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Homo sapiens: HNF1A

HNF1 homeobox A
Species Gene Aliases Location Status Expressed Allele
Homo sapiens HNF1A HNF1, LFB1, TCF1, HNF4A, MODY3, TCF-1, HNF-1A, IDDM20  12q24.31  Imprinted
1      agctccaatgtaaacagaacaggcaggggccctgattcacgggccgctggggccagggtt     60
       ............................................................
61     gggggttgggggtgcccacagggcttggctagtggggttttgggggggcagtgggtgcaa    120
       ............................................................
121    ggagtttggtttgtgtctgccggccggcaggcaaacgcaacccacgcggtgggggaggcg    180
       ............................................................
181    gctagcgtggtggacccgggccgcgtggccctgtggcagccgagccATGGTTTCTAAACT    240
       ..............................................M--V--S--K--L-
241    GAGCCAGCTGCAGACGGAGCTCCTGGCGGCCCTGCTCGAGTCAGGGCTGAGCAAAGAGGC    300
       -S--Q--L--Q--T--E--L--L--A--A--L--L--E--S--G--L--S--K--E--A-
301    ACTGATCCAGGCACTGGGTGAGCCGGGGCCCTACCTCCTGGCTGGAGAAGGCCCCCTGGA    360
       -L--I--Q--A--L--G--E--P--G--P--Y--L--L--A--G--E--G--P--L--D-
361    CAAGGGGGAGTCCTGCGGCGGCGGTCGAGGGGAGCTGGCTGAGCTGCCCAATGGGCTGGG    420
       -K--G--E--S--C--G--G--G--R--G--E--L--A--E--L--P--N--G--L--G-
421    GGAGACTCGGGGCTCCGAGGACGAGACGGACGACGATGGGGAAGACTTCACGCCACCCAT    480
       -E--T--R--G--S--E--D--E--T--D--D--D--G--E--D--F--T--P--P--I-
481    CCTCAAAGAGCTGGAGAACCTCAGCCCTGAGGAGGCGGCCCACCAGAAAGCCGTGGTGGA    540
       -L--K--E--L--E--N--L--S--P--E--E--A--A--H--Q--K--A--V--V--E-
541    GACCCTTCTGCAGGAGGACCCGTGGCGTGTGGCGAAGATGGTCAAGTCCTACCTGCAGCA    600
       -T--L--L--Q--E--D--P--W--R--V--A--K--M--V--K--S--Y--L--Q--Q-
601    GCACAACATCCCACAGCGGGAGGTGGTCGATACCACTGGCCTCAACCAGTCCCACCTGTC    660
       -H--N--I--P--Q--R--E--V--V--D--T--T--G--L--N--Q--S--H--L--S-
661    CCAACACCTCAACAAGGGCACTCCCATGAAGACGCAGAAGCGGGCCGCCCTGTACACCTG    720
       -Q--H--L--N--K--G--T--P--M--K--T--Q--K--R--A--A--L--Y--T--W-
721    GTACGTCCGCAAGCAGCGAGAGGTGGCGCAGCAGTTCACCCATGCAGGGCAGGGAGGGCT    780
       -Y--V--R--K--Q--R--E--V--A--Q--Q--F--T--H--A--G--Q--G--G--L-
781    GATTGAAGAGCCCACAGGTGATGAGCTACCAACCAAGAAGGGGCGGAGGAACCGTTTCAA    840
       -I--E--E--P--T--G--D--E--L--P--T--K--K--G--R--R--N--R--F--K-
841    GTGGGGCCCAGCATCCCAGCAGATCCTGTTCCAGGCCTATGAGAGGCAGAAGAACCCTAG    900
       -W--G--P--A--S--Q--Q--I--L--F--Q--A--Y--E--R--Q--K--N--P--S-
901    CAAGGAGGAGCGAGAGACGCTAGTGGAGGAGTGCAATAGGGCGGAATGCATCCAGAGAGG    960
       -K--E--E--R--E--T--L--V--E--E--C--N--R--A--E--C--I--Q--R--G-
961    GGTGTCCCCATCACAGGCACAGGGGCTGGGCTCCAACCTCGTCACGGAGGTGCGTGTCTA   1020
       -V--S--P--S--Q--A--Q--G--L--G--S--N--L--V--T--E--V--R--V--Y-
1021   CAACTGGTTTGCCAACCGGCGCAAAGAAGAAGCCTTCCGGCACAAGCTGGCCATGGACAC   1080
       -N--W--F--A--N--R--R--K--E--E--A--F--R--H--K--L--A--M--D--T-
