Imprinted Gene Databases

Macaca mulatta: NDN

Necdin homolog

Cheong et al. Genome Res 25 :611-623, 2015

Species Gene Aliases Location Status Expressed Allele
Sus scrofa NECD NDN  Imprinted Paternal
Mus musculus Ndn Peg6, AI528698  7 28.0 cM  Imprinted Paternal
Macaca mulatta NDN   Imprinted Paternal
Homo sapiens NDN HsT16328  15q11.2-q12  Imprinted Paternal
1      gcggaaggcgccgcgcacagcaacgcgcacttcctctccaggaatccgcggagggagcgc     60
       ............................................................
61     aggcttgaagagctcctggacgcagaggccctgcccttgccagacggcgcagatATGTCA    120
       ......................................................M--S--
121    GAACAAAGTAAGGATCTAAGCGACCCTAACTTTGCAGCCGAGGCCCCCAGCTCCGAGGTG    180
       E--Q--S--K--D--L--S--D--P--N--F--A--A--E--A--P--S--S--E--V--
181    CACAGCAGCCCTGGGGTTCCGGAGGGGGTTCCTCCGTCCGAGACCCTGGCAGAGCCGCAG    240
       H--S--S--P--G--V--P--E--G--V--P--P--S--E--T--L--A--E--P--Q--
241    AGCCCTCCTTTAGGCCCGACGGCCGCCCCGCAGGCCGCGCAGCCTCCCCAGGCCCCGAGC    300
       S--P--P--L--G--P--T--A--A--P--Q--A--A--Q--P--P--Q--A--P--S--
301    GACGAGGACGACCCGAAGGCCCTGCAGCAGGCCGCGGAGGAGGGCCGCGCCCACCAGGCC    360
       D--E--D--D--P--K--A--L--Q--Q--A--A--E--E--G--R--A--H--Q--A--
361    CCGAGCGCGGCCCAGCCCGGCCCGGCCCCGCCAGCCCCGGCGCAGCTGGTGCAGAAGGCG    420
       P--S--A--A--Q--P--G--P--A--P--P--A--P--A--Q--L--V--Q--K--A--
421    CACGAGCTCATGTGGTACGTGCTGGTCAAGGACCAGAAGAAGATGATCATCTGGTTTCCA    480
       H--E--L--M--W--Y--V--L--V--K--D--Q--K--K--M--I--I--W--F--P--
481    GACATGGTGAAAGATGTCATCGGCAGCTACAAGAAGTGGTGCAGGAGCATCCTCCGGCGC    540
       D--M--V--K--D--V--I--G--S--Y--K--K--W--C--R--S--I--L--R--R--
541    ACCAGCCTCATCCTCGCCCGGGTGTTCGGGCTGCACCTGAGGCTAACCAGCCTGCACACC    600
       T--S--L--I--L--A--R--V--F--G--L--H--L--R--L--T--S--L--H--T--
601    ATGGAGTTTGCGCTGGTCAAAGCGCTGGAGCCCGAGGAGCTGGACAGGGTGGCGCTGAGC    660
       M--E--F--A--L--V--K--A--L--E--P--E--E--L--D--R--V--A--L--S--
661    AACCGCATGCCCATGACAGGTCTCCTCCTCATGATCCTGAGCCTCATCTACGTGAAGGGC    720
       N--R--M--P--M--T--G--L--L--L--M--I--L--S--L--I--Y--V--K--G--
721    CGCGGCGCCAGAGAGAGCGCGGTCTGGAACGTGCTCCGCATCCTGGGGCTGCGGCCCTGG    780
       R--G--A--R--E--S--A--V--W--N--V--L--R--I--L--G--L--R--P--W--
781    AAGAAGCACTCCACCTTCGGGGACGTGCGGAAGCTCATCACTGAGGAGTTCGTCCAGCAG    840
       K--K--H--S--T--F--G--D--V--R--K--L--I--T--E--E--F--V--Q--Q--
841    AATTACCTGAAGTACCAGCGCGTCCCGTACGTGGAGCCGCCCGAGTACGAGTTCTTCTGG    900
       N--Y--L--K--Y--Q--R--V--P--Y--V--E--P--P--E--Y--E--F--F--W--
901    GGCTCCCGGGCCAGCCGCGAAATCACCAAGCTGCAAATCATGGAGTTCCTGGCCAGGGTC    960
       G--S--R--A--S--R--E--I--T--K--L--Q--I--M--E--F--L--A--R--V--
961    TTTAAGAAAGACCCCCAGGCCTGGCCCTCCCGATACAGAGAGGCTCTGGAGGAGGCCAGA   1020
       F--K--K--D--P--Q--A--W--P--S--R--Y--R--E--A--L--E--E--A--R--
1021   GCTCTGCGGGAGGCTAATCCCGCTGCCCACTGCCCTCGCAGCAGTGTCTCCGAGGACTAG   1080
       A--L--R--E--A--N--P--A--A--H--C--P--R--S--S--V--S--E--D--***
1081   ccaagtctggaggcagatgaatgctttctgatcctcaccagggctgtggaagggtggggg   1140
       ............................................................
1141   tgggtcattagagtgttcaggatttacagtgcagtattcacgtgtaacttttaagttttc   1200
       ............................................................
1201   agtacagtgcttttatacctttaatgcaatgttgtattcatttgggtactattgtgtagt   1260
       ............................................................
1261   atttaggatgtatgcatgtttgtttatatgtaagcttggttggtgctttcgcttttgtgg   1320
       ............................................................
1321   tacctttcttggatttttgtatcagagacgtgctaaactgatgaagtacattgagaacgt   1380
       ............................................................
1381   ttccatcttattaatttacatgggactgagatgtgtgttggggtagactgctcctgcaga   1440
       ............................................................
1441   gtttggaaaaactcaccagcaaagccggcctaaccaagaaatgtcaaggccctcatgacc   1500
       ............................................................
1501   ttgctggggactgaaaacatcctcgtggagtaaactaatttgaactggactggtctcaat   1560
       ............................................................
1561   gtgagagcacttggcacactttactaaacacatatacaaccccaccgtgagtcaacttta   1620
       ............................................................
1621   aagtaaacattaaagattcttgtgatacaatcatttctggaagtgtatgttatcatttta   1680
       ............................................................
1681   acaaagcagtatggttgggaatgagacaattctctgttttacagtatacacagatataac   1740
       ............................................................
1741   tatttcccctaacggggtgggaaaaatcgctactcatgattactcctaaatttgtgaagt   1800
       ............................................................
1801   ttgtggttttgtctttaactcatgtttatttcaaaaacatgcacaaatatagacaagcat   1860
       ............................................................
1861   aaaaaacaaaacagtaagattgtccataatcacatcctatgggaataaaaaccaaaaata   1920
       ............................................................
1921   a                                                              1980
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