Imprinted Gene Databases

Sus scrofa: SNRPN

Small nuclear ribonucleoprotein polypeptide N

Bischoff et al. Biol Reprod, 81: 906–920, 2009

Species Gene Aliases Location Status Expressed Allele
Mus musculus Snrpn SMN, Peg4, HCERN3, MGC18604, MGC30325, 2410045I01Rik  7 29.0 cM  Imprinted Paternal
Mus musculus Snurf Snrpn, MGC18604, MGC30325, 2410045I01Rik  7 B5  Imprinted Paternal
Bos taurus SNRPN   21  Imprinted Paternal
Macaca mulatta SNRPN   Imprinted Paternal
Sus scrofa SNRPN   Un  Imprinted Paternal
Homo sapiens SNRPN SMN, PWCR, SM-D, RT-LI, HCERN3, SNRNP-N, FLJ33569, FLJ36996, FLJ39265, MGC29886, SNURF-SNRPN, DKFZp762N022, DKFZp686C0927, DKFZp761I1912, DKFZp686M12165  15q11.2  Imprinted Paternal
1      ggcagatctgtggtgccgccgcggcaagagcagcgcagagtggagtgaccgctggagatg     60
       ............................................................
61     cctgaggttactttttgaggagtggccagcggcgcaatggagcgggccagggaccgctta    120
       ............................................................
121    cacctgagacggaccacagaacagcacgtaccagaggtggaagtccaagtcaaacgtaga    180
       ............................................................
181    aggacagcttcactgagcaaccaggagtgtcagctgtatctgaggcgatctcagcagcag    240
       ............................................................
241    caactccctgtggtggattttcaagcagaattgagacaggcattcttagctgagacacca    300
       ............................................................
301    aggggtggttaaagcagtattgcaacacactcaaggagctgattccaagaggaaaaaaaa    360
       ............................................................
361    aatcaaaaaaacaggctccatctactatttgaagcttctgccccagcttgcattgtttgt    420
       ............................................................
421    aggagaacctgcatcctacctttatctgtagccttcccttaggtcttaaggatcctgaaa    480
       ............................................................
481    ttttcctgtggacattggatttggtgaaaaagcaatcATGACCGTGGGAAAGAGCAGCAA    540
       .....................................M--T--V--G--K--S--S--K-
541    GATGCTGCAGCACATTGACTATAGAATGAGATGTATCCTGCAAGATGGCCGGATCTTCAT    600
       -M--L--Q--H--I--D--Y--R--M--R--C--I--L--Q--D--G--R--I--F--I-
601    TGGCACCTTTAAGGCTTTTGACAAGCATATGAACTTGATCCTCTGTGATTGTGATGAATT    660
       -G--T--F--K--A--F--D--K--H--M--N--L--I--L--C--D--C--D--E--F-
661    CAGGAAGATCAAGCCAAAGAACGCAAAGCAGCCAGAGCGTGAAGAAAAGCGGGTTTTGGG    720
       -R--K--I--K--P--K--N--A--K--Q--P--E--R--E--E--K--R--V--L--G-
721    TCTGGTGTTGCTGCGTGGGGAAAATTTGGTTTCCATGACTGTGGAGGGACCACCCCCCAA    780
       -L--V--L--L--R--G--E--N--L--V--S--M--T--V--E--G--P--P--P--K-
781    AGATACTGGAATTGCTCGTGTACCACTTGCTGGAGCTGCAGGAGGCCCTGGGGTTGGCAG    840
       -D--T--G--I--A--R--V--P--L--A--G--A--A--G--G--P--G--V--G--R-
841    GGCAGCTGGCAGAGGTGTACCAGCTGGTGTTCCAATTCCCCAGGCACCTGCTGGATTAGC    900
       -A--A--G--R--G--V--P--A--G--V--P--I--P--Q--A--P--A--G--L--A-
901    AGGTCCTGTCCGAGGGGTTGGGGGGCCATCCCAACAGGTAATGACCCCACAGGGAAGAGG    960
       -G--P--V--R--G--V--G--G--P--S--Q--Q--V--M--T--P--Q--G--R--G-
961    CACTGTAGCTGCTGCTGCAGTTGCTGCTACTGCCAGCATTGCTGGAGCCCCAACTCAGTA   1020
       -T--V--A--A--A--A--V--A--A--T--A--S--I--A--G--A--P--T--Q--Y-
1021   TCCACCAGGCCGGGGGACTCCACCCACACCTGTTGGTCGAGCAACCCCACCTCCAGGAAT   1080
       -P--P--G--R--G--T--P--P--T--P--V--G--R--A--T--P--P--P--G--I-
1081   TATGGCTCCTCCACCTGGTATGAGACCACCAATGGGCCCGCCAATCGGACTTCCTCCTAC   1140
       -M--A--P--P--P--G--M--R--P--P--M--G--P--P--I--G--L--P--P--T-
1141   TCGAGGGACGCCAATAGGCATGCCCCCTCCAGGAATGAGACCCCCTCCACCAGGAATTAG   1200
       -R--G--T--P--I--G--M--P--P--P--G--M--R--P--P--P--P--G--I--R-
1201   AGGTCCACCTCCCCCAGGAATGCGTCCACCAAGACCCTAGaatactgttgatccttctta   1260
       -G--P--P--P--P--G--M--R--P--P--R--P--***....................
1261   gtcacttttttccctgcaatgtgtcttgtgaaatgtgtggagtgttcgtgagcttttgtc   1320
       ............................................................
1321   ccctatttgctgcattaatattagcgaataaatgcatagagcaattaaaaaaaaaaaaaa   1380
       ............................................................
1381   aaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaa                               1440
       ................................