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Homo sapiens: PRDM16

PR domain containing 16

Luedi et al. Genome Res. 17: , 2007 PDF; Luedi et al. Genome Res. 17: , 2007 Supplement

Species Gene Aliases Location Status Expressed Allele
Homo sapiens PRDM16 MEL1, PFM13, KIAA1675, MGC166915  1p36.23-p33  Predicted Paternal
1      gacaatgctggggagatgaagatagtgtgtggctgcttctggactcaaggaggaggagag     60
       ............................................................
61     agattccgcgagccgacaccATGCGATCCAAGGCGAGGGCGAGGAAGCTAGCCAAAAGTG    120
       ....................M--R--S--K--A--R--A--R--K--L--A--K--S--D
121    ACGGTGACGTTGTAAATAATATGTATGAGCCCAACCGGGACCTGCTGGCCAGCCACAGCG    180
       --G--D--V--V--N--N--M--Y--E--P--N--R--D--L--L--A--S--H--S--A
181    CGGAGGACGAGGCCGAGGACAGTGCCATGTCGCCCATCCCCGTGGGGCCACCGTCCCCCT    240
       --E--D--E--A--E--D--S--A--M--S--P--I--P--V--G--P--P--S--P--F
241    TCCCCACCAGCGAGGACTTCACCCCCAAGGAGGGCTCGCCGTACGAGGCCCCTGTCTACA    300
       --P--T--S--E--D--F--T--P--K--E--G--S--P--Y--E--A--P--V--Y--I
301    TTCCTGAAGACATTCCGATCCCAGCAGACTTCGAGCTCCGAGAGTCCTCCATCCCAGGGG    360
       --P--E--D--I--P--I--P--A--D--F--E--L--R--E--S--S--I--P--G--A
361    CTGGCCTGGGGGTCTGGGCCAAGAGGAAGATGGAAGCCGGGGAGAGGCTGGGCCCCTGCG    420
       --G--L--G--V--W--A--K--R--K--M--E--A--G--E--R--L--G--P--C--V
421    TGGTGGTGCCCCGGGCGGCGGCAAAGGAGACAGACTTCGGATGGGAGCAAATACTGACGG    480
       --V--V--P--R--A--A--A--K--E--T--D--F--G--W--E--Q--I--L--T--D
481    ACGTGGAAGTGTCGCCCCAGGAAGGCTGCATCACAAAGATCTCCGAAGACCTGGGCAGTG    540
       --V--E--V--S--P--Q--E--G--C--I--T--K--I--S--E--D--L--G--S--E
541    AGAAGTTCTGCGTGGATGCAAATCAGGCGGGGGCTGGCAGCTGGCTCAAGTACATCCGTG    600
       --K--F--C--V--D--A--N--Q--A--G--A--G--S--W--L--K--Y--I--R--V
601    TGGCGTGCTCCTGCGATGACCAGAACCTCACCATGTGTCAGATCAGTGAGCAGATTTACT    660
       --A--C--S--C--D--D--Q--N--L--T--M--C--Q--I--S--E--Q--I--Y--Y
661    ATAAAGTCATTAAGGACATTGAGCCAGGTGAGGAGCTGCTGGTGCACGTGAAGGAAGGCG    720
       --K--V--I--K--D--I--E--P--G--E--E--L--L--V--H--V--K--E--G--V
721    TCTACCCCCTGGGCACAGTGCCGCCCGGCCTGGACGAGGAGCCCACGTTCCGCTGTGACG    780
       --Y--P--L--G--T--V--P--P--G--L--D--E--E--P--T--F--R--C--D--E
781    AGTGTGACGAACTCTTCCAGTCCAAGCTGGACCTGCGGCGCCATAAGAAGTACACGTGTG    840
       --C--D--E--L--F--Q--S--K--L--D--L--R--R--H--K--K--Y--T--C--G
841    GCTCAGTGGGGGCTGCGCTCTACGAGGGCCTGGCTGAGGAGCTCAAGCCCGAGGGCCTTG    900
       --S--V--G--A--A--L--Y--E--G--L--A--E--E--L--K--P--E--G--L--G
901    GCGGTGGCAGCGGCCAAGCCCACGAGTGCAAGGACTGCGAGCGGATGTTCCCCAACAAGT    960
       --G--G--S--G--Q--A--H--E--C--K--D--C--E--R--M--F--P--N--K--Y
961    ACAGCCTGGAGCAGCACATGGTCATCCACACGGAGGAGCGCGAGTACAAATGCGACCAGT   1020
