Imprinted Gene Databases

Bos taurus: SFMBT2

Scm-like with four mbt domains 2

Wang et al., BMC Genomics 12: 204, 2011

Species Gene Aliases Location Status Expressed Allele
Homo sapiens SFMBT2   10p14  Not Imprinted Biallelic
Mus musculus Sfmbt2 D2Wsu23e, D330030P06Rik  2 6.0 cM  Imprinted Paternal
Bos taurus SFMBT2   13  Not Imprinted Biallelic
Rattus norvegicus Sfmbt2   17q12.3  Imprinted Maternal
1      gtaactcttcctacaggatgaattaagagaagaccttgatctcagccgttaagaATGGAG     60
       ......................................................M--E--
61     GGCAGTGTGTCAATTTCCAGTATGCAGGACCCTTCATCCTCACCCTTGGAAAAACATCAG    120
       G--S--V--S--I--S--S--M--Q--D--P--S--S--S--P--L--E--K--H--Q--
121    AGCTCCGCAGATCGTAATGGAGATCTTGATTCAGAAGAAGGCTCCAGTTTGGAGGAGACC    180
       S--S--A--D--R--N--G--D--L--D--S--E--E--G--S--S--L--E--E--T--
181    GGCTTTAACTGGGGGGAGTACTTGGAAGAGACGGGAGCCAGTGCAGCCCCACATACATCC    240
       G--F--N--W--G--E--Y--L--E--E--T--G--A--S--A--A--P--H--T--S--
241    TTCAAACATGTTGAGATCAGCATTCAGAGCAACTTCCAGCCGGGGATGAAGCTGGAGGTG    300
       F--K--H--V--E--I--S--I--Q--S--N--F--Q--P--G--M--K--L--E--V--
301    GCCAACAAGAAGAACCCGGACACGTACTGGGTGGCCACGGTTATCACCACCTGCGGGCAG    360
       A--N--K--K--N--P--D--T--Y--W--V--A--T--V--I--T--T--C--G--Q--
361    CTGCTGCTGCTGCGTTACTGTGGTTACGGGGAGGACCGCCGGGCTGACTTCTGGTGTGAT    420
       L--L--L--L--R--Y--C--G--Y--G--E--D--R--R--A--D--F--W--C--D--
421    GTGGTGATTGCAGACCTGCACCCCGTGGGGTGGTGCACGCAGAACAACAAGACCCTCATG    480
       V--V--I--A--D--L--H--P--V--G--W--C--T--Q--N--N--K--T--L--M--
481    CCCCCGGACGCTATCAAAGAGAAGTATACAGACTGGACAGAATTTCTCATTCGGGATTTG    540
       P--P--D--A--I--K--E--K--Y--T--D--W--T--E--F--L--I--R--D--L--
541    ACTGGTTCCCGGACGGCCCCTGCCAGCCTTCTAGAAGGTCCTCTGCGAGGGAAAGGCCCT    600
       T--G--S--R--T--A--P--A--S--L--L--E--G--P--L--R--G--K--G--P--
601    ATAGACCTCATTACAGTTGATTCCTTAATAGAGCTGCAGGACTCTCAGAACCCTTTTCAG    660
       I--D--L--I--T--V--D--S--L--I--E--L--Q--D--S--Q--N--P--F--Q--
661    TACTGGATAGTTAGTGTGCTTGAGAATGCTGGAGGAAGATTACGCCTTCGCTATGTGGGA    720
       Y--W--I--V--S--V--L--E--N--A--G--G--R--L--R--L--R--Y--V--G--
721    TTGGAGGACACTGAATCCTATGACCAGTGGTTGTTTTACTTGGATTACAGACTTCGACCA    780
       L--E--D--T--E--S--Y--D--Q--W--L--F--Y--L--D--Y--R--L--R--P--
781    GTTGGTTGGTGTCAAGAGAATAAATACAGAATGGACCCACCTTCAGAAATCTATCCTTTG    840
