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Mus musculus: Ccdc40

Coiled-coil domain containing 40
Species Gene Aliases Location Status Expressed Allele
Mus musculus Ccdc40 RP23-13O17.4, B930008I02Rik  11  Imprinted
1      tcagcccggaacgccaggcactaactccaacctcagggtcctgcgcatccgtcgacccct     60
       ............................................................
61     gctcggggctttctgctgactctgcaggatctcgccacgcgcctagtaccccggaccctg    120
       ............................................................
121    ccctggatgggagccctgtgccctcgatccgaaaggcagggcctccctgtacccatgtat    180
       ............................................................
181    gcgctcaccccttgcatttctatttctcaaacttagggttacgaaggaatgatgctcccc    240
       ............................................................
241    aaaaggtactggttcttgagtaacccaaagctggaagtggaagagccagagctaggcgcg    300
       ............................................................
301    tttcccggacccagcatccccaacctgcctgccactttctttgagtccctgaacatcatc    360
       ............................................................
361    agggtcactctacgggaactaagtccagccgggaaagtctgggacacatggcgacggaca    420
       ............................................................
421    ggcaaaacacatttgttctttaatgtgtttgcttagtgtttctgtgtgaatcgatggacg    480
       ............................................................
481    ctgccagaccccgcctcctgcggtcttggagcacgcggtccagacttcgccggatgttga    540
       ............................................................
541    tggcgtagcctagcaacgagagatggcggagccggaggaccaggctgacgggtatcacca    600
       ............................................................
601    cagctggaagacaatggccaagaaattgatgagggcagagaccccaccagaagtcctgaa    660
       ............................................................
661    gaggacattacaactgaaggcgggggcggatctgaaggggaaATGATGGATGCTGAGAAA    720
       ..........................................M--M--D--A--E--K--
721    GTCAGCACGGATGGGGAAGCCATCTCTGAAGGAGAAGTGGGGTCCAATGGAGAGACTCCC    780
       V--S--T--D--G--E--A--I--S--E--G--E--V--G--S--N--G--E--T--P--
781    CCAGAAACAGAAGTGGAATTCATTGGAGAGACCGCTCCAGACACAGATGTGGAATTCATT    840
       P--E--T--E--V--E--F--I--G--E--T--A--P--D--T--D--V--E--F--I--
841    GGAGAGACCTCCCCAGGAACAGACGTGGAACCCACTGGAGAGAGCATACAGGAAACAGAA    900
       G--E--T--S--P--G--T--D--V--E--P--T--G--E--S--I--Q--E--T--E--
901    GTTGAATCCATCGGAGAGGCTACCCCAGGAATGGACGTGGAACCCATTAAAAAGACCATG    960
       V--E--S--I--G--E--A--T--P--G--M--D--V--E--P--I--K--K--T--M--
961    ACAGAACTCAACGTTGAATCCATCGGAGAAGAAACCTCAGAAACAGACGTGGACTCCATT   1020
       T--E--L--N--V--E--S--I--G--E--E--T--S--E--T--D--V--D--S--I--
1021   AGGAAGGCCCTCCGAGGAATAGACTTGGAATCTATCACAGTTGCCTATCCGCCAAAAAAG   1080
       R--K--A--L--R--G--I--D--L--E--S--I--T--V--A--Y--P--P--K--K--
1081   GCTAAACACAGAAAGGTCAGACCCCAAGCGGAAGTTGAATCCACTGGAAGAGCTGCCCCA   1140
       A--K--H--R--K--V--R--P--Q--A--E--V--E--S--T--G--R--A--A--P--
1141   GAAGGAGAATTAGAAGTTTCTGACCACGAGAAAGTAGAAGCCCTTCTCGATGAGTTGGAT   1200