       --S--L--E--Q--H--M--V--I--H--T--E--E--R--E--Y--K--C--D--Q--C
1021   GTCCCAAGGCCTTCAACTGGAAGTCCAACCTCATCCGCCACCAGATGTCCCACGACAGCG   1080
       --P--K--A--F--N--W--K--S--N--L--I--R--H--Q--M--S--H--D--S--G
1081   GCAAACGCTTCGAATGTGAAAACTGCGTGAAGGTGTTCACGGACCCCAGCAACCTTCAGC   1140
       --K--R--F--E--C--E--N--C--V--K--V--F--T--D--P--S--N--L--Q--R
1141   GGCACATCCGCTCGCAGCACGTGGGCGCTCGGGCCCACGCCTGCCCCGACTGCGGGAAGA   1200
       --H--I--R--S--Q--H--V--G--A--R--A--H--A--C--P--D--C--G--K--T
1201   CCTTCGCCACGTCCTCCGGCCTCAAGCAGCACAAGCATATCCACAGCACGGTGAAGCCTT   1260
       --F--A--T--S--S--G--L--K--Q--H--K--H--I--H--S--T--V--K--P--F
1261   TCATATGTGAGGTCTGCCACAAGTCCTACACGCAGTTCTCCAACCTGTGCCGGCACAAGC   1320
       --I--C--E--V--C--H--K--S--Y--T--Q--F--S--N--L--C--R--H--K--R
1321   GGATGCACGCCGACTGCCGCACGCAGATCAAGTGCAAGGACTGTGGCCAGATGTTCAGCA   1380
       --M--H--A--D--C--R--T--Q--I--K--C--K--D--C--G--Q--M--F--S--T
1381   CTACCTCCTCCCTCAACAAGCACCGGCGCTTCTGCGAGGGCAAGAACCATTACACGCCGG   1440
       --T--S--S--L--N--K--H--R--R--F--C--E--G--K--N--H--Y--T--P--G
1441   GCGGCATCTTTGCCCCGGGCCTGCCCTTGACCCCCAGCCCCATGATGGACAAGGCAAAAC   1500
       --G--I--F--A--P--G--L--P--L--T--P--S--P--M--M--D--K--A--K--P
1501   CCTCCCCCAGCCTCAATCACGCCAGCCTGGGCTTCAACGAGTACTTTCCCTCCAGGCCGC   1560
       --S--P--S--L--N--H--A--S--L--G--F--N--E--Y--F--P--S--R--P--H
1561   ACCCGGGGAGCCTGCCCTTCTCCACGGCGCCTCCCACGTTCCCCGCACTCACCCCCGGCT   1620
       --P--G--S--L--P--F--S--T--A--P--P--T--F--P--A--L--T--P--G--F
1621   TCCCGGGCATCTTCCCTCCATCCTTGTACCCCCGGCCGCCTCTGCTACCTCCCACATCGC   1680
       --P--G--I--F--P--P--S--L--Y--P--R--P--P--L--L--P--P--T--S--L
1681   TGCTCAAGAGCCCCCTGAACCACACCCAGGACGCCAAGCTCCCCAGTCCCCTGGGGAACC   1740
       --L--K--S--P--L--N--H--T--Q--D--A--K--L--P--S--P--L--G--N--P
1741   CAGCCCTGCCCCTGGTCTCCGCCGTCAGCAACAGCAGCCAGGGCACGACGGCAGCTGCGG   1800
       --A--L--P--L--V--S--A--V--S--N--S--S--Q--G--T--T--A--A--A--G
1801   GGCCCGAGGAGAAGTTCGAGAGCCGCCTGGAGGACTCCTGTGTGGAGAAGCTGAAGACCA   1860
       --P--E--E--K--F--E--S--R--L--E--D--S--C--V--E--K--L--K--T--R
1861   GGAGCAGCGACATGTCGGACGGCAGTGACTTTGAGGACGTCAACACCACCACGGGGACCG   1920
       --S--S--D--M--S--D--G--S--D--F--E--D--V--N--T--T--T--G--T--D
1921   ACCTGGACACGACCACGGGGACGGGCTCGGACCTGGACAGCGACGTGGACAGCGACCCTG   1980
       --L--D--T--T--T--G--T--G--S--D--L--D--S--D--V--D--S--D--P--D
1981   ACAAGGACAAGGGCAAGGGCAAGTCCGCCGAGGGCCAGCCCAAGTTTGGGGGCGGCTTGG   2040
       --K--D--K--G--K--G--K--S--A--E--G--Q--P--K--F--G--G--G--L--A
2041   CGCCCCCGGGGGCCCCGAACAGCGTGGCCGAGGTGCCTGTCTTCTATTCCCAGCACTCAT   2100
       --P--P--G--A--P--N--S--V--A--E--V--P--V--F--Y--S--Q--H--S--F
2101   TCTTCCCGCCACCCGACGAGCAGCTGCTGACTGCAACGGGCGCCGCCGGGGACTCCATCA   2160