1081   GTACAGCGGGCCCCCCCCAGGGCCAGGCCCGGGACCTGCGCTGCCCGCTCACAGCTCCCC   1140
       -Y--S--G--P--P--P--G--P--G--P--G--P--A--L--P--A--H--S--S--P-
1141   TGGCCTGCCTCCACCTGCCCTCTCCCCCAGTAAGGTCCACGGTGTGCGCTATGGACAGCC   1200
       -G--L--P--P--P--A--L--S--P--S--K--V--H--G--V--R--Y--G--Q--P-
1201   TGCGACCAGTGAGACTGCAGAAGTACCCTCAAGCAGCGGCGGTCCCTTAGTGACAGTGTC   1260
       -A--T--S--E--T--A--E--V--P--S--S--S--G--G--P--L--V--T--V--S-
1261   TACACCCCTCCACCAAGTGTCCCCCACGGGCCTGGAGCCCAGCCACAGCCTGCTGAGTAC   1320
       -T--P--L--H--Q--V--S--P--T--G--L--E--P--S--H--S--L--L--S--T-
1321   AGAAGCCAAGCTGGTCTCAGCAGCTGGGGGCCCCCTCCCCCCTGTCAGCACCCTGACAGC   1380
       -E--A--K--L--V--S--A--A--G--G--P--L--P--P--V--S--T--L--T--A-
1381   ACTGCACAGCTTGGAGCAGACATCCCCAGGCCTCAACCAGCAGCCCCAGAACCTCATCAT   1440
       -L--H--S--L--E--Q--T--S--P--G--L--N--Q--Q--P--Q--N--L--I--M-
1441   GGCCTCACTTCCTGGGGTCATGACCATCGGGCCTGGTGAGCCTGCCTCCCTGGGTCCTAC   1500
       -A--S--L--P--G--V--M--T--I--G--P--G--E--P--A--S--L--G--P--T-
1501   GTTCACCAACACAGGTGCCTCCACCCTGGTCATCGGCCTGGCCTCCACGCAGGCACAGAG   1560
       -F--T--N--T--G--A--S--T--L--V--I--G--L--A--S--T--Q--A--Q--S-
1561   TGTGCCGGTCATCAACAGCATGGGCAGCAGCCTGACCACCCTGCAGCCCGTCCAGTTCTC   1620
       -V--P--V--I--N--S--M--G--S--S--L--T--T--L--Q--P--V--Q--F--S-
1621   CCAGCCGCTGCACCCCTCCTACCAGCAGCCGCTCATGCCACCTGTGCAGAGCCATGTGAC   1680
       -Q--P--L--H--P--S--Y--Q--Q--P--L--M--P--P--V--Q--S--H--V--T-
1681   CCAGAGCCCCTTCATGGCCACCATGGCTCAGCTGCAGAGCCCCCACGCCCTCTACAGCCA   1740
       -Q--S--P--F--M--A--T--M--A--Q--L--Q--S--P--H--A--L--Y--S--H-
1741   CAAGCCCGAGGTGGCCCAGTACACCCACACGGGCCTGCTCCCGCAGACTATGCTCATCAC   1800
       -K--P--E--V--A--Q--Y--T--H--T--G--L--L--P--Q--T--M--L--I--T-
1801   CGACACCACCAACCTGAGCGCCCTGGCCAGCCTCACGCCCACCAAGCAGGTCTTCACCTC   1860
       -D--T--T--N--L--S--A--L--A--S--L--T--P--T--K--Q--V--F--T--S-
1861   AGACACTGAGGCCTCCAGTGAGTCCGGGCTTCACACGCCGGCATCTCAGGCCACCACCCT   1920
       -D--T--E--A--S--S--E--S--G--L--H--T--P--A--S--Q--A--T--T--L-
1921   CCACGTCCCCAGCCAGGACCCTGCCAGCATCCAGCACCTGCAGCCGGCCCACCGGCTCAG   1980
       -H--V--P--S--Q--D--P--A--S--I--Q--H--L--Q--P--A--H--R--L--S-
1981   CGCCAGCCCCACAGTGTCCTCCAGCAGCCTGGTGCTGTACCAGAGCTCAGACTCCAGCAA   2040
       -A--S--P--T--V--S--S--S--S--L--V--L--Y--Q--S--S--D--S--S--N-
2041   TGGCCAGAGCCACCTGCTGCCATCCAACCACAGCGTCATCGAGACCTTCATCTCCACCCA   2100
       -G--Q--S--H--L--L--P--S--N--H--S--V--I--E--T--F--I--S--T--Q-
2101   GATGGCCTCTTCCTCCCAGTAAccacggcacctgggccctggggcctgtactgcctgctt   2160
       -M--A--S--S--S--Q--***......................................
2161   ggggggtgatgagggcagcagccagccctgcctggaggacctgagcctgccgagcaaccg   2220
       ............................................................
2221   tggcccttcctggacagctgtgcctcgctccccactctgctctgatgcatcagaaaggga   2280
       ............................................................