       V--G--W--C--Q--E--N--K--Y--R--M--D--P--P--S--E--I--Y--P--L--
841    AAGACGGACTCAGAGTGGAAACGTGCTCTGGAGAAATCTCTTATTGATGCTGCTAAGTTT    900
       K--T--D--S--E--W--K--R--A--L--E--K--S--L--I--D--A--A--K--F--
901    CCTCTTCCAATGGAAGTGTTTAAGGACCATGCAGATTTGAGAAGCCATTTCTTCACAGTT    960
       P--L--P--M--E--V--F--K--D--H--A--D--L--R--S--H--F--F--T--V--
961    GGGATGAAGCTAGAGACCGTAAACATGAGTCACATTTGCCCTGCATCCGTGACCAAGGTT   1020
       G--M--K--L--E--T--V--N--M--S--H--I--C--P--A--S--V--T--K--V--
1021   TTTAACAATCATTTTTTTCAAGTGACTATTGATGACCTCAGACCAGAGCCTAGTAAACTC   1080
       F--N--N--H--F--F--Q--V--T--I--D--D--L--R--P--E--P--S--K--L--
1081   TCGATGTTGTGCCATGCGGACTCTTTGGGGATTTTACCAGTACAGTGGTGCCTTAAAAAC   1140
       S--M--L--C--H--A--D--S--L--G--I--L--P--V--Q--W--C--L--K--N--
1141   GGAGTCAATCTCACCCCTCCCAAAGGTTACTCCGGCCAGGACTTCGACTGGGCAGACTAT   1200
       G--V--N--L--T--P--P--K--G--Y--S--G--Q--D--F--D--W--A--D--Y--
1201   CACAAACAGCACGGGACCGAGGAGGCACCTCCCTTCTGCTTCAGAAACACATCGTTCAGT   1260
       H--K--Q--H--G--T--E--E--A--P--P--F--C--F--R--N--T--S--F--S--
1261   CGGGGATTCACGAAGAACATGAAGCTTGAAGCCGTGAACCCCAGGAACCCGGGCGAGCTC   1320
       R--G--F--T--K--N--M--K--L--E--A--V--N--P--R--N--P--G--E--L--
1321   TGTGTGGCCTCCGTCATAGCTGTGAAGGGGAGGCTGATGTGGCTCCGCCTAGAAGGCCTG   1380
       C--V--A--S--V--I--A--V--K--G--R--L--M--W--L--R--L--E--G--L--
1381   CAGAGCCCGGCTCCAGAGTTCATCGTGGACGTTGAATCTATGGACATCTTCCCTGTGGGT   1440
       Q--S--P--A--P--E--F--I--V--D--V--E--S--M--D--I--F--P--V--G--
1441   TGGTGTGAGGCCAACTCCTACCCTCTGACTACACCACACAAGACAGCCTCACAAAAGAAG   1500
       W--C--E--A--N--S--Y--P--L--T--T--P--H--K--T--A--S--Q--K--K--
1501   AGAAAGATCGCAGTTGTGCAGCCAGAAAAACAATCACCATCCACAGTGCCTGTTGAGAAA   1560
       R--K--I--A--V--V--Q--P--E--K--Q--S--P--S--T--V--P--V--E--K--
1561   ATACCTCATGACCTTTGTCTGTTCCCTCACCTGGACGCCACAGGAACGGTGAACGGGAAG   1620
       I--P--H--D--L--C--L--F--P--H--L--D--A--T--G--T--V--N--G--K--
1621   TACTGCTGTCCTCAGCTTTTCATCAACCACCGGTGTTTCTCGGGCCCCTACCTCAACAAG   1680
       Y--C--C--P--Q--L--F--I--N--H--R--C--F--S--G--P--Y--L--N--K--
1681   GGCAGGATCGCCGAGCTGCCGCAGTCGGTGGGGCCAGGCAAATGTGTGCTGGTCCTTAAG   1740
       G--R--I--A--E--L--P--Q--S--V--G--P--G--K--C--V--L--V--L--K--
1741   GAGGTTCTTAGCATGCTCATCAACGCAGCTTACAAGCCTGGGAGGGTGTTACGGGAATTA   1800
