Imprinted Gene Databases

Bos taurus: RDH16

Retinol dehydrogenase 16

Chen et al. Epigenetics, 11: 501-516, 2016

Species Gene Aliases Location Status Expressed Allele
Bos taurus RDH16   Imprinted Maternal
1      gccaatggagctgggcacacaggtctgtaggcagagcatctgcacagagtaaaaggggaa     60
       ............................................................
61     caactgttagagcaactttgtgtgagtccttccaagacccatcccagtgtctgggagaaa    120
       ............................................................
121    tctcaccattacctgtgtcccctcatccccttcctgtttcctcgtagtgcctcagacagc    180
       ............................................................
181    cccactgttcttctgaacactttctggtccaggaaaccagactctatttcaccccaggct    240
       ............................................................
241    gtgtgtgtctgtcccataaaaggccATGTGGCTGTACCTGGTGGTCCTCGTGGGCCTGTA    300
       .........................M--W--L--Y--L--V--V--L--V--G--L--Y-
301    CTACCTCCTACGCTGGTACCGGGAGAGGCAGGTGGTGAGCCACCTCCGGGACAAGTTCGT    360
       -Y--L--L--R--W--Y--R--E--R--Q--V--V--S--H--L--R--D--K--F--V-
361    CTTCATCACAGGCTGTGACTCGGGCTTCGGGAACCTGCTGGCCAGGCAGCTGGACCTGAG    420
       -F--I--T--G--C--D--S--G--F--G--N--L--L--A--R--Q--L--D--L--R-
421    AGGCTTGAGGGTCCTGGCTGCATGTCTGACAGAGAAGGGGGCTGAGCAACTGAGGAACCA    480
       -G--L--R--V--L--A--A--C--L--T--E--K--G--A--E--Q--L--R--N--Q-
481    GACATCAGACAGGCTGCAGACGGTGATCCTGGATGTCACCAAGACAGACAGCGTTGCTGC    540
       -T--S--D--R--L--Q--T--V--I--L--D--V--T--K--T--D--S--V--A--A-
541    GGCCACCGAGTGGGTGAAAGAGCGTGTGGGGGACAGAGGGCTCTGGGGTCTGGTGAATAA    600
       -A--T--E--W--V--K--E--R--V--G--D--R--G--L--W--G--L--V--N--N-
601    TGCTGGCATCTCCACGCCCACTGCACCCAATGAGTGGCTGACCAAACAGGACTTCATGAA    660
       -A--G--I--S--T--P--T--A--P--N--E--W--L--T--K--Q--D--F--M--K-
661    GATTCTGGACGTGAACCTGTTGGGGGTGATTGATGTGACCCTGAGTGTGCTGCCCCTGGT    720
       -I--L--D--V--N--L--L--G--V--I--D--V--T--L--S--V--L--P--L--V-
721    GCGGAAGGCAAGGGGCCGTGTGGTCAATGTTTCCAGCATCATGGGCCGGGTGGCCCTCCT    780
       -R--K--A--R--G--R--V--V--N--V--S--S--I--M--G--R--V--A--L--L-
781    TGGTGGAGGCTATTGCATGTCCAAGTATGGCGTGGAGGCCTTCTCAGACTCCCTCAGGAG    840
       -G--G--G--Y--C--M--S--K--Y--G--V--E--A--F--S--D--S--L--R--R-
841    GGAGCTCTCCTACTTTGGGGTGAAGGTGGTTATGATCGAGCCTGGTTATTTTAAGACCGC    900
       -E--L--S--Y--F--G--V--K--V--V--M--I--E--P--G--Y--F--K--T--A-
901    TGTGACCAGCCCTAAGGCACTTTCTCAGGGCTTCCAGGCATCATGGAATCAGGCCAGCCC    960
       -V--T--S--P--K--A--L--S--Q--G--F--Q--A--S--W--N--Q--A--S--P-
961    AGAGATCAAGGAACTCTATGGAGAGAAGTTCATGGCTAACCTCATGAAATCAGTCGACTT   1020
       -E--I--K--E--L--Y--G--E--K--F--M--A--N--L--M--K--S--V--D--L-
1021   GTTGGAGACAACCAGCTGCCAGGATCTGTCCTTGGTGACCAACTGCATGGAGCACGCCCT   1080
       -L--E--T--T--S--C--Q--D--L--S--L--V--T--N--C--M--E--H--A--L-
1081   GACTGCCTGCCACCCCCGCACCCGATACTCACCTGGCTGGGATGCCAAGTTCATCTACCT   1140
       -T--A--C--H--P--R--T--R--Y--S--P--G--W--D--A--K--F--I--Y--L-
1141   TCCCATGAGCTACCTGCCCAGCTTCCTGGTGGATCTCATGGTGTACTGGAGAAACCCCAG   1200
       -P--M--S--Y--L--P--S--F--L--V--D--L--M--V--Y--W--R--N--P--R-
1201   GCCTGCGAAGGCCCTGTAAcccaagactggggtgcattgtagggggtagttgcgtacaga   1260
       -P--A--K--A--L--***.........................................
1261   atggggagaggatgcatcgggggagggaaatatagtggagagtggagttttcatgtcacc   1320
       ............................................................
1321   aggacacctttccacctcactcccatctcctccccagtctccttttgggacattacttag   1380
       ............................................................
1381   gactcgaggatagaaggaagaaacatgttttgtagtgagaaactgagatcagtagctctt   1440
       ............................................................
1441   atctgtgtcctgttccttcatcagcctctcaaggctctgagccttatggccctcctgcaa   1500
       ............................................................
1501   ccctgaggaatccatacttaaggggagggttgagcagccaggagggtccagacccctgca   1560
       ............................................................
1561   tcttctgcccctgtccgcctcttccaggtgtgccttggccctggccagtgtccccctccc   1620
       ............................................................
1621   actgcaatgcacatgggagataaaagcccttcttccctaaagatacttgtaatcagggat   1680
       ............................................................
1681   gtgtgtgaggggtgaccaccagcctgacacatcagcctaggtgctaactcagccaatctt   1740
       ............................................................
1741   ggctggaaagtggtgtcatcagtggagatcctgacagagaacacagaaaccaattcttgt   1800
       ............................................................
1801   tttgtcttgaaatcttaaatttccattgattatattcccctaaaataaaaatttagacat   1860
       ............................................................
1861   tt                                                             1920
       ..