggcaggggtgataacccagctacagggaaatcccg   2940
       ............................................................
2941   gcccagctttccacaggcatcacaggcatcttccgcggattctagggtgggctgcccagc   3000
       ............................................................
3001   cttctggtctgaggcgcagctccctctgcccaggtgctgtgcctattcaagtggccttca   3060
       ............................................................
3061   ggcagagcagcaagtggcccttagcgccccttcccataagcagctgtggtggcagtgagg   3120
       ............................................................
3121   gaggttgggtagccctggactggtcccctcctcagatcacccttgcaaatctggcctcat   3180
       ............................................................
3181   cttgtattccaacccgacatccctaaaagtacctccacccgttccgggtctggaaggcgt   3240
       ............................................................
3241   tggcaccacaagcactgtccctgtgggaggagcacaaccttctcgggacaggatctgatg   3300
       ............................................................
3301   gggtcttgggctaaaggaggtccctgctgtcctggagaaagtcctagaggttatctcagg   3360
       ............................................................
3361   aatgactggtggccctgccccaacgtggaaaggtgggaaggaagccttctcccattagcc   3420
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3421   ccaatgagagaactcaacgtgccggagctgagtgggccttgcacgagacactggccccac   3480
       ............................................................
3481   tttcaggcctggaggaagcatgcacacatggagacggcgcctgcctgtagatgtttggat   3540
       ............................................................
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       ............................................................
3601   tggttttcctttgtgaaggagagagggaaactatttgtagcttgttttataaaaaataaa   3660
       ............................................................
3661   aaatgggtaaatcttg                                               3720
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