Imprinted Gene Databases

Mus musculus: Tnfrsf22

Tumor necrosis factor receptor superfamily, member 22

Esperón Ede L et al, Epigenetics 7: 626-634, 2012

Species Gene Aliases Location Status Expressed Allele
Mus musculus Tnfrsf22 SOBa, Tnfrh2, Tnfrsf1al2, mDcTrailr2, 2810028K06Rik, C130035G06Rik  7 69.57 cM  Imprinted Maternal
1      ctcggccATGTTTGGCTTCTTCTGCAGCTTGGTGTCCAGTCTGAGTCGCTGGTTCCTTTG     60
       .......M--F--G--F--F--C--S--L--V--S--S--L--S--R--W--F--L--W-
61     GCGGCGGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGAATCTGCCCTTGCAGGTAAAATT    120
       -R--R--L--L--L--L--L--L--L--L--L--L--N--L--P--L--Q--V--K--F-
121    TGCTATGCTAGAATTACACTCCTTCAAATGTCCCGCTGGTGAATACTGGTCTAAAGACGT    180
       -A--M--L--E--L--H--S--F--K--C--P--A--G--E--Y--W--S--K--D--V-
181    CTGTTGCAAGAACTGTTCTGCAGGTACATTTGTCAAGGCGCCCTGCGAAATCCCCCATAC    240
       -C--C--K--N--C--S--A--G--T--F--V--K--A--P--C--E--I--P--H--T-
241    TCAAGGACAATGTGAGAAGTGTCACCCAGGAACATTCACAGAGAAAGATAATTACCTGGA    300
       -Q--G--Q--C--E--K--C--H--P--G--T--F--T--E--K--D--N--Y--L--D-
301    TGCTTGTATACTTTGCTCCACCTGTGATAAAGATCAGGAAATGGTGGCCGACTGCTCAGC    360
       -A--C--I--L--C--S--T--C--D--K--D--Q--E--M--V--A--D--C--S--A-
361    CACCAGTGACCGGAAATGCCAGTGCCGAACAGGTCTTTACTACTATGACCCAAAATTTCC    420
       -T--S--D--R--K--C--Q--C--R--T--G--L--Y--Y--Y--D--P--K--F--P-
421    AGAATCGTGCCGCCCATGTACCAAGTGTCCCCAAGGAATCCCTGTCCTCCAGGAATGCAA    480
       -E--S--C--R--P--C--T--K--C--P--Q--G--I--P--V--L--Q--E--C--N-
481    CTCCACAGCTAACACTGTGTGCAGTTCATCTGTTTCAAGAAGATCTGCCTCAGTGGCCTG    540
       -S--T--A--N--T--V--C--S--S--S--V--S--R--R--S--A--S--V--A--W-
541    GCCTATCTGAatggttcacagagatcccagaaaccggctgttcctactgttatcaccttt    600
       -P--I--***..................................................
601    gagtgtgctaattgtgtccgttgttgtcttccgtatcataagaagataaaggttctacag    660
       ............................................................
661    atgttttcttagcttccttttattgctatgaagtgatactatggaggcaactcttttatt    720
       ............................................................
721    ttatttattttattttattttttaatgtcttgaacttgatttgaagaccaggctggcctc    780
       ............................................................
781    aaaatcacagagatccagactaagacaactctaataagggaaacatttaattgggactgg    840
       ............................................................
841    cttacagtttcggacgttttgtccatgattatcatagtgggaagcatggcagcatctaag    900
       ............................................................
901    cagacatgatgttggagaaggagctgagatttctgcatcttgatctgcaagcaataaaag    960
       ............................................................
961    gagactgtgtgccacactatacacagcttgaacataggagacctcaaagcctgtccccac   1020
       ............................................................
1021   agtgacaaacttcctccaacaaggtcatacctcctaataataccatttcttatgaggcaa   1080
       ............................................................
1081   gcattcaaacacatgagtctatgagggccaaaccaattcaaaccaccacaggttaacaat   1140
       ............................................................
1141   tgccctctgcagctctctggtggaggccctccttgagagtaagtaacaatttagatgaag   1200
       ............................................................
1201   gcaagtcctggtatcaggtccaaaagaaactcaggatgaatggtccactgtggttcctat   1260
       ............................................................
1261   taacatactgaagaacatgacctcaccttacacgtctccacctcactgacttcccttccc   1320
       ............................................................
1321   ctagcttctcattcccaggtaaccctgccattttttggtaatgtgccttcttggttcttc   1380
       ............................................................
1381   ctctcctttccccctctcttctggtccttacttctcttcctctcccactctccaccagcc   1440
       ............................................................
1441   tcctcttaaggcctgaatcagtctgtaggtcatgtttaatctactactttctctctgctc   1500
       ............................................................
1501   tggactcatccagatgtctctggctgagctctccctcctatctacaataaaacccttccc   1560
       ............................................................
1561   cctaaccagaaatggaacagttttgtcctcactttgtacatctggtgcctgaaaccagag   1620
       ............................................................
1621   aggaatatgacccccatccaagagactcagcctctcctagccaaaccatgctgttggttt   1680
       ............................................................
1681   gacgacttcataaggtatgcatggatggatcacttgttcctgctggcttctgcaacctac   1740
       ............................................................
1741   catagtgaactccaaacctggaattcacctcttcagctgcttctcccctctacttgcgct   1800
       ............................................................
1801   aaccatttgcttctcctcagcacatcaggaaactcccccttgcctaggggtgtgatcagt   1860
       ............................................................
1861   gccttgctctcactgctcagtaaatttccacttgtctaggggtgtggtcagtgccttgct   1920
       ............................................................
1921   ctcactgctcagtaaactttcccttgcctaggggtgtgatcagtgccttgctctcactgc   1980
       ............................................................
1981   tcagtaaatttccacttacctaagggtgtggtcagtgccttgctctcactgctcagtaaa   2040
       ............................................................
2041   ttctccttgcctaggggtgtggtcagtgccttgctctcactgcttagtaaatttcccctt   2100
       ............................................................
2101   ggctaggggtgcggtcagtgctgtgccttgtgctcactactcagtaaatttccacttgcc   2160
       ............................................................
2161   tagggatgtggtcagtgccttgctctaactgctcagtaaatttctttttgcctaggggtg   2220
       ............................................................
2221   tgatcagtgccttgttctcaatgctcagtaaatttccccttggttaggggtgtgg        2280
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