2281   gggctctgaggcgccccaacccgtggaggctgctcggggtgcacaggagggggtcgtgga   2340
       ............................................................
2341   gagctaggagcaaagcctgttcatggcagatgtaggagggactgtcgctgcttcgtggga   2400
       ............................................................
2401   tacagtcttcttacttggaactgaagggggcggcctatgacttgggcacccccagcctgg   2460
       ............................................................
2461   gcctatggagagccctgggaccgctacaccactctggcagccacacttctcaggacacag   2520
       ............................................................
2521   gcctgtgtagctgtgacctgctgagctctgagaggccctggatcagcgtggccttgttct   2580
       ............................................................
2581   gtcaccaatgtacccaccgggccactccttcctgccccaactccttccagctagtgaccc   2640
       ............................................................
2641   acatgccatttgtactgaccccatcacctactcacacaggcatttcctgggtggctactc   2700
       ............................................................
2701   tgtgccagagcctggggctctaacgcctgagcccagggaggccgaagctaacagggaagg   2760
       ............................................................
2761   caggcagggctctcctggcttcccatccccagcgattccctctcccaggccccatgacct   2820
       ............................................................
2821   ccagctttcctgtatttgttcccaagagcatcatgcctctgaggccagcctggcctcctg   2880
       ............................................................
2881   cctctactgggaaggctacttcggggctgggaagtcgtccttactcctgtgggagcctcg   2940
       ............................................................
2941   caacccgtgccaagtccaggtcctggtggggcagctcctctgtctcgagcgccctgcaga   3000
       ............................................................
3001   ccctgcccttgtttggggcaggagtagctgagctcacaaggcagcaaggcccgagcagct   3060
       ............................................................
3061   gagcagggccggggaactggccaagctgaggtgcccaggagaagaaagaggtgaccccag   3120
       ............................................................
3121   ggcacaggagctacctgtgtggacaggactaacactcagaagcctgggggcctggctggc   3180
       ............................................................
3181   tgagggcagttcgcagccaccctgaggagtctgaggtcctgagcactgccaggagggaca   3240
       ............................................................
3241   aaggagcctgtgaacccaggacaagcatggtcccacatccctgggcctgctgctgagaac   3300
       ............................................................
3301   ctggccttcagtgtaccgcgtctaccctgggattcaggaaaaggcctggggtgacccggc   3360
       ............................................................
3361   accccctgcagcttgtagccagccggggcgagtggcacgtttatttaacttttagtaaag   3420
       ............................................................
3421   tcaaggagaaatgcggtggaaa                                         3480
       ......................