       E--G--E--L--E--V--S--D--H--E--K--V--E--A--L--L--D--E--L--D--
1201   GAGCTCTCTGAGATAGTCAGCTCTCCCGAGGTCTCCTACTCTGACATCAGTCCCTTGGAG   1260
       E--L--S--E--I--V--S--S--P--E--V--S--Y--S--D--I--S--P--L--E--
1261   ATGGGTGAAGATGACACAAACGTCTCAGCCACATCAACCGACACATTCCAGCAAGGCATA   1320
       M--G--E--D--D--T--N--V--S--A--T--S--T--D--T--F--Q--Q--G--I--
1321   TATGAGCCCATAGAACCCATAGAGCCCACAGAGCCCCCAGAGCCTGCAGAGCCCCCAAAG   1380
       Y--E--P--I--E--P--I--E--P--T--E--P--P--E--P--A--E--P--P--K--
1381   CCTGCAGAGACCCCAGAGGACAGCACGGTGAGAGCCCCAGCGCATCCCTATCAAAGAGAC   1440
       P--A--E--T--P--E--D--S--T--V--R--A--P--A--H--P--Y--Q--R--D--
1441   TTCCCAATGGGGGCACGACACCGATTCAGACTGAGCATCATGGGAAGTCTGACTCCCTCG   1500
       F--P--M--G--A--R--H--R--F--R--L--S--I--M--G--S--L--T--P--S--
1501   GACACGGACGATCTTCCCCTGGAAACGGACGAGCCGCCTCAGCAAGAGTCAGTGCAGTCA   1560
       D--T--D--D--L--P--L--E--T--D--E--P--P--Q--Q--E--S--V--Q--S--
1561   ACTCCCAGAGCCCTTGAAGAAACCCGGATACAGTTCCTAGACCAGGTCCAGAGCCTCAGC   1620
       T--P--R--A--L--E--E--T--R--I--Q--F--L--D--Q--V--Q--S--L--S--
1621   CCGGAGGCCCTGCTCGATAGAGCAACTGAAGGGAGTGATGAAGCAGAGGAGGAAGGCTCC   1680
       P--E--A--L--L--D--R--A--T--E--G--S--D--E--A--E--E--E--G--S--
1681   CAGCTGATCGTGCTGGACCCAGACCATCCTCTGATGATCAGATTCCAGGAGGCTCTGAAG   1740
       Q--L--I--V--L--D--P--D--H--P--L--M--I--R--F--Q--E--A--L--K--
1741   GGCTACCTCAACCGGCAGATGGACAAACTGAAGCTGGACGTCCAAGAGCTGGATGTGGCC   1800
       G--Y--L--N--R--Q--M--D--K--L--K--L--D--V--Q--E--L--D--V--A--
1801   ACCAAGCAAACCCGAAGCCAGAGGCAGGAGCTGGGCGTGAACCTCTACGGGGTCCAGCAG   1860
       T--K--Q--T--R--S--Q--R--Q--E--L--G--V--N--L--Y--G--V--Q--Q--
1861   CACCTGGCCCGCCTGCAGATGCAGCTGGAGAAGAGCCATGACCGGCACTCTCTGGTGGCC   1920
       H--L--A--R--L--Q--M--Q--L--E--K--S--H--D--R--H--S--L--V--A--
1921   TGTGAGCGGAGAAGGAAGGAGGAGGAGCTGCAATGCGCACGCTCCGTCTACAACAAGACC   1980
       C--E--R--R--R--K--E--E--E--L--Q--C--A--R--S--V--Y--N--K--T--
1981   TGCCAGACCGCCAATGAGGAACGAAAGAAGTTGGCCGCCCTGCAGACAGAGGTGGAGAGC   2040
       C--Q--T--A--N--E--E--R--K--K--L--A--A--L--Q--T--E--V--E--S--
2041   CTGGCCCTGCACCTCTTCTACATGCAGAACATAGAGCAGGACGTGCGCGATGACATCCAA   2100
       L--A--L--H--L--F--Y--M--Q--N--I--E--Q--D--V--R--D--D--I--Q--
2101   GTCATGAAGCAGGTGGTGAGGAAGACCGAGACGGAGAAGATGCACGCCGAGGTGGAGAAG   2160
       V--M--K--Q--V--V--R--K--T--E--T--E--K--M--H--A--E--V--E--K--
2161   AAAAAGCAGGACCTGTTTGTGGACCAGCTCACCGAAAGGTCACACCAGCTAGAAGAAAAC   2220
       K--K--Q--D--L--F--V--D--Q--L--T--E--R--S--H--Q--L--E--E--N--
2221   ATCGCCCTGTTTGAGGCTCAATACTTGTCCCAGGCTGAGGACACCCGGGTCCTCAAGAAA   2280
       I--A--L--F--E--A--Q--Y--L--S--Q--A--E--D--T--R--V--L--K--K--
2281   GCAGTGACTGAGGCCATCACAGAGATTGACACCATTGCCGTGGAGAAGAAGCGAATCCTA   2340
       A--V--T--E--A--I--T--E--I--D--T--I--A--V--E--K--K--R--I--L--
2341   CAGCAGTGGACCACCAGCCTAGTGGGCATGAAGCACCGTAACGAGGCATACAAGACAGTG   2400
       Q--Q--W--T--T--S--L--V--G--M--K--H--R--N--E--A--Y--K--T--V--
2401   ATGGATGCGCTCAGGGAGTGTCAGCATCAGGTGAAGTCCACCGACAGTGAGATCGAAGTC   2460