       E--V--L--S--M--L--I--N--A--A--Y--K--P--G--R--V--L--R--E--L--
1801   CAGCTGGTGGAAGACCCACACTGGAACTTTCAGGAGGAGACGCTGAAGGCCAAGTACAGA   1860
       Q--L--V--E--D--P--H--W--N--F--Q--E--E--T--L--K--A--K--Y--R--
1861   GGCAAAACGTACCGGGCTGTGGCCAAGATTGTCCGCACCTCCGACCAAGTAGCGGACTTC   1920
       G--K--T--Y--R--A--V--A--K--I--V--R--T--S--D--Q--V--A--D--F--
1921   TGCCGCCGGGTGTGTGCCAAGCTCGAGTGCTGTCCAAATTTGTTCAGTCCTGTGCTGGTT   1980
       C--R--R--V--C--A--K--L--E--C--C--P--N--L--F--S--P--V--L--V--
1981   TCTGAAAACTGCCCGGAGAACTGCTCTATTCACACCAAAACCAAATACACTTATTACTAC   2040
       S--E--N--C--P--E--N--C--S--I--H--T--K--T--K--Y--T--Y--Y--Y--
2041   GGGAAGAGAAGGAAGATCAGCAAGCCCCCAATTGGGGAAAGCCGCGTTGAGAGCGGACAC   2100
       G--K--R--R--K--I--S--K--P--P--I--G--E--S--R--V--E--S--G--H--
2101   CCTAAACCGGCCAGACGCAGGAAGCGACGAAAATCCATGTTTGTTCAGAAGAAGCGGAGG   2160
       P--K--P--A--R--R--R--K--R--R--K--S--M--F--V--Q--K--K--R--R--
2161   TCGTCCGCCGTGGACTTGGCCGCAGGCTCTGGAGAGGAGAGTGAAGAGGAGGATGCAGAC   2220
       S--S--A--V--D--L--A--A--G--S--G--E--E--S--E--E--E--D--A--D--
2221   GCCATGGACGATGACTCTGGGAGTGAGGAGACCGGCTCTGAGATCCGTGATGACCAGACA   2280
       A--M--D--D--D--S--G--S--E--E--T--G--S--E--I--R--D--D--Q--T--
2281   GACACGTCCTCGGCCGAGGTGCCCTCCACTCGGCCCCGGAGGGCCGTGACCCTGCGGAGC   2340
       D--T--S--S--A--E--V--P--S--T--R--P--R--R--A--V--T--L--R--S--
2341   AGCGTGGAGGCCGAGCGCCGGGCCCCTGTGGAGAGGACACGCAGGGCCCGGAGGGCGCCG   2400
       S--V--E--A--E--R--R--A--P--V--E--R--T--R--R--A--R--R--A--P--
2401   GCCACCCCCCAGGCCGAAGGAGCCCCCCAGAGCCCGGCTGCCAGCCAGGAGGCAGCAGAG   2460
       A--T--P--Q--A--E--G--A--P--Q--S--P--A--A--S--Q--E--A--A--E--
2461   GATGTGAAGCAGGAGGAGGAGGAAAGGTTGGTTTTGGAGAGCAACCCGCTGGAGTGGTCG   2520
       D--V--K--Q--E--E--E--E--R--L--V--L--E--S--N--P--L--E--W--S--
2521   GTGACGGATGTGGTGAGGTTCATCAAGCTGACGGACTGCGCGCCTCTGGCCAAAATATTT   2580
       V--T--D--V--V--R--F--I--K--L--T--D--C--A--P--L--A--K--I--F--
2581   CAGGAGCAGGACATCGATGGGCAGGCGCTGCTGTTGCTGACACTCCCCACGGTGCAGGAG   2640
       Q--E--Q--D--I--D--G--Q--A--L--L--L--L--T--L--P--T--V--Q--E--
2641   TGCATGGAGCTGAAGCTGGGTCCCGCCATCAAGCTCTGCCACCAGATTGAGCGGGTCAAG   2700
       C--M--E--L--K--L--G--P--A--I--K--L--C--H--Q--I--E--R--V--K--
2701   GTGGCCTTCTACGCCCAGTACGCCAACTGA                                 2760
       V--A--F--Y--A--Q--Y--A--N--***