       --F--P--P--P--D--E--Q--L--L--T--A--T--G--A--A--G--D--S--I--K
2161   AGGCCATCGCATCCATTGCCGAGAAGTACTTTGGCCCCGGCTTCATGGGGATGCAGGAGA   2220
       --A--I--A--S--I--A--E--K--Y--F--G--P--G--F--M--G--M--Q--E--K
2221   AGAAGCTGGGCTCGCTCCCCTACCACTCGGCGTTCCCCTTCCAGTTCCTGCCCAACTTCC   2280
       --K--L--G--S--L--P--Y--H--S--A--F--P--F--Q--F--L--P--N--F--P
2281   CCCACTCCCTTTACCCCTTCACGGACCGAGCCCTCGCCCACAACTTGCTGGTCAAGGCCG   2340
       --H--S--L--Y--P--F--T--D--R--A--L--A--H--N--L--L--V--K--A--E
2341   AGCCAAAGTCACCCCGGGACGCCCTCAAGGTGGGCGGCCCCAGTGCCGAGTGCCCCTTTG   2400
       --P--K--S--P--R--D--A--L--K--V--G--G--P--S--A--E--C--P--F--D
2401   ATCTCACCACCAAGCCCAAAGACGTGAAGCCCATCCTGCCCATGCCCAAGGGCCCCTCGG   2460
       --L--T--T--K--P--K--D--V--K--P--I--L--P--M--P--K--G--P--S--A
2461   CCCCCGCATCCGGCGAGGAGCAGCCGCTGGACCTGAGCATCGGCAGCCGGGCCCGTGCCA   2520
       --P--A--S--G--E--E--Q--P--L--D--L--S--I--G--S--R--A--R--A--S
2521   GCCAAAACGGCGGCGGGCGGGAGCCCCGCAAGAACCACGTCTATGGGGAACGCAAGCTGG   2580
       --Q--N--G--G--G--R--E--P--R--K--N--H--V--Y--G--E--R--K--L--G
2581   GCGCCGGCGAGGGGCTGCCCCAGGTGTGCCCGGCGCGGATGCCCCAGCAGCCCCCGCTCC   2640
       --A--G--E--G--L--P--Q--V--C--P--A--R--M--P--Q--Q--P--P--L--H
2641   ACTACGCCAAGCCCTCGCCCTTCTTCATGGACCCCATCTACAGGGTAGAAAAGCGGAAGG   2700
       --Y--A--K--P--S--P--F--F--M--D--P--I--Y--R--V--E--K--R--K--V
2701   TCACAGACCCCGTGGGAGCCCTGAAGGAGAAGTACCTGCGGCCGTCCCCGCTGCTCTTCC   2760
       --T--D--P--V--G--A--L--K--E--K--Y--L--R--P--S--P--L--L--F--H
2761   ACCCCCAGATGTCAGCCATAGAGACCATGACAGAGAAGCTGGAGAGCTTTGCAGCCATGA   2820
       --P--Q--M--S--A--I--E--T--M--T--E--K--L--E--S--F--A--A--M--K
2821   AGGCGGACTCGGGCAGCTCCCTGCAGCCCCTCCCCCACCACCCCTTCAACTTCCGGTCCC   2880
       --A--D--S--G--S--S--L--Q--P--L--P--H--H--P--F--N--F--R--S--P
2881   CACCCCCAACGCTCTCCGACCCCATCCTCAGGAAGGGCAAGGAGCGATACACGTGCAGGT   2940
       --P--P--T--L--S--D--P--I--L--R--K--G--K--E--R--Y--T--C--R--Y
2941   ACTGTGGGAAGATCTTCCCCAGATCAGCCAATCTCACCAGACACCTGAGGACGCACACTG   3000
       --C--G--K--I--F--P--R--S--A--N--L--T--R--H--L--R--T--H--T--G
3001   GGGAGCAGCCGTACAGGTGTAAGTACTGCGACCGCTCCTTCAGCATCTCTTCGAACCTCC   3060
       --E--Q--P--Y--R--C--K--Y--C--D--R--S--F--S--I--S--S--N--L--Q
3061   AGCGGCACGTCCGGAACATCCACAACAAGGAGAAGCCTTTCAAGTGCCACCTGTGCAACC   3120
       --R--H--V--R--N--I--H--N--K--E--K--P--F--K--C--H--L--C--N--R
3121   GCTGCTTCGGGCAGCAGACCAACCTGGACCGGCACCTCAAGAAGCACGAGCACGAGAACG   3180
       --C--F--G--Q--Q--T--N--L--D--R--H--L--K--K--H--E--H--E--N--A
3181   CACCAGTGAGCCAGCACCCCGGGGTCCTCACGAACCACCTGGGGACCAGCGCGTCCTCTC   3240
       --P--V--S--Q--H--P--G--V--L--T--N--H--L--G--T--S--A--S--S--P
