Imprinted Gene Databases

Bos taurus: TSSC4

Tumor suppressing subtransferable candidate 4

Zaitoun & Khatib, J Anim Sci 86: 25-32, 2007

Species Gene Aliases Location Status Expressed Allele
Homo sapiens TSSC4   11p15.5  Not Imprinted Biallelic
Bos taurus TSSC4   29  Imprinted Maternal
Mus musculus Tssc4 AA241958, ESTM671070  7 69.3 cM  Imprinted Maternal
1      ctcaagatggaggcagccaggccgaagtgagccgtctgatggctggctgtccctccctgc     60
       ............................................................
61     ccttagccggtcaccgagccgctgagcagagccgtgcgcaggggcctttgccaccaagaa    120
       ............................................................
121    ccttcgtcagcattcaatccacctgccctccagcgtccagcaggcgcccatcagacgggg    180
       ............................................................
181    aggtgtggcgtgacctggtgacacATGGCAGAGGCAGGGCACAGCCAACACTTCCTTGAC    240
       ........................M--A--E--A--G--H--S--Q--H--F--L--D--
241    CCGGAGGTCGACGCCCTGCCTCCCGACACTGTCTCCCTCAGCGACTCGGACTCTGACCTC    300
       P--E--V--D--A--L--P--P--D--T--V--S--L--S--D--S--D--S--D--L--
301    AGTCTGCCCGATGGTGTTGGGGTGGACGCCCTGTCCCCGGGGGGGCTGCCTGGGGAGGCT    360
       S--L--P--D--G--V--G--V--D--A--L--S--P--G--G--L--P--G--E--A--
361    TCTGGGGATTCAGGCCCCGATGAGCCCCCCTCGCCCCCCAGGGGCCTCCCCACAGAGGCG    420
       S--G--D--S--G--P--D--E--P--P--S--P--P--R--G--L--P--T--E--A--
421    GTGCAACCCTTCCACCTGAGAGGCACGAGCTCCACCTTCTCTCAGCGCAGCCACAGCATC    480
       V--Q--P--F--H--L--R--G--T--S--S--T--F--S--Q--R--S--H--S--I--
481    TTCGATGGGCTGGAGGGGGCCGCCAGGCGGGCTGTGCCTGCTGTGACTCCAGCCAGCCCG    540
       F--D--G--L--E--G--A--A--R--R--A--V--P--A--V--T--P--A--S--P--
541    GGTGATGGGGGGGGCTTCCAGCAGCTGCTGACACCCTCCAGCCAGCCTGCAGCGGGGGTC    600
       G--D--G--G--G--F--Q--Q--L--L--T--P--S--S--Q--P--A--A--G--V--
601    CCAGGTAGGGCTGCTGGGAGCCCTGCTGCCCAAAGGGCGCCCCCTGTCCCTGACTACGTG    660
       P--G--R--A--A--G--S--P--A--A--Q--R--A--P--P--V--P--D--Y--V--
661    ACCCACCCTGAGCGCTGGACCAGGTACAGCCTGGACGATGTGGCCGAGGCCAGCGAGCAG    720
       T--H--P--E--R--W--T--R--Y--S--L--D--D--V--A--E--A--S--E--Q--
721    AGCAACCGGGCTGCCGCCCTGGCCTTCCTGGGGCCGCAGAACCTGGCTGCCCCCGGCAAC    780
       S--N--R--A--A--A--L--A--F--L--G--P--Q--N--L--A--A--P--G--N--
781    TACATGCCTTCCTTCAACCAGGACCCCTCCAGCTGCGGGGAGGGCCGGCTTGTCTTCACC    840
       Y--M--P--S--F--N--Q--D--P--S--S--C--G--E--G--R--L--V--F--T--
841    AAACCCACCCGAGCCAGCGAGGCTCGGCCCGACAGGAAGAGGGTATCCAGGAAGGTGGGG    900
       K--P--T--R--A--S--E--A--R--P--D--R--K--R--V--S--R--K--V--G--
901    GAACCGGGCAGGGGCGACCCTGGGGTTCCAGGAGCGGCAGGGGGCGAGGGCCCCGTGGAG    960
       E--P--G--R--G--D--P--G--V--P--G--A--A--G--G--E--G--P--V--E--
961    CTTGCCCACCTGGCCAGGCCCGGGAGCCCCGAAGCCGAGGAGTGGAGTGGACCCCGAGGG   1020
       L--A--H--L--A--R--P--G--S--P--E--A--E--E--W--S--G--P--R--G--
1021   GGCCTGCAGGAGGTGGGTGCCTCTGCAGGCGTGGCCCACGCCAGGCCTGGGTCCAGCCCC   1080
       G--L--Q--E--V--G--A--S--A--G--V--A--H--A--R--P--G--S--S--P--
1081   CCGCTGGTGGAGACAGTGGGTTTCCATGGCAGCAAGAAGCGGAGCAGGGACCACTTCCGG   1140
       P--L--V--E--T--V--G--F--H--G--S--K--K--R--S--R--D--H--F--R--
1141   AGCAGGGGTGGCAGCCCCGAGGCCCCAGGTGCAGAGCTGTGAgctgggagactgcctggc   1200
       S--R--G--G--S--P--E--A--P--G--A--E--L--***..................
1201   cgcctccctgacctggctgtgctagaaggctggccaccgctgcccccagggcggcttcag   1260
       ............................................................
1261   ggctggagcgggctcagggctccagggcagcgagctggcccgccggctgcctgtaggtgc   1320
       ............................................................
1321   caccagggaaccgagacctcgccagggtgtgggccaggggtgatggaggcccaacccgtt   1380
       ............................................................
1381   tctgcccgggagacagtaaaggctctacacgttcctctgaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaa   1440
       ............................................................
1441   aaaa                                                           1500
       ....