Imprinted Gene Databases

Sus scrofa: COPG2

COPI coat complex subunit gamma 2

Bischoff et al. Biol Reprod, 81: 906–920, 2009

Species Gene Aliases Location Status Expressed Allele
Monodelphis domestica COPG2     Not Imprinted Biallelic
Sus scrofa COPG2   18  Imprinted Maternal
Ovis aries COPG2   Imprinted Maternal
Bos taurus COPG2   Not Imprinted Biallelic
Mus musculus Copg2 AW227625  6 A3.3  Imprinted Maternal
Homo sapiens COPG2 2-COP, FLJ11781, DKFZp761N09121  7q32  Conflicting Data Paternal
1      gcggggggtctgggcgctgggaagtcgtccaagATGATTAAAAAATTCGACAAGAAGGAC     60
       .................................M--I--K--K--F--D--K--K--D--
61     GAGGAGTCTGGTAGTGGTTCCAATCCTTTTCGGCATCTGGAGAAGAGTGCTGTCTTACAG    120
       E--E--S--G--S--G--S--N--P--F--R--H--L--E--K--S--A--V--L--Q--
121    GAGGCTCGTATATTCAATGAAACACCCATCAATCCAAGAAGATGTTTGCATATTCTTACA    180
       E--A--R--I--F--N--E--T--P--I--N--P--R--R--C--L--H--I--L--T--
181    AAGATTCTTTACTTATTGAACCAGGGTGAATACTTTGGAACTACGGAAGCCACAGAAGCC    240
       K--I--L--Y--L--L--N--Q--G--E--Y--F--G--T--T--E--A--T--E--A--
241    TTCTTTGCAATGACTCGATTATTTCAATCTAATGATCAAACATTGAGAAGAATGTGCTAC    300
       F--F--A--M--T--R--L--F--Q--S--N--D--Q--T--L--R--R--M--C--Y--
301    CTTACTATCAAGGAAATGGCTACCATCTCCGAGGATGTGATAATTGTCACAAGCAGTCTG    360
       L--T--I--K--E--M--A--T--I--S--E--D--V--I--I--V--T--S--S--L--
361    ACTAAGGACATGACTGGAAAGGAAGATGTGTACCGAGGCCCAGCCATCAGGGCTCTCTGC    420
       T--K--D--M--T--G--K--E--D--V--Y--R--G--P--A--I--R--A--L--C--
421    AGAATCACTGATGGAACAATGTTGCAAGCCATTGAAAGATACATGAAGCAGGCCATTGTG    480
       R--I--T--D--G--T--M--L--Q--A--I--E--R--Y--M--K--Q--A--I--V--
481    GATAAAGTCTCCAGTGTATCCAGTTCAGCATTGGTATCTTCCTTACACATGATGAAGATA    540
       D--K--V--S--S--V--S--S--S--A--L--V--S--S--L--H--M--M--K--I--
541    AGCTATGACGTCGTTAAGCGCTGGGTCAATGAAGCCCAAGAAGCTGCTTCAAGTGATAAT    600
       S--Y--D--V--V--K--R--W--V--N--E--A--Q--E--A--A--S--S--D--N--
601    ATTATGGTCCAGTACCATGCATTGGGAGTTTTGTATCACCTTAAAAAGAATGATCGCCTT    660
       I--M--V--Q--Y--H--A--L--G--V--L--Y--H--L--K--K--N--D--R--L--
661    GCTGTTTCTAAGATGTTGAATAAATTTACTAAATGTGGTCTCAAGTCACAGTTTGCTTAC    720
       A--V--S--K--M--L--N--K--F--T--K--C--G--L--K--S--Q--F--A--Y--
721    TGCATGTTGATTCGAATTGCCAGTCGCTTACTAAAAGAAAATGAAGAGGGCCATGAAAGT    780
       C--M--L--I--R--I--A--S--R--L--L--K--E--N--E--E--G--H--E--S--
781    CCAGTCTTTGATTTCATTGAGAGCTGCTTGCGAAATAAACATGAAATGGTTATTTATGAA    840
