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Bos taurus: CDH13

Cadherin 13

Huo et al. Mol Genet Genomics 299: 40, 2024

Species Gene Aliases Location Status Expressed Allele
Bos taurus CDH13   18  Imprinted Paternal
1      tttgggaagttggctggctggcgaggcagagcctctcctcaaagcctggctcccacggaa     60
       ............................................................
61     aatatgctcagtgcagccgcgtgcatgaatgaaaacgccgccgggcgcttctagtcgggc    120
       ............................................................
121    aaaATGCAGCCGGCAACTCCGCTCGTCCTGTGCGTTCTCCTGTCCCAGGTGCTGCTGCTA    180
       ...M--Q--P--A--T--P--L--V--L--C--V--L--L--S--Q--V--L--L--L--
181    ACATCTGCAGAAGATTTGGACTGCACTCCTGGATTTCAGCAGAAAGTGTTCCATATCGAT    240
       T--S--A--E--D--L--D--C--T--P--G--F--Q--Q--K--V--F--H--I--D--
241    CAGCCAGCTGAATTCATTGAGGACCAGGCGATTTTAAACTTGACCTTCAGTGACTGCAAG    300
       Q--P--A--E--F--I--E--D--Q--A--I--L--N--L--T--F--S--D--C--K--
301    GGAAATGACAAGCTGCACTATGAGGTCTCAAGCCCATACTTCAGGGTGAACACCGACGGC    360
       G--N--D--K--L--H--Y--E--V--S--S--P--Y--F--R--V--N--T--D--G--
361    AGCTTAGTCGCCCTGAGGAACATAACTGCCGTGGGCAAGACTCTATTCGTCCACGCCCGG    420
       S--L--V--A--L--R--N--I--T--A--V--G--K--T--L--F--V--H--A--R--
421    ACTCCCCATGCAGAAGACATGGCGGAACTCGTGATTGTTGGAGGGAAAGACATCCAGGGC    480
       T--P--H--A--E--D--M--A--E--L--V--I--V--G--G--K--D--I--Q--G--
481    TCCTTGCAGGATATATTTAAATTTGCAAGAACTTCTCCTGTCCCAAGACAAAAGAGGTCC    540
       S--L--Q--D--I--F--K--F--A--R--T--S--P--V--P--R--Q--K--R--S--
541    ATTGTGGTATCTCCCATTTTAATTCCAGAGAATCAGAGACAACCTTTCCCGAGAGATGTT    600
       I--V--V--S--P--I--L--I--P--E--N--Q--R--Q--P--F--P--R--D--V--
601    GGCAAGGTAGTCGATAGTGACAGACCGGAAGGGTCCAAGTTCCGGCTCACTGGAAAGGGA    660
       G--K--V--V--D--S--D--R--P--E--G--S--K--F--R--L--T--G--K--G--
661    GTGGATCAAGAGCCTAAAGGAATTTTCAGAATCAATGAGAACACGGGTAGTGTCTCTGTG    720
       V--D--Q--E--P--K--G--I--F--R--I--N--E--N--T--G--S--V--S--V--
721    ACACGGAACTTGGACAGAGAAACCATCGCTACCTATCAACTATTTGTGGAGACCGTAGAT    780
       T--R--N--L--D--R--E--T--I--A--T--Y--Q--L--F--V--E--T--V--D--
781    GTCAACGGCAGGACTCTCGAGGGGCCGGTCCCTCTGGAAGTCATCGTGATTGATCAAAAT    840
       V--N--G--R--T--L--E--G--P--V--P--L--E--V--I--V--I--D--Q--N--
841    GACAACAGACCCATCTTCCGGGAAGGCCCCTACATCGGCCACGTCATGGAGGGGTCACCT    900
       D--N--R--P--I--F--R--E--G--P--Y--I--G--H--V--M--E--G--S--P--
901    ACAGGGACCACGGTGATGCGGATGACAGCCTTTGATGCGGATGACCCAGCCACGGATAAT    960
       T--G--T--T--V--M--R--M--T--A--F--D--A--D--D--P--A--T--D--N--
961    GCCCTCCTGCGGTACAATATCCGTCAGCAGACGCCTGACAAGCCGTCTCCCAACATGTTC   1020
       A--L--L--R--Y--N--I--R--Q--Q--T--P--D--K--P--S--P--N--M--F--
1021   TACATCGATCCCGAGAAAGGAGACATTGTCACCGTTGTGTCACCTGCACTGCTGGACCGG   1080
       Y--I--D--P--E--K--G--D--I--V--T--V--V--S--P--A--L--L--D--R--
1081   GAGACGCTGGAAAATCCCAAGTATGAACTGATCATTGAGGCTCAAGACATGGCAGGACTG   1140
       E--T--L--E--N--P--K--Y--E--L--I--I--E--A--Q--D--M--A--G--L--
