Imprinted Gene Databases

Homo sapiens: PXDC1

PX domain containing 1

Mozaffari et al. PLOS One 13 :e0203906. doi: 10.1371/journal.pone.0203906, 2018

Species Gene Aliases Location Status Expressed Allele
Homo sapiens PXDC1 C6orf145  6p25.2  Imprinted Paternal
1      gaatttcaattgattgaagaccatctttataggtacatgctaactttattgcaatatcaa     60
       ............................................................
61     tggcattatctaattcagaatatccaaacaatcaccatatattactcatcaccataattt    120
       ............................................................
121    tataatctctctaacatgttatttaaataacaacaatcatacgaatatacaggcgctact    180
       ............................................................
181    agGGCGCGCGCCAGTGCGCGCTACTAGTCCTATCTACTAGTTCCCCGGCGCTAATAAGTG    240
       ..M--A--S--A--V--F--E--G--T--S--L--V--N--M--F--V--R--G--C--W
241    CGGTAGAAGGAATTCTGCATTGGTGGAATTGCGCCAGTGGCGCCAGTGGCGCCAGTGGCG    300
       --V--N--G--I--R--R--L--I--V--S--R--R--G--D--E--E--E--F--F--E
301    CCAGTGGATGATCAAGACGCGCTAAATAAAATGCGCTAATGACTCGCCGCCGCGCCGCCC    360
       --I--R--T--E--W--S--D--R--S--V--L--Y--L--H--R--S--L--A--D--L
361    CGCTGCCCCGAACGCGGGCCATACGCAGCCTCCTTGGAGTGACGGGCCGACCCCGGACGA    420
       --G--R--L--W--Q--R--L--R--D--A--F--P--E--D--R--S--E--L--A--Q
421    CCCCGGCCACGGACAGACCCGGGACGACCCCGGCCGGGGCGCGCCTCCTGCGGGCGGGCG    480
       --G--P--L--R--Q--G--L--V--A--I--K--E--A--H--D--I--E--T--R--L
481    GGCGGCGGGGCTGGGGAGCCCTTGGCGGGGGCATGCGTGCGACATGGCCTCGGCGGTGTT    540
       --N--E--V--E--K--L--L--K--T--I--I--S--M--P--C--K--Y--S--R--S
541    TGAGGGCACGTCGCTCGTGAACATGTTCGTGCGCGGCTGCTGGGTGAACGGCATCCGCAG    600
       --E--V--V--L--T--F--F--E--R--S--P--L--D--Q--V--L--K--N--D--N
601    GCTCATCGTCAGCCGGCGCGGCGACGAAGAGGAGTTCTTCGAGATCCGCACGGAGTGGTC    660
       --V--H--K--I--Q--P--S--F--Q--S--P--V--K--I--S--E--I--M--R--S
661    GGACCGCAGCGTGCTCTACCTGCACCGCAGCCTGGCGGACCTGGGCCGCCTGTGGCAGCG    720
       --N--G--F--C--L--A--N--T--E--T--I--V--I--D--H--S--I--P--N--G
721    CCTGCGCGACGCCTTTCCCGAGGACCGGTCCGAACTGGCGCAGGGGCCGCTGCGGCAAGG    780
       --R--D--Q--Q--L--G--V--D--P--T--E--H--L--F--E--N--G--S--E--F
781    ACTGGTTGCCATAAAGGAAGCCCACGACATAGAGACCAGGCTTAATGAGGTGGAGAAGCT    840
       --P--S--E--L--E--D--G--D--D--P--A--A--Y--V--T--N--L--S--Y--Y
841    GCTGAAGACGATCATAAGCATGCCCTGTAAATATTCTAgatcggaagttgtgctcacctt    900
       --H--L--V--P--F--E--T--D--I--W--D--***......................
901    cttcgaaagatctcctctggatcaggtgttaaaaaatgataatgtgcataaaattcaacc    960
       ............................................................
961    cagctttcaaagtccagtcaaaatatcagaaatcatgaggtccaatggattttgtttagc   1020
       ............................................................
1021   aaataccgaaacaatagttattgaccacagtataccaaatggaagagaccagcagctggg   1080
       ............................................................
1081   cgtggacccaacagagcatttatttgagaatggcagtgagtttccctcagagctggagga   1140
       ............................................................
1141   cggggacgacccagcagcctacgtcaccaacctgtcatattaccacctggtccccttcga   1200
       ............................................................
1201   gacagacatttgggactgaacctctctatcaggcctcccccgcctcagctgttcactgcc   1260
       ............................................................
1261   agctctgatgctgtccactgtgctggcccccatggtcacagctgctgccccagctctgga   1320
       ............................................................
1321   actcccagacgtcccaggccccactgacgccaggaggcctgggtgtcctgcaagtggagc   1380
       ............................................................
1381   agcaggggctcctagtgggccaggctgaccgcagagtctccagcaagctgaggtcacagc   1440
       ............................................................
1441   cggaggccacagggcctgtgttctgagggtcttcactccctgcttggtgcccacagggct   1500
       ............................................................
1501   gcgcactgccagggcagggacagttcctgtggggctcgctctcactgctactgcttcctg   1560
       ............................................................
1561   ggaggtgcatccctcttggtgaagtggcctagtgccccccagccaccctgactccccacc   1620
       ............................................................
1621   attccctcccacggcaaacgcacaaaacgtcttgagggagattttgacaagtcacccatt   1680
       ............................................................
1681   ccaggtgccacaggcaggggatgtttagtaatccaggatttctctgagaactgggatatg   1740
       ............................................................
1741   tggcctttttttttttctttttatcttttatctggaaactgggtttgggtcaaccccagg   1800
       ............................................................
1801   agtatttgcagaaggcccagcacagtggggggtattggctgcagggcagggaaggcattg   1860
       ............................................................
1861   ccgactagataaccgtgtgagcttggactgagcgttggtggttcttcccaaaggaaagga   1920
       ............................................................
1921   atttcttcccggcctgccaggtctctgggccttcagcgcgggtcctggtgctgcggccac   1980
       ............................................................
1981   accaccctggggtgctcattgacagagctgccataatgaacttgaaaggacgggaatcac   2040
       ............................................................
2041   gagggaagctggggctcccctgcccacaggagaggatccccgttcttcaagcttctctgc   2100
       ............................................................
2101   tcagtgtctactaacgaccgacatttgctaatgtaaataatagtaaattattgagaattc   2160
       ............................................................
2161   taattcttttacacagtctgtttttaatctattttaattaaataaaatctatgactcta    2220
       ...........................................................