       P--V--F--D--F--I--E--S--C--L--R--N--K--H--E--M--V--I--Y--E--
841    GCTGCTTCAGCTATCATCCATCTTCCTAACTGTAGTGCAAGGGAGTTGGCACCTGCTGTT    900
       A--A--S--A--I--I--H--L--P--N--C--S--A--R--E--L--A--P--A--V--
901    TCAGTTCTTCAGCTTTTCTGTAGTTCTCCTAAACCAGCTTTGAGATATGCAGCTGTGAGG    960
       S--V--L--Q--L--F--C--S--S--P--K--P--A--L--R--Y--A--A--V--R--
961    ACCTTGAACAAGGTGGCAATGAAGCACCCCTCAGCTGTTACTGCCTGCAATTTGGACTTA   1020
       T--L--N--K--V--A--M--K--H--P--S--A--V--T--A--C--N--L--D--L--
1021   GAAAACTTGATCACAGACTCAAACAGAAGCATTGCTACCCTGGCCATTACTACACTCCTC   1080
       E--N--L--I--T--D--S--N--R--S--I--A--T--L--A--I--T--T--L--L--
1081   AAAACAGGAAGTGAGAGCAGTGTGGACAGGCTTATGAAGCAGATATCATCTTTTGTGTCT   1140
       K--T--G--S--E--S--S--V--D--R--L--M--K--Q--I--S--S--F--V--S--
1141   GAAATCTCAGATGAGTTCAAGGTGGTGGTTGTACAGGCAATTAGTGCTCTCTGTCAGAAA   1200
       E--I--S--D--E--F--K--V--V--V--V--Q--A--I--S--A--L--C--Q--K--
1201   CACCCTCGAAAGCACAGTGTCATGATGACGTTCCTCTCCAACATGCTCCGAGATGATGGG   1260
       H--P--R--K--H--S--V--M--M--T--F--L--S--N--M--L--R--D--D--G--
1261   GGCTTTGAATATAAGCGGGCCATCGTGGACTGCATCATCAACATTGTGGAAGAAAACCCT   1320
       G--F--E--Y--K--R--A--I--V--D--C--I--I--N--I--V--E--E--N--P--
1321   GAGAGTAAAGAAGCGGGTCTAGCCCACCTTTGTGAATTCATCGAGGACTGTGAACACACT   1380
       E--S--K--E--A--G--L--A--H--L--C--E--F--I--E--D--C--E--H--T--
1381   GTTCTGGCTACTAAGATTCTACACTTGTTGGGCAAAGAGGGCCCCAGAACACCTGTTCCC   1440
       V--L--A--T--K--I--L--H--L--L--G--K--E--G--P--R--T--P--V--P--
1441   TCCAAGTATATCCGCTTTATTTTTAATAGGGTCGTACTGGAGAATGAGGCTGTCCGAGCT   1500
       S--K--Y--I--R--F--I--F--N--R--V--V--L--E--N--E--A--V--R--A--
1501   GCTGCTGTGAGTGCTTTGGCTAAATTTGGGGCTCAAAATGAGAATCTTCTCCCAAGCATC   1560
       A--A--V--S--A--L--A--K--F--G--A--Q--N--E--N--L--L--P--S--I--
1561   CTAGTACTCTTACAAAGGTGTATGATGGATACTGACGATGAGGTACGGGATAGAGCCACC   1620
       L--V--L--L--Q--R--C--M--M--D--T--D--D--E--V--R--D--R--A--T--
1621   TTCTATCTGAATGTGCTGCAGCAGAGGCAGATGGCACTGAATGCCACATATATCTTCAAT   1680
       F--Y--L--N--V--L--Q--Q--R--Q--M--A--L--N--A--T--Y--I--F--N--
1681   GGCCTCACAGTCTCTGTACCAGGGATGGAGAAAGCCTTACACCAGTACACCCTGGAACCT   1740
       G--L--T--V--S--V--P--G--M--E--K--A--L--H--Q--Y--T--L--E--P--
1741   TCAGAAAAACCCTTTGATATGAAATCGATTCCTCTTGCTATGGCTCCTGTTTTTGAACAG   1800
       S--E--K--P--F--D--M--K--S--I--P--L--A--M--A--P--V--F--E--Q--