1141   GATGTTGGATTAACAGGCACGGCCACAGCGACAATCATGATCGATGACAAAAACGATCAC   1200
       D--V--G--L--T--G--T--A--T--A--T--I--M--I--D--D--K--N--D--H--
1201   TCACCAAAGTTCACCAAGAAAGAGTTTCAAGCCACAGTCGAGGAAGGAGCCATGGGAGTT   1260
       S--P--K--F--T--K--K--E--F--Q--A--T--V--E--E--G--A--M--G--V--
1261   ATTGTCAACTTGACAGTTGAGGACAAGGACGATCCCACCACGGGTGCATGGAGGGCCGCC   1320
       I--V--N--L--T--V--E--D--K--D--D--P--T--T--G--A--W--R--A--A--
1321   TACACCATCATCAACGGGAACCCGGGGCAGAGCTTCGAGATCCACACCAACCCGCAGACC   1380
       Y--T--I--I--N--G--N--P--G--Q--S--F--E--I--H--T--N--P--Q--T--
1381   AACGAGGGGATGCTCTCCGTCGTCAAACCTCTGGACTACGAGATTTCTGCCTTTCACACC   1440
       N--E--G--M--L--S--V--V--K--P--L--D--Y--E--I--S--A--F--H--T--
1441   CTGCTGATCAAAGTGGAAAACGAGGACCCACTGGTGCCCGACGTCTCCTACGGCTCCAGC   1500
       L--L--I--K--V--E--N--E--D--P--L--V--P--D--V--S--Y--G--S--S--
1501   TCCACGGCCACTGTCCACATCACTGTCCTGGACGCCAACGAGAGTCCAGTTTTCTACCCG   1560
       S--T--A--T--V--H--I--T--V--L--D--A--N--E--S--P--V--F--Y--P--
1561   GACCCCATGATGGTGACCAAGCAGGAGAACATCTCTGTGGGCAGTGTGCTGCTGACAGTG   1620
       D--P--M--M--V--T--K--Q--E--N--I--S--V--G--S--V--L--L--T--V--
1621   AATGCCACGGACCCCGACTCCCTGCAGCGTCAGACCATCAGGTATTCCGTTTACAAGGAT   1680
       N--A--T--D--P--D--S--L--Q--R--Q--T--I--R--Y--S--V--Y--K--D--
1681   CCTGCAGGCTGGCTGAATATCAACCCCATCAACGGGACTGTGGACACGACTGCACTGCTG   1740
       P--A--G--W--L--N--I--N--P--I--N--G--T--V--D--T--T--A--L--L--
1741   GACCGCGAGTCCCCGTTCGTCCACAACAGCGTCTACACTGCCCTCTTCCTGGCAACTGAC   1800
       D--R--E--S--P--F--V--H--N--S--V--Y--T--A--L--F--L--A--T--D--
1801   AGTGGCAACCCGCCCGCCACTGGCACTGGGACTCTGCTGATAACTCTGGAAGACGTGAAT   1860
       S--G--N--P--P--A--T--G--T--G--T--L--L--I--T--L--E--D--V--N--
1861   GACAACGCACCCTTCATTTACCCCACGGTAGCAGAGGTCTGTGATGATGCCAAAAACCTC   1920
       D--N--A--P--F--I--Y--P--T--V--A--E--V--C--D--D--A--K--N--L--
1921   AGCGTAGTCATTTTGGGAGCGACAGATAAGGATCTTCACCCAAACACAGATCCTTTCAAA   1980
       S--V--V--I--L--G--A--T--D--K--D--L--H--P--N--T--D--P--F--K--
1981   TTTGAAATCCACAAACAAACCGTTCCTGATAAAGTCTGGAAGATCTCCAAGATCAACAAT   2040
       F--E--I--H--K--Q--T--V--P--D--K--V--W--K--I--S--K--I--N--N--
2041   ACACACGCCCTGGTGAGCCTCCTTCAAAACCTGAACAAAGCAAACTACCACCTGCCCATC   2100
       T--H--A--L--V--S--L--L--Q--N--L--N--K--A--N--Y--H--L--P--I--
2101   ATGGTGACAGACTCGGGGAAGCCGCCCATGACGAACATCACAGACCTCAGGGTACAAGTG   2160
       M--V--T--D--S--G--K--P--P--M--T--N--I--T--D--L--R--V--Q--V--
2161   TGCTCCTGCAAGAATTCCAAAGTGGACTGCAACGCAGCGGGGGCCCCGCACTTCAGCGCG   2220
       C--S--C--K--N--S--K--V--D--C--N--A--A--G--A--P--H--F--S--A--
2221   GCCACAGCCCTGCTCCTGTCCCTCTTCAGCTTAGCCCGTCTGTGAgaactcctgacacct   2280
       A--T--A--L--L--L--S--L--F--S--L--A--R--L--***...............
2281   gaagcttgattcccaagtttccatagcaacaggaaaaagagaaaaaaaaaaatccaaatc   2340
       ............................................................
2341   tgaagattgcagtttacagctctcgaacttcacaaccaggcctcaattgtttcagatttt   2400