       M--D--A--L--R--E--C--Q--H--Q--V--K--S--T--D--S--E--I--E--V--
2461   TGCAAGAAGTCCATCATGCAGGAGGAAGAGAAGAATGAGAAGCTGGCCCGTCTCCTGAAC   2520
       C--K--K--S--I--M--Q--E--E--E--K--N--E--K--L--A--R--L--L--N--
2521   CGCGCAGAGACAGAAGCCACACTGGTGCAGAAAATGACCGCCCAGTGCTTAAGCAAGCAA   2580
       R--A--E--T--E--A--T--L--V--Q--K--M--T--A--Q--C--L--S--K--Q--
2581   GAGGCTCTGCAGACGGAGTTTAACACGTACCAGCTCGCCCTGCAGGACACGGAGGAGATG   2640
       E--A--L--Q--T--E--F--N--T--Y--Q--L--A--L--Q--D--T--E--E--M--
2641   CTGAACAAGGGCTATGTGGAACACTCGGCAGTCTTGAGCGAGCTCCAGGCCACACGCCAG   2700
       L--N--K--G--Y--V--E--H--S--A--V--L--S--E--L--Q--A--T--R--Q--
2701   GCTTTCCACCAGGAACAGGAGCTACGGCAAAAGATGGACATGTCCATGGTGGACAAGCTG   2760
       A--F--H--Q--E--Q--E--L--R--Q--K--M--D--M--S--M--V--D--K--L--
2761   CAGGAACAGGGGACCTCCAGCAAGATGACCAAGTACTTTCATCAGCTCCTTCGGAAGCTG   2820
       Q--E--Q--G--T--S--S--K--M--T--K--Y--F--H--Q--L--L--R--K--L--
2821   CAAAAGGAAAACACCAACCTGGTGACACATCTTTCAAAAATTGACGGCGATATCGCCCAG   2880
       Q--K--E--N--T--N--L--V--T--H--L--S--K--I--D--G--D--I--A--Q--
2881   GCCACCCTGGACATCACCAACACCAACTGCAAAATAGACATGCATAAGAAGACGCTGGCA   2940
       A--T--L--D--I--T--N--T--N--C--K--I--D--M--H--K--K--T--L--A--
2941   GAGATGGACAAGGAGGTAAAGAGGTTCAACGATCTCATCACCAACAGCGAGAGCGAGATC   3000
       E--M--D--K--E--V--K--R--F--N--D--L--I--T--N--S--E--S--E--I--
3001   GCCCGGCGCACCATCCTCATTGAGAGGAAGCAGAGCCTCATCAACTTCTTCAACAAGCAG   3060
       A--R--R--T--I--L--I--E--R--K--Q--S--L--I--N--F--F--N--K--Q--
3061   CTGGAACAGATGGTGTCGGAGCTGGGGGGGGAAGAAGCTGGACCCCTGGAACTGGAGATC   3120
       L--E--Q--M--V--S--E--L--G--G--E--E--A--G--P--L--E--L--E--I--
3121   AAAAGGCTGTCGAAGCTGACAGAAGAGTACAACACGGGAGTGGCTGAGGCGCAGATGACC   3180
       K--R--L--S--K--L--T--E--E--Y--N--T--G--V--A--E--A--Q--M--T--
3181   TGGTTGCGCCTGCAGCAGGAACTGGTCCAGGTCACGCATGAGCGCGAGGAGCAGCTGGTG   3240
       W--L--R--L--Q--Q--E--L--V--Q--V--T--H--E--R--E--E--Q--L--V--
3241   TCCGTGGACCAACTGAAGAAGGAGGTGCACATCATGGAACAAAAGAAGCTTCGCATAGAG   3300
       S--V--D--Q--L--K--K--E--V--H--I--M--E--Q--K--K--L--R--I--E--
3301   AGCAAGATTGCACATGAGAAGAAGGAACAAAAGATAGTGAGCCGCCACATGAGGGACCTG   3360
       S--K--I--A--H--E--K--K--E--Q--K--I--V--S--R--H--M--R--D--L--
3361   GACAACGACCTGAGCAAGCTCAACATGCTGTTGGACAAGAACCGATGCAGTTCGGAAGAG   3420
       D--N--D--L--S--K--L--N--M--L--L--D--K--N--R--C--S--S--E--E--
3421   CTGGAGCAGAACAATATAGCAACTGAGACGGAGTTTCTGCGCACGCTGAAGGACTCAGAA   3480
       L--E--Q--N--N--I--A--T--E--T--E--F--L--R--T--L--K--D--S--E--
3481   AGAGAGACCATTCAAATGCAGGAAAAGCTGATGGAACTCTCTGAGGAAAAGGCCACCCTC   3540
       R--E--T--I--Q--M--Q--E--K--L--M--E--L--S--E--E--K--A--T--L--
3541   CTCAACAGCTTCATGGAGGCAGAGCACCAAATCATGCTGTGGGAGAAGAAAATCCAACTG   3600
       L--N--S--F--M--E--A--E--H--Q--I--M--L--W--E--K--K--I--Q--L--
3601   GCCAAGGAGATGCGCAGCTCGGTGGATTCTGAGACCGGGCAGACAGAGATCCGTGCTATG   3660
       A--K--E--M--R--S--S--V--D--S--E--T--G--Q--T--E--I--R--A--M--
3661   AAGGCCGAGATCCACAGGATGAAGGTTAGGCACGGGCAGCTACTGAAGCAGCAGGAGAAG   3720
       K--A--E--I--H--R--M--K--V--R--H--G--Q--L--L--K--Q--Q--E--K--