3241   CCACCTCAGAGTCGGACAACCACGCACTTTTAGACGAGAAAGAAGACTCTTATTTCTCGG   3300
       --T--S--E--S--D--N--H--A--L--L--D--E--K--E--D--S--Y--F--S--E
3301   AAATCAGAAACTTTATTGCCAATAGTGAGATGAACCAAGCATCAACGCGAACAGAGAAAC   3360
       --I--R--N--F--I--A--N--S--E--M--N--Q--A--S--T--R--T--E--K--R
3361   GGGCGGACATGCAGATCGTGGACGGCAGTGCCCAGTGTCCAGGCCTAGCCAGTGAGAAGC   3420
       --A--D--M--Q--I--V--D--G--S--A--Q--C--P--G--L--A--S--E--K--Q
3421   AGGAGGACGTGGAGGAGGAGGACGACGATGACCTGGAGGAGGACGATGAGGACAGCCTGG   3480
       --E--D--V--E--E--E--D--D--D--D--L--E--E--D--D--E--D--S--L--A
3481   CCGGGAAGTCGCAGGATGACACCGTGTCCCCCGCACCCGAGCCCCAGGCCGCCTACGAGG   3540
       --G--K--S--Q--D--D--T--V--S--P--A--P--E--P--Q--A--A--Y--E--D
3541   ATGAGGAGGATGAGGAGCCAGCCGCCTCCCTGGCCGTGGGCTTTGACCACACCCGAAGGT   3600
       --E--E--D--E--E--P--A--A--S--L--A--V--G--F--D--H--T--R--R--C
3601   GTGCTGAGGACCACGAAGGCGGTCTGTTAGCTTTGGAGCCGATGCCGACTTTTGGGAAGG   3660
       --A--E--D--H--E--G--G--L--L--A--L--E--P--M--P--T--F--G--K--G
3661   GGCTGGACCTCCGCAGAGCAGCTGAGGAAGCATTTGAAGTTAAAGATGTGCTTAATTCCA   3720
       --L--D--L--R--R--A--A--E--E--A--F--E--V--K--D--V--L--N--S--T
3721   CCTTAGATTCTGAGGCTTTAAAACATACACTGTGCAGGCAGGCTAAGAACCAGGCATATG   3780
       --L--D--S--E--A--L--K--H--T--L--C--R--Q--A--K--N--Q--A--Y--A
3781   CAATGATGCTGTCCCTTTCCGAAGACACTCCTCTCCACACCCCCTCCCAGGGTTCTCTGG   3840
       --M--M--L--S--L--S--E--D--T--P--L--H--T--P--S--Q--G--S--L--D
3841   ACGCTTGGTTGAAGGTCACTGGAGCCACGTCGGAGTCTGGAGCATTTCACCCCATCAACC   3900
       --A--W--L--K--V--T--G--A--T--S--E--S--G--A--F--H--P--I--N--H
3901   ACCTCTGAcgggctgggcagccgggggccggtggccagagcgagggcaccagccacgaag   3960
       --L--***....................................................
3961   gacggaggcgggcggggccccggagaaccctgtccctgcgtgtggccactcctcagcatc   4020
       ............................................................
4021   ctccccacccaccatggttcattccgacttttccaatggaaactcagatcccaaaagtcc   4080
       ............................................................
4081   ctaaagcagtcgtagagtctcaccatctccaaggattggtcttgagaacactgttcagtg   4140
       ............................................................
4141   acggccatgcaggtggccgtccaaagacagccaacggagctgcctcgcagaatcagccag   4200
       ............................................................
4201   tgggcaggtggacgctctgctgagacagaagctggtggccactgccgggtgcccgcgtgg   4260
       ............................................................
4261   ggtcgcggaagggaatggatagactggtgtgctcaaaagagagagatcactcaaatgatt   4320
       ............................................................
4321   tttataatgaaatgacaagaataacccttttggtaaccgtattgactgcagagtctattt   4380
       ............................................................
