Imprinted Gene Databases

Sus scrofa: NESP55

Neuroendocrine secretory protein 55

Oczkowicz et al. Gene Expr Patterns 12: 18-23, 2012

Species Gene Aliases Location Status Expressed Allele
Mus musculus Gnas P1, P2, P3, GSP, Gsa, POH, GPSA, Nesp, Gnas1, Nespl, PHP1A, PHP1B, Gnasxl, Nesp55, Oedsml, Oed-Sml, Gs-alpha, XLalphas, MGC118029, 5530400H20Rik, A930027G11Rik, C130027O20Rik  2 104.0 cM  Imprinted Isoform Dependent
Sus scrofa NESP55 GNAS complex locus  17q  Imprinted Maternal
1      cgcctcgccccgcggcggccatcagacccctcggcttcggcgcgaggggccgggagccgc     60
       ............................................................
61     gcgctcccctcggtcagaccgacaccaccctccccgcgcgctcctccccgaggagccgag    120
       ............................................................
121    cccgcgcccggcccgcccgcccggcgctgccccggccctctcggcccgcgtgaggccgcc    180
       ............................................................
181    cgcgcccggccccgccgccgccgccgcagcccggccgcgccccgcgccccgccgccgccg    240
       ............................................................
241    ccATGGGCTGTCTCGGAAACAGTAAGACCGAGGACCAGCGCAACGAGGAGAAGGCGCAGC    300
       ..M--G--C--L--G--N--S--K--T--E--D--Q--R--N--E--E--K--A--Q--R
301    GCGAGGCCAACAAAAAGATCGAGAAGCAGCTGCAGAAGGACAAGCAGGTCTACCGGGCCA    360
       --E--A--N--K--K--I--E--K--Q--L--Q--K--D--K--Q--V--Y--R--A--T
361    CGCACCGCCTGCTGCTGCTGGGTGCTGGAGAATCTGGTAAAAGCACCATTGTGAAGCAGA    420
       --H--R--L--L--L--L--G--A--G--E--S--G--K--S--T--I--V--K--Q--M
421    TGAGGATCCTGCATGTTAATGGGTTTAATGGAGAGGGCGGCGAAGAGGACCCGCAGGCTG    480
       --R--I--L--H--V--N--G--F--N--G--E--G--G--E--E--D--P--Q--A--A
481    CAAGGAGCAACAGCGATGGTGAGAAGGCCACCAAAGTGCAGGACATCAAGAACAACCTGA    540
       --R--S--N--S--D--G--E--K--A--T--K--V--Q--D--I--K--N--N--L--K
541    AAGAGGCCATTGAAACCATCGTGGCTGCCATGAGCAACCTGGTGCCTCCAGTGGAGCTGG    600
       --E--A--I--E--T--I--V--A--A--M--S--N--L--V--P--P--V--E--L--A
601    CCAACCCTGAGAACCAGTTCAGAGTGGACTACATCCTGAGCGTGATGAACGTGCCTGACT    660
       --N--P--E--N--Q--F--R--V--D--Y--I--L--S--V--M--N--V--P--D--F
661    TTGACTTCCCTCCCGAGTTCTACGAGCATGCCAAGGCTCTGTGGGAGGACGAGGGCGTGC    720
       --D--F--P--P--E--F--Y--E--H--A--K--A--L--W--E--D--E--G--V--R
721    GCGCCTGCTACGAGCGCTCCAACGAGTACCAGCTCATCGACTGCGCCCAGTACTTCCTGG    780
       --A--C--Y--E--R--S--N--E--Y--Q--L--I--D--C--A--Q--Y--F--L--D
781    ACAAGATTGACGTCATCAAGCAGGCTGACTACGTGCCCAGCGACCAGGACCTGCTCCGCT    840
       --K--I--D--V--I--K--Q--A--D--Y--V--P--S--D--Q--D--L--L--R--C
841    GCCGCGTCCTGACTTCTGGAATCTTTGAGACCAAGTTCCAGGTGGACAAAGTCAACTTCC    900
       --R--V--L--T--S--G--I--F--E--T--K--F--Q--V--D--K--V--N--F--H
901    ACATGTTTGACGTCGGTGGCCAGCGTGACGAGCGCCGCAAATGGATCCAATGCTTCAATG    960
       --M--F--D--V--G--G--Q--R--D--E--R--R--K--W--I--Q--C--F--N--D
961    ATGTGACCGCCATCATTTTCGTGGTCGCCAGCAGCAGCTACAACATGGTCATTCGGGAGG   1020
       --V--T--A--I--I--F--V--V--A--S--S--S--Y--N--M--V--I--R--E--D
1021   ACAACCAGACCAACCGCCTGCAGGAGGCCCTGAACCTCTTCAAGAGCATCTGGAACAACA   1080
       --N--Q--T--N--R--L--Q--E--A--L--N--L--F--K--S--I--W--N--N--R
1081   GATGGCTGCGCACCATCTCTGTGATTCTGTTCCTCAACAAGCAAGATCTGCTGGCTGAGA   1140
       --W--L--R--T--I--S--V--I--L--F--L--N--K--Q--D--L--L--A--E--K
1141   AAGTCCTCGCTGGAAAATCGAAGATTGAGGACTACTTTCCAGAATTTGCTCGCTACACTA   1200
       --V--L--A--G--K--S--K--I--E--D--Y--F--P--E--F--A--R--Y--T--T
1201   CTCCTGAGGATGCAACTCCCGAGCCCGGAGAGGACCCACGCGTGACCCGGGCCAAGTACT   1260
       --P--E--D--A--T--P--E--P--G--E--D--P--R--V--T--R--A--K--Y--F
1261   TCATTCGAGATGAATTTCTGAGAATCAGCACTGCTAGTGGAGACGGGCGCCACTACTGCT   1320
       --I--R--D--E--F--L--R--I--S--T--A--S--G--D--G--R--H--Y--C--Y
1321   ACCCTCACTTCACCTGCGCTGTGGACACTGAGAACATCCGCCGTGTGTTCAACGACTGCC   1380
       --P--H--F--T--C--A--V--D--T--E--N--I--R--R--V--F--N--D--C--R
1381   GAGACATCATCCAGCGCATGCACCTCCGTCAGTACGAGCTGCTCTAAgaagggaacctct   1440
       --D--I--I--Q--R--M--H--L--R--Q--Y--E--L--L--***.............
1441   aaatttaattaaggccttaagcacaattaattaaacgtgaaatgtaattgtacacgcggt   1500
       ............................................................
1501   tgatcacccaccatagggcctgattaacaaagcaacctttcctgtccctcaagtgatttt   1560
       ............................................................
1561   gcgaaaccccctttacccttccgcttgcttaaatattccaaatttagaaagcttaaggcg   1620
       ............................................................
1621   gcctacagaaaaagaatttaaaaaaaggccacaaacgttccctctctctttaagtaacta   1680
       ............................................................
1681   aaataatagcagcaaacagaaataaagaaataaaataaaagaaataaatgaaataaatga   1740
       ............................................................
1741   aacaaatgaaacaaatgaaataaatattgtgttgtgcagcattaaaaaaaattcaaaata   1800
       ............................................................
1801   aaaattaaaagtgagcaaa                                            1860
       ...................