       ............................................................
2401   cgttttctttgcaattttcacttaatctgtacttcaccattttgacagcatcttcctttt   2460
       ............................................................
2461   cccctttaattaatggaattctctgaattttcccttgagtgttttaaacatcatggcata   2520
       ............................................................
2521   gaacttgaccttctgggaggaggaacaacgaatacttttcctgatgtgtttgccatgttg   2580
       ............................................................
2581   ctagtcagcactccacacttccggtttggtctgtgggttagtatttgtatatgtatgcgt   2640
       ............................................................
2641   atctgtatgtgtatatacccagtatttatagagacagactacagaagcttggtcctcata   2700
       ............................................................
2701   tactgtcacccttccccgagaggttaagcacagaaggggtagaagctaaagcagccgacc   2760
       ............................................................
2761   cctccagggcctcagcgtccagttcagcactagggcagagcacagagctggagcttctcc   2820
       ............................................................
2821   tcaacccactgtccaggcaggtccgcagagggggacagttttcactgccatcctatgtga   2880
       ............................................................
2881   ggatgatcctgagtgacggtggtgaggagcagagctggacgtttcaccatcaaatgcatg   2940
       ............................................................
2941   ggcgtctacctctatgcatttgtaagtgtccggaaaccacagtcccagtgggttttctgg   3000
       ............................................................
3001   ggacctggcccagaatagagaaccttgccctccttggcatacgtacaacagccagcgtca   3060
       ............................................................
3061   tcatggaggtcacacatgcgtccgaagaggccatcaggtaccatgtgtatacatatatcg   3120
       ............................................................
3121   gcccacatgtacagacatacatttacgcacatgcacagcgatcgtttcctatatacacgc   3180
       ............................................................
3181   atacaatagagtaaatacaggtagttttaaaagtacccttttgtgtgaatcgacggccgt   3240
       ............................................................
3241   cgtttgcaaacctgaaaataaaagatgttcattatgtatgagaagtaactgatttttatt   3300
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3301   ctgtgagcatgcgaacataagacggaggttagtgcttgtaccaaggttatcttcttgtcc   3360
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3361   atacgctgtaactgaaccatcaaagctcacaccaaatttttctagcagataaactagtga   3420
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3421   cagcctgtggctttttcttagcgctcgacacgagctagggtcaggtaagtgtcttagcat   3480
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3541   acacgctttcttatgcaatctctgtttgcacctgtgcttttgagtttgccttcataggaa   3600
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3601   ctagaagtcatatgttgtctttattgtagtgaaattatgcagatagagttccatatattg   3660
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3661   tatttgtttctatagtaaatctttttgaagcaaaaaaaaaaaaaaaa                3720
       ...............................................