1801   AAGTCAGAAATCACACTGGTGGCTACTAAGTCAGAGAAGTTGGCTCCTTCCAGGCAAGAC   1860
       K--S--E--I--T--L--V--A--T--K--S--E--K--L--A--P--S--R--Q--D--
1861   ATTTTCCAAGAACAACTAGCTGCCATTCCTGAGTTTATGAATCTAGGACCCTTGTTCAAG   1920
       I--F--Q--E--Q--L--A--A--I--P--E--F--M--N--L--G--P--L--F--K--
1921   TCTTCTGAGCCTGTTCAACTTACAGAAGCAGAGACAGAATATTTTGTTCGTTGTGTCAAG   1980
       S--S--E--P--V--Q--L--T--E--A--E--T--E--Y--F--V--R--C--V--K--
1981   CACATGTTTACCCATCATGTCGTGTTCCAGTTTGACTGTACCAATACTCTCAATGACCAG   2040
       H--M--F--T--H--H--V--V--F--Q--F--D--C--T--N--T--L--N--D--Q--
2041   CTACTGGAGAAAGTGACAGTGCAGGTGGAACCATCGGATTCCTATGAAGTGCTGTGTTGT   2100
       L--L--E--K--V--T--V--Q--V--E--P--S--D--S--Y--E--V--L--C--C--
2101   ATCCCAGCCGCCAGCCTACCTTACAATCAGCCGGGCATATGTTACACACTTGTTCGCTTG   2160
       I--P--A--A--S--L--P--Y--N--Q--P--G--I--C--Y--T--L--V--R--L--
2161   CCTGATGATGACTCCATAGCAGCCGCAGGCACCTTTAGCTGCACCATGAAGTTCACTGTC   2220
       P--D--D--D--S--I--A--A--A--G--T--F--S--C--T--M--K--F--T--V--
2221   CGGGACTGCGACCCTGACACAGGGGTGCCAGCTGAGGAGGGGTATGATGATGAGTACGTG   2280
       R--D--C--D--P--D--T--G--V--P--A--E--E--G--Y--D--D--E--Y--V--
2281   CTAGAAGATCTTGAAGTGACTGTGTCTGACCACATTCAGAAGGTCCTGAAGCCTAACTTT   2340
       L--E--D--L--E--V--T--V--S--D--H--I--Q--K--V--L--K--P--N--F--
2341   GCTGCTGCCTGGGAAGAGGTGGGAGACACCTTTGAGAAAGAGGAGACCTTTGCCCTCAGT   2400
       A--A--A--W--E--E--V--G--D--T--F--E--K--E--E--T--F--A--L--S--
2401   TCTACCAAAACTCTTGAAGAAGCTGTCAGCAACATCATCACATTTCTGGGCATGCAGCCA   2460
       S--T--K--T--L--E--E--A--V--S--N--I--I--T--F--L--G--M--Q--P--
2461   TGCGAGAGGTCAGACAAAGTACCTGAGAACAAGAATTCCCATGCCCTCTATTTGGCAGGT   2520
       C--E--R--S--D--K--V--P--E--N--K--N--S--H--A--L--Y--L--A--G--
2521   GTATACAGAGGTGGCTGTGATTTATTGGTGAGGTCCAGGCTGGCCTTAGCAGATGGGGTG   2580
       V--Y--R--G--G--C--D--L--L--V--R--S--R--L--A--L--A--D--G--V--
2581   ACCATGCAGGTGACTGTCAGAAGCAAAGAGGGAACACCTGTAGATGTTATCTTGGCTTCT   2640
       T--M--Q--V--T--V--R--S--K--E--G--T--P--V--D--V--I--L--A--S--
2641   GTCGGATAAggtctttactgggcgagatgaacttgatgcacccttcactgtcagggggct   2700
       V--G--***...................................................
2701   ttcgggctagcagcatgaatttcccagaatcataattttaaagattaatcactttggaaa   2760
       ............................................................
2761   agcaaattaaatatttggccctgagccagcagatcaagcatgaaaaaaaaaaaaa        2820
       .......................................................