3721   ATGATCCGTGACATGGAGTTGGCTGTGGCCCGCAGGGAGACCATCGTCGTCCAGGCTGAA   3780
       M--I--R--D--M--E--L--A--V--A--R--R--E--T--I--V--V--Q--A--E--
3781   GGGCAGAGCAAGATAGACAAGAAAGTAATCACCAAGACAGAGTTCCACTACCAGCAGCGC   3840
       G--Q--S--K--I--D--K--K--V--I--T--K--T--E--F--H--Y--Q--Q--R--
3841   GAGCTGCAGAAGAAAGTCAGGGAGATGCACAAGGCCACAGATGACTGCACCAACACCATC   3900
       E--L--Q--K--K--V--R--E--M--H--K--A--T--D--D--C--T--N--T--I--
3901   TCAGAACTGGAAGAAACTCAAAAGTTCCTAAGCAGCTCCCTCCAGGAGAAGCAGCAACTG   3960
       S--E--L--E--E--T--Q--K--F--L--S--S--S--L--Q--E--K--Q--Q--L--
3961   CTGTCAGAAATGCAGGCTACCACAGATGTTCTTGAAGAGGAGATCAACCAGCTAACAGCT   4020
       L--S--E--M--Q--A--T--T--D--V--L--E--E--E--I--N--Q--L--T--A--
4021   CTCAAACGGCAGAACCTTCTGGAGATCGTGACCCTGCAGACCCGTGGCAAGCACCTGCAG   4080
       L--K--R--Q--N--L--L--E--I--V--T--L--Q--T--R--G--K--H--L--Q--
4081   GCCGCCATTGAGGGGAAATATGTGTTCCTGCACCGCAACAGCAGGTCCCAGCTGATGGAG   4140
       A--A--I--E--G--K--Y--V--F--L--H--R--N--S--R--S--Q--L--M--E--
4141   CGTAAGCGCCTGAGCGTCCGGCTGTCCCAGCTCAACAAGGTCCTCTCCAGCGTGCAGGAA   4200
       R--K--R--L--S--V--R--L--S--Q--L--N--K--V--L--S--S--V--Q--E--
4201   GACTACCCCCAGTACCAGGAGGTGCTGCAGAGCATTCAACAGAAGATCGCCACCAAGCTG   4260
       D--Y--P--Q--Y--Q--E--V--L--Q--S--I--Q--Q--K--I--A--T--K--L--
4261   GAGACCCCAGAGCCCTCCTAGacagcaccgggcctgcacctttcagggctgacttgcggg   4320
       E--T--P--E--P--S--***.......................................
4321   cagacccagggagtcaccacatgttctgaaaaagccacgtgtctcctagagcgacaccca   4380
       ............................................................
4381   gtctaagaaacaccggcaggccagacacgtgattcaaagcctctctgctgttcacaccag   4440
       ............................................................
4441   gtgtaaagcagccaccggatccgacgctctgagcacgcccacattacctgggtgtgaaaa   4500
       ............................................................
4501   aaacccactctcctgttggacttaaaaccatcctgttggcagtcctacggtcacatcagt   4560
       ............................................................
4561   gcctctcactgtcctgggacagaccctcaattttgcggagcaagtaatgcagagaagaag   4620
       ............................................................
4621   ccaggagtaaggtggacttatttgagccctgggaatgcctgttccagccctctgaagccc   4680
       ............................................................
4681   agaagataccctcattctccactccacagaaagctcggccttctcctgcccccatttccc   4740
       ............................................................
4741   aggaagccttaaattagacagaaacccaaagaccgaagccgtgggacccagaagtccaag   4800
       ............................................................
4801   gatagcaaatgcctatggagcagaaactacttcagaaaagggacacctgtctctcatcca   4860
       ............................................................
4861   ccgacctctgacctctcttcttcacctctgcctcccctaccctggggtttctgggcacca   4920
       ............................................................
4921   gttacctttttccttgtgtagatgagaaacggattatttcagttttaaacttgaacagc    4980
       ...........................................................