4381   aagcatgtggttttaaaaatagacagtattttttaaaaatcaaaaaatgacttgcaaatt   4440
       ............................................................
4441   gttttttaaaagtaattttgcattgctttgaaatttgagctcatttgcaaacccgagtct   4500
       ............................................................
4501   gcctgggaacccgcactgtgcctgggtgtattctttatactgtagataatggagaaattt   4560
       ............................................................
4561   tctatctctgtccctatttgtataagccaaggtgatgctgggtgccccgaggcagaacaa   4620
       ............................................................
4621   gaggcgcggggccacacccgtgaaccatgcagacggccgaagaagtcttaggcagggcgc   4680
       ............................................................
4681   cctgggctgcaggcctgcccgaggctgggatgggaagtgtgcctgccctcgtgtgacatg   4740
       ............................................................
4741   gaattggtgtcaggaccgccacgtggccttcagaggaatccacaggtccccacccaagat   4800
       ............................................................
4801   ccctcaattatatggggaagtcgagggcctgtggcttggatccgccatgcagagatgtgg   4860
       ............................................................
4861   ccgggcacccatcttccttccctcctctgtccctgcctcggccaccccacgcgggaaccc   4920
       ............................................................
4921   agcgccgtcctctgaaggcagggccttggccacgtcctgggtctcccacctcccacctga   4980
       ............................................................
4981   ccccagcggctccggtgtcctccacgtggctgccctggggagcaatcccagcggatcgct   5040
       ............................................................
5041   ccgggccaccaagccgcacctgtgcctgagactccggatggacgacacagtcgtcacgtc   5100
       ............................................................
5101   gctcttcctgcgggttcttggcgagacacagcttgagaacagaagggcgtcgggggaacc   5160
       ............................................................
5161   tgccgcaaggagcagagacagcacagccccccgggcccagccgcctccctctcttgggac   5220
       ............................................................
5221   gcaacttcttccccactcggatgggctttaaattattcccataggggccaatttcaaata   5280
       ............................................................
5281   ataatttttttccctgatggaatttaccttaatctgtatataacttgtaattttttctaa   5340
       ............................................................
5341   ttcatttcttttcttattttatttcctccttaacagtatttttggcattagacattctta   5400
       ............................................................
5401   ttgtgaagaaataatgttaatataagtatctggtgaaggaccaaaaccgtgtgataaggt   5460
       ............................................................
5461   tgtgtgtcgtgtgggagtggggcgattttttatgtgccaaatacccccgtcccccccatg   5520
       ............................................................
5521   aatcctgctgtccctgctgccgtttaccagacaatcatatgtttttgttaaatttgcgtt   5580
       ............................................................
5581   tcagttacatttgcatttaagacaagtgttctatttatttcttgtattgtttggaagaaa   5640
       ............................................................
5641   aaatgatgatagagtcccaaaaagaagagaaaaaaaatgcccaagttgccctttaaaaaa   5700
       ............................................................
5701   aaagagcgtaaatacaaacaggagtggtgcaagccgccttggtgtgggtttgtgtcacgt   5760
       ............................................................
5761   gtggacatctcctcaggctttgtgtcacgcgtggacatctcctcaggctgtccccagcgg   5820
       ............................................................
5821   tgacgggaggtgtcctggctgctccaggacaaaagacaatcgtctctgtgggtgccgggt   5880
       ............................................................
5881   ggtccaggcttgcactgaagacgtgccacggggaggctcctgcaggaggctcaacccgac   5940
       ............................................................
5941   ggatcacagtgaaagggattcctcccacgccagatctgcacaacgaggcaagacaggacc   6000
       ............................................................
6001   cacctgtgcgtgcgctggggccatggggtggccccgccggggcagcgggggagctgcctg   6060
       ............................................................
6061   cagaagagccagctggcgtgtcgggaaggatccaggatctgcaaacacaactgctcaggc   6120
       ............................................................
6121   cttctcacgcgtttccacaacatcccctgggtcagacccaccaggtaccccgtaggaatt   6180
       ............................................................
6181   tccagtttcccttgatctagatgggattcttataaaaattcaacctcagacataaacacc   6240
       ............................................................
6241   ccatttctgtaaacccaaattatatggtttcttctgcgaaagagtaaggtgtgtgctttt   6300
       ............................................................
6301   ttttttttgcaatatgaccccgtctctctgaagtgggacattcggacggatggagccctc   6360
       ............................................................
6361   agcgtgtcttttcagcaggagcagaaccgatgagagccgcccttaccgttggtctccgga   6420
       ............................................................
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