Imprinted Gene Databases

Sus scrofa: PRIM2

DNA primase subunit 2

Bischoff et al. Biol Reprod, 81: 906–920, 2009

Species Gene Aliases Location Status Expressed Allele
Sus scrofa PRIM2   7  Imprinted Paternal
Homo sapiens PRIM2 p58, PRIM2A  6p11.2  Conflicting Data Biallelic 
1      tatgaactctcccgccactcgggaaaagcggttgtttgggtttgttcggcttcacgtttg     60
       ............................................................
61     ctgtggttgcaggtaccaagATGGAGTTTTTTGGAGGAAAGCGGAGGAAACTGAGGTTGG    120
       ....................M--E--F--F--G--G--K--R--R--K--L--R--L--A
121    CAGATGACCAAAGGAATGCTTGCTATCCACATAGCCTTCAGTTTTATTTGCAACCACCTT    180
       --D--D--Q--R--N--A--C--Y--P--H--S--L--Q--F--Y--L--Q--P--P--S
181    CTGAAAACATATCTTTGACAGAGTTTGAAAACTTGGCTTTTGAGAGACTTAAGTTGCTAA    240
       --E--N--I--S--L--T--E--F--E--N--L--A--F--E--R--L--K--L--L--K
241    AATCAGTTGAGAGTCTTGGTGTGAGCTATGTGAAAGGAACCGAGCAGTACCAGAGCAAGC    300
       --S--V--E--S--L--G--V--S--Y--V--K--G--T--E--Q--Y--Q--S--K--L
301    TGGAGGCTGAGCTTCGGAAGCTCAAGTTTTCCTACAGAGAAAACTTGGAAGATGAGTATG    360
       --E--A--E--L--R--K--L--K--F--S--Y--R--E--N--L--E--D--E--Y--E
361    AGCCACGAAGAAGAGATCACATCTCGCACTTTATTCTGCGCCTTGCTTACTGCCAGTCTG    420
       --P--R--R--R--D--H--I--S--H--F--I--L--R--L--A--Y--C--Q--S--E
421    AAGATCTTAGGCGCTGGTTCATTCAACAAGAAATGGATCTCCTTCGATTTCGATTCCATA    480
       --D--L--R--R--W--F--I--Q--Q--E--M--D--L--L--R--F--R--F--H--I
481    TTTTACCCAAGGACAAAGTTCAGAGTTTCTTAAAGGACAGCCATTTGCAGTTTGAGGCTA    540
       --L--P--K--D--K--V--Q--S--F--L--K--D--S--H--L--Q--F--E--A--I
541    TAAGTGATGAAGAGAAGACTCTCCGAGAACAGGACATCATTGCTTCGTCTCCCAGTTTAA    600
       --S--D--E--E--K--T--L--R--E--Q--D--I--I--A--S--S--P--S--L--S
601    GTGGGACTCAGTTGGAGTTGGAGTCGGTTTATAAGATCCCTTTTGCTGATGCTTTGGATT    660
       --G--T--Q--L--E--L--E--S--V--Y--K--I--P--F--A--D--A--L--D--L
661    TGTTTCGAGGAAGGAGAGTCTATTTGGAAGATGGCTTTGCTTATGTACCACTCAAAGACA    720
       --F--R--G--R--R--V--Y--L--E--D--G--F--A--Y--V--P--L--K--D--I
721    TTGTGGCAATCATCCTGAATGAATTTAGAACCAAACTATCCAAGGCTTTGGCTTTGACAG    780
       --V--A--I--I--L--N--E--F--R--T--K--L--S--K--A--L--A--L--T--A
781    CCAGGTCCTTGCCTGCCGCGCAGTCGGACGAGAGACTCCAGCCTCTGCTCAACCACCTCA    840
       --R--S--L--P--A--A--Q--S--D--E--R--L--Q--P--L--L--N--H--L--S
841    GTCATTCCTACACTGGTCAGGACTACAGTGCACAGGGAAATGCTGGGAAGATTTCTTTGG    900
       --H--S--Y--T--G--Q--D--Y--S--A--Q--G--N--A--G--K--I--S--L--D
901    ATCAGATCGATTCTCTCTCTACCAAATCCTTCCCGCCTTGCATGCGTCAGTTACACAGAG    960
       --Q--I--D--S--L--S--T--K--S--F--P--P--C--M--R--Q--L--H--R--A
961    CCCTGCGGGAAAATCACCATCTTCGTCATGGGGGCCGCATGCAGTATGGGCTCTTCCTGA   1020
       --L--R--E--N--H--H--L--R--H--G--G--R--M--Q--Y--G--L--F--L--K
1021   AGGGCATTGGTTTGACCTTGGAACAGGCGTTACAGTTCTGGAAGCAAGAATTTATCAAAG   1080
       --G--I--G--L--T--L--E--Q--A--L--Q--F--W--K--Q--E--F--I--K--G
1081   GAAAGATGGATCCAGACAAGTTTGATAAAGGCTACTCTTACAATATCCGTCATAGCTTCG   1140
       --K--M--D--P--D--K--F--D--K--G--Y--S--Y--N--I--R--H--S--F--G
1141   GAAAGGAAGGCAAGAGAACAGACTATACGCCTTATAGTTGCATGAAGATTATCCTCACCA   1200
       --K--E--G--K--R--T--D--Y--T--P--Y--S--C--M--K--I--I--L--T--N
1201   ATCCACCAAGCCAAGGGGATTATCATGGGTGTCCATTCCGCCACAATGACCCCGAGCTAC   1260
       --P--P--S--Q--G--D--Y--H--G--C--P--F--R--H--N--D--P--E--L--L
1261   TGAGGCAGAAGCTGCAGGCCTATAAGATCTCCCCCACCGGGATCGCCCAGATTTTGGATT   1320
       --R--Q--K--L--Q--A--Y--K--I--S--P--T--G--I--A--Q--I--L--D--L
1321   TAGTGAAAGGCACACATTACCAGGTAGCCTGTCAGAAGTACTTTGAGGTGACACATAATG   1380
       --V--K--G--T--H--Y--Q--V--A--C--Q--K--Y--F--E--V--T--H--N--V
1381   TGGATGACTGTGGCTTTTCTTTGAGTCATCCAAACCAGTTCTTTTTTGAGAGCCAGAAGA   1440
       --D--D--C--G--F--S--L--S--H--P--N--Q--F--F--F--E--S--Q--K--I
1441   TTCTGAATGGTGGCAAAGACCTCAAGAAGGAATCCACTCAGCCAGAAACACCCCAGCCCA   1500
       --L--N--G--G--K--D--L--K--K--E--S--T--Q--P--E--T--P--Q--P--R
1501   GAGCGAATGTCCAGAAGAGCAAAGACGCATCCTCTGCCCTGGCCTCGCTCAACTCCTCCC   1560
       --A--N--V--Q--K--S--K--D--A--S--S--A--L--A--S--L--N--S--S--L
1561   TGGAGATGGACATGGAGGAGCTGGAGGAGCTGCTTCAGTGAgcggttcctgagcccgtgg   1620
       --E--M--D--M--E--E--L--E--E--L--L--Q--***...................
1621   tgatcttgcttcctcatcggctattactggctagttgtatgattttgtgtttttcttctc   1680
       ............................................................
1681   catctgcctcctccctccaccctaccccactttaatccactgacgtgggcacgcacttct   1740
       ............................................................
1741   tgggaagccaggcttgccagtgaaaacaatgtcctccactatattttgctttaagatcta   1800
       ............................................................
1801   gcacttggatggtgtggtctctgccctcttttaagagatgagacgctttctggattggtt   1860
       ............................................................
1861   acagcccctagaaatagtaccactagaacagcttttattgtaacccttatcactgtaatt   1920
       ............................................................
1921   ctgacccagtccttttctggaccatctttgtgaataaattatcaaaatgttgaatgaaaa   1980
       ............................................................
1981   aaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaa                                